254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2074 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  100 
 
 		 522 aa  1045    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  44.64 
 
 		 831 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  40.46 
 
 		 579 aa  371  1e-101  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  43.07 
 
 		 668 aa  351  2e-95  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  38 
 
 		 676 aa  323  4e-87  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  51.38 
 
 		 390 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  51.34 
 
 		 930 aa  282  1e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  51.86 
 
 		 346 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  49.53 
 
 		 387 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  47.44 
 
 		 627 aa  270  4e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  51.47 
 
 		 930 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  49.32 
 
 		 709 aa  253  5.000000000000001e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  45.93 
 
 		 752 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  44.58 
 
 		 391 aa  228  3e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  52.77 
 
 		 343 aa  224  2e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1601  NHL repeat-containing protein  46.34 
 
 		 491 aa  216  8e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0447928  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  40.18 
 
 		 1293 aa  211  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2818  hypothetical protein  40.75 
 
 		 392 aa  205  1e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.587259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1167  hypothetical protein  38.64 
 
 		 588 aa  203  7e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.0121867 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  39.01 
 
 		 1079 aa  176  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  36.89 
 
 		 1146 aa  174  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0477  NHL repeat-containing protein  41.47 
 
 		 525 aa  169  1e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.176502 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  36.76 
 
 		 1163 aa  169  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  37.99 
 
 		 786 aa  164  3e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3475  NHL repeat protein  35.84 
 
 		 1140 aa  158  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2753  peptidase C1A papain  44.29 
 
 		 561 aa  156  1e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.757043  normal  0.325796 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2265  NHL repeat-containing protein  36.19 
 
 		 963 aa  143  8e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.397951  normal  0.439164 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1869  NHL repeat containing protein  32.48 
 
 		 307 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1379  NHL repeat-containing protein  32.46 
 
 		 319 aa  140  6e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0368543 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1358  NHL repeat containing protein  37.04 
 
 		 646 aa  139  8.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.967304 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2779  hypothetical protein  33.23 
 
 		 1051 aa  139  1e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3865  NHL repeat-containing protein  33.56 
 
 		 1177 aa  139  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  38.72 
 
 		 2296 aa  137  5e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  30.5 
 
 		 1750 aa  132  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1359  NHL repeat containing protein  33.33 
 
 		 439 aa  131  3e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3225  NHL repeat-containing protein  33.33 
 
 		 365 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  32.76 
 
 		 1292 aa  130  6e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  32.51 
 
 		 1030 aa  129  1.0000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3109  NHL repeat containing protein  33.33 
 
 		 355 aa  127  6e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  30.99 
 
 		 1351 aa  126  7e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0258  NHL repeat-containing protein  34.35 
 
 		 343 aa  126  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  33.88 
 
 		 1026 aa  126  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4088  serine/threonine protein kinase  31.61 
 
 		 850 aa  124  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  32.59 
 
 		 1130 aa  122  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1869  NHL repeat-containing protein  32.25 
 
 		 353 aa  120  7e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0563587 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7287  serine/threonine protein kinase  29.38 
 
 		 892 aa  119  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0443497  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4135  NHL repeat-containing protein  33 
 
 		 368 aa  118  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0355  NHL repeat-containing protein  33.33 
 
 		 1030 aa  118  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64892  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0357  NHL repeat containing protein  31.86 
 
 		 700 aa  117  5e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  3.18335e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3159  NHL repeat containing protein  29.89 
 
 		 372 aa  117  5e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2137  hypothetical protein  30.63 
 
 		 322 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.982688 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1920  NHL repeat-containing protein  29.39 
 
 		 343 aa  114  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00542747  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0422  hypothetical protein  28.19 
 
 		 1068 aa  114  6e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.248115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3838  NHL repeat-containing protein  32.12 
 
 		 360 aa  113  7.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000127539  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10949  transmembrane serine/threonine-protein kinase D pknD  34.84 
 
 		 664 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  32.4 
 
 		 1834 aa  111  3e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1047  fibronectin type III domain-containing protein  28.44 
 
 		 903 aa  111  3e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0859  PKD domain containing protein  63.01 
 
 		 488 aa  110  9.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0742  NHL repeat-containing protein  30.08 
 
 		 355 aa  109  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.150031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4124  NHL repeat-containing protein  33.02 
 
 		 359 aa  109  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.640446 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2755  NHL repeat-containing protein  29.77 
 
 		 347 aa  108  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2063  NHL repeat containing protein  34.63 
 
 		 652 aa  108  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0408  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  31.67 
 
 		 693 aa  108  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.785735  normal  0.15039 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1788  NHL repeat-containing protein  30.15 
 
 		 354 aa  105  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.565326  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3465  copper amine oxidase domain protein  35.53 
 
 		 447 aa  105  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0923  NHL repeat-containing protein  32.11 
 
 		 379 aa  105  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1796  PKD domain containing protein  63.38 
 
 		 848 aa  105  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4063  NHL repeat-containing protein  29.85 
 
 		 1763 aa  104  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.512891  normal  0.666526 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1132  hypothetical protein  30.22 
 
 		 323 aa  105  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2209  Carbohydrate binding family 6  64.1 
 
 		 739 aa  104  4e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.858511  normal  0.120589 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1812  PKD domain containing protein  54.76 
 
 		 787 aa  104  4e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.466524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0746  NHL repeat-containing protein  30.77 
 
 		 418 aa  103  6e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4004  ABC transporter related protein  27.27 
 
 		 639 aa  103  6e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.774502  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2897  NHL repeat-containing protein  27.65 
 
 		 363 aa  103  7e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.645365  normal  0.499228 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2150  hypothetical protein  28.86 
 
 		 321 aa  103  8e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.909302 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2618  Carbohydrate binding family 6  67.65 
 
 		 522 aa  103  8e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0533616 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2671  Carbohydrate binding family 6  52.33 
 
 		 581 aa  102  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.684309 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2135  hypothetical protein  29.86 
 
 		 326 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2282  NHL repeat containing protein  33.07 
 
 		 373 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.11837 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1444  PKD domain containing protein  56.25 
 
 		 479 aa  102  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2272  glycoside hydrolase family 26  32.04 
 
 		 711 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.738347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2758  NHL repeat-containing protein  31.34 
 
 		 396 aa  101  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  58.9 
 
 		 869 aa  100  5e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3222  NHL repeat-containing protein  29.76 
 
 		 412 aa  99.4  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3162  NHL repeat containing protein  28.57 
 
 		 395 aa  99.8  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  65.08 
 
 		 958 aa  99  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7086  serine/threonine protein kinase  30.29 
 
 		 732 aa  99  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0370  Fibronectin type III domain protein  32.13 
 
 		 841 aa  99  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.800383  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1050  NHL repeat-containing protein  34.76 
 
 		 318 aa  97.8  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.400914  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1056  NHL repeat-containing protein  27.97 
 
 		 328 aa  97.4  5e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1469  Carbohydrate binding family 6  60.56 
 
 		 735 aa  97.4  6e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0737  hypothetical protein  56.76 
 
 		 294 aa  95.5  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3112  NHL repeat containing protein  29.68 
 
 		 436 aa  94.7  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0404  Carbohydrate binding family 6  42.59 
 
 		 468 aa  94.7  4e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.813596 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0617  NHL repeat-containing protein  29.21 
 
 		 361 aa  94.4  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0567002  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0626  protein of unknown function DUF839  35.9 
 
 		 883 aa  94.4  5e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1795  hypothetical protein  51.11 
 
 		 361 aa  93.6  8e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.242338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0625  protein of unknown function DUF839  35.57 
 
 		 884 aa  92.8  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0405  Carbohydrate binding family 6  54.55 
 
 		 749 aa  93.2  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.85643 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0736  hypothetical protein  60.29 
 
 		 298 aa  93.2  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>