57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2753 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_2753  peptidase C1A papain  100 
 
 
561 aa  1139    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.757043  normal  0.325796 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2671  Carbohydrate binding family 6  42.88 
 
 
581 aa  429  1e-119  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.684309 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1756  Carbohydrate binding family 6  48.54 
 
 
930 aa  344  2.9999999999999997e-93  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.127893  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1007  periplasmic copper-binding  46.31 
 
 
697 aa  319  9e-86  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.525995  normal  0.505832 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1008  periplasmic copper-binding  44.57 
 
 
698 aa  316  7e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.291985 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3130  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  46.02 
 
 
1085 aa  246  8e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.446766  hitchhiker  0.000357529 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  44.29 
 
 
522 aa  156  9e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  40.41 
 
 
831 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  39.26 
 
 
579 aa  124  3e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  56.78 
 
 
958 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0626  protein of unknown function DUF839  34.13 
 
 
883 aa  117  6e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0430  hypothetical protein  63.41 
 
 
403 aa  111  3e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.122087  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0404  Carbohydrate binding family 6  50 
 
 
468 aa  110  5e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.813596 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1444  PKD domain containing protein  60.98 
 
 
479 aa  108  3e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  73.44 
 
 
676 aa  107  6e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0696  protein of unknown function DUF839  28.45 
 
 
887 aa  106  1e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.663766  normal  0.391119 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1796  PKD domain containing protein  71.43 
 
 
848 aa  106  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  73.02 
 
 
668 aa  106  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  74.6 
 
 
387 aa  105  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0405  Carbohydrate binding family 6  47.93 
 
 
749 aa  104  4e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.85643 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2618  Carbohydrate binding family 6  69.23 
 
 
522 aa  103  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0533616 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0859  PKD domain containing protein  68.25 
 
 
488 aa  102  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1812  PKD domain containing protein  69.84 
 
 
787 aa  102  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.466524  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0493  Carbohydrate binding family 6  69.84 
 
 
627 aa  102  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1686  periplasmic copper-binding  59.76 
 
 
1056 aa  100  7e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482609  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0625  protein of unknown function DUF839  32.73 
 
 
884 aa  100  8e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0737  hypothetical protein  66.67 
 
 
294 aa  99.8  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1469  Carbohydrate binding family 6  66.67 
 
 
735 aa  100  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  68.25 
 
 
391 aa  99  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  66.67 
 
 
930 aa  99  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  65.08 
 
 
869 aa  97.8  5e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0736  hypothetical protein  66.67 
 
 
298 aa  97.1  8e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2277  hypothetical protein  61.9 
 
 
389 aa  94.7  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.244625  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1342  periplