174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0430 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0430  hypothetical protein  100 
 
 		 403 aa  824    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.122087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  37.46 
 
 		 675 aa  186  5e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2751  cell surface protein  34.94 
 
 		 728 aa  182  1e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.270179  hitchhiker  0.0050065 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  36.39 
 
 		 560 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1578  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  32.56 
 
 		 448 aa  159  1e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.486208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  33.02 
 
 		 658 aa  155  9e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  32.63 
 
 		 581 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2844  hypothetical protein  33.23 
 
 		 1001 aa  151  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0777438  normal  0.0344466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3325  cell surface protein  35.94 
 
 		 938 aa  151  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00941994 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0834  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like  33.7 
 
 		 1202 aa  142  9e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00874286  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2845  cell surface protein  32.4 
 
 		 960 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.726454  normal  0.0327621 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0639  PKD domain-containing protein  30.84 
 
 		 769 aa  138  2e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.292646  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  32.18 
 
 		 669 aa  137  5e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0597  hypothetical protein  31.43 
 
 		 815 aa  136  8e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  31.64 
 
 		 679 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  30.9 
 
 		 713 aa  129  6e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2440  PKD  35.37 
 
 		 1042 aa  129  8.000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.120372  normal  0.562563 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1212  Ig domain-containing protein  31.2 
 
 		 1279 aa  129  9.000000000000001e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  30.65 
 
 		 685 aa  126  8.000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  31.85 
 
 		 668 aa  125  9e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  77.78 
 
 		 958 aa  125  9e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  39.82 
 
 		 387 aa  120  3e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1213  Ig domain-containing protein  27.09 
 
 		 1361 aa  119  9e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.406135  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1484  hypothetical protein  28.18 
 
 		 374 aa  114  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.481166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2671  Carbohydrate binding family 6  73.24 
 
 		 581 aa  114  3e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.684309 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  57.28 
 
 		 676 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  50.46 
 
 		 390 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  43.62 
 
 		 930 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2753  peptidase C1A papain  63.41 
 
 		 561 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.757043  normal  0.325796 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  47.01 
 
 		 391 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1812  PKD domain containing protein  60.76 
 
 		 787 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.466524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2441  PKD  31.17 
 
 		 996 aa  109  7.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000010419  normal  0.547756 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  54.26 
 
 		 579 aa  109  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  51.35 
 
 		 831 aa  108  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1796  PKD domain containing protein  56.96 
 
 		 848 aa  108  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0405  Carbohydrate binding family 6  68.18 
 
 		 749 aa  106  6e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.85643 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  45.67 
 
 		 343 aa  105  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  62.5 
 
 		 869 aa  105  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0125  hypothetical protein  30.98 
 
 		 379 aa  103  5e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00889143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2618  Carbohydrate binding family 6  71.43 
 
 		 522 aa  103  5e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0533616 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0494  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  59.26 
 
 		 171 aa  102  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0737  hypothetical protein  50.59 
 
 		 294 aa  100  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1007  periplasmic copper-binding  61.33 
 
 		 697 aa  101  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.525995  normal  0.505832 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1444  PKD domain containing protein  66.67 
 
 		 479 aa  100  5e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0493  Carbohydrate binding family 6  60.56 
 
 		 627 aa  99.8  7e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0736  hypothetical protein  53.57 
 
 		 298 aa  99.8  7e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1342  periplasmic copper-binding  53.93 
 
 		 919 aa  99.4  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0404  Carbohydrate binding family 6  63.64 
 
 		 468 aa  99  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.813596 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1686  periplasmic copper-binding  68.75 
 
 		 1056 aa  98.6  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2277  hypothetical protein  52.7 
 
 		 389 aa  97.1  5e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.244625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1008  periplasmic copper-binding  58.67 
 
 		 698 aa  97.1  5e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.291985 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  58.44 
 
 		 709 aa  96.3  9e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0859  PKD domain containing protein  44.55 
 
 		 488 aa  95.9  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  25.5 
 
 		 971 aa  95.1  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2292  hypothetical protein  58.9 
 
 		 110 aa  95.1  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.352852 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1469  Carbohydrate binding family 6  57.75 
 
 		 735 aa  95.1  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0894  periplasmic copper-binding  42.73 
 
 		 433 aa  92  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2209  Carbohydrate binding family 6  38.71 
 
 		 739 aa  88.6  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.858511  normal  0.120589 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0648  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  51.39 
 
 		 547 aa  87.8  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.201749  normal  0.0862091 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1795  hypothetical protein  60.94 
 
 		 361 aa  87.4  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.242338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  57.14 
 
 		 522 aa  83.6  0.000000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2459  beta-lactamase domain protein  48.57 
 
 		 479 aa  82.4  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  27.58 
 
 		 819 aa  80.1  0.00000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0492  hypothetical protein  30.51 
 
 		 195 aa  75.9  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.652654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3623  hypothetical protein  26.91 
 
 		 514 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3046  hypothetical protein  36.36 
 
 		 528 aa  70.9  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3727  hypothetical protein  24.23 
 
 		 331 aa  70.1  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0495  hypothetical protein  39.66 
 
 		 126 aa  67  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0909  PKD domain-containing protein  53.33 
 
 		 517 aa  67  0.0000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0741281  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0696  protein of unknown function DUF839  41.18 
 
 		 887 aa  64.7  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.663766  normal  0.391119 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3268  hypothetical protein  23.72 
 
 		 329 aa  64.3  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0855187 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0626  protein of unknown function DUF839  35.63 
 
 		 883 aa  63.5  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3706  hypothetical protein  24.92 
 
 		 771 aa  62.8  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0625  protein of unknown function DUF839  37.68 
 
 		 884 aa  61.2  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0894  hypothetical protein  40.98 
 
 		 472 aa  60.1  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.7858  normal  0.169635 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2975  TolB protein  25.48 
 
 		 443 aa  59.7  0.00000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.508751  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1456  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.71 
 
 		 594 aa  58.9  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.661246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1833  periplasmic copper-binding  37.93 
 
 		 595 aa  57.4  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107364 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3513  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  22.8 
 
 		 407 aa  55.1  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000266488  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4751  translocation protein TolB  32.08 
 
 		 450 aa  54.7  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  44.26 
 
 		 1531 aa  54.3  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0727  TolB domain-containing protein  28.91 
 
 		 437 aa  53.9  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.162759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1311  translocation protein TolB  34.41 
 
 		 444 aa  53.9  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1812  translocation protein TolB  32.08 
 
 		 449 aa  53.1  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.431319  normal  0.360787 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2717  translocation protein TolB  32.69 
 
 		 450 aa  53.1  0.000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.599754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4147  translocation protein TolB  32.08 
 
 		 449 aa  53.1  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003913  TolB protein precursor  30.09 
 
 		 442 aa  53.1  0.000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.26371  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3512  translocation protein TolB  31.73 
 
 		 450 aa  52.8  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0278  WD40 domain-containing protein  28.81 
 
 		 463 aa  52.8  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00000605867  unclonable  0.0000100324 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6881  translocation protein TolB  31.13 
 
 		 462 aa  51.6  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464057 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0588  WD40 domain protein beta Propeller  26.32 
 
 		 439 aa  50.8  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000301748  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2868  translocation protein TolB  23.71 
 
 		 430 aa  50.8  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000034107  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1397  translocation protein TolB  23.71 
 
 		 430 aa  50.8  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000187657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2956  translocation protein TolB  23.71 
 
 		 430 aa  50.8  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000231645  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4016  WD40 domain protein beta Propeller  32 
 
 		 169 aa  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.392857 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2360  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  28.81 
 
 		 446 aa  50.1  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.28939 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1229  translocation protein TolB  29.75 
 
 		 424 aa  50.1  0.00008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.910184  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01610  translocation protein TolB  29.2 
 
 		 442 aa  49.7  0.00009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3632  tolB protein, putative  29.2 
 
 		 441 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000231281  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1429  translocation protein TolB  30.84 
 
 		 450 aa  49.3  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000134537  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>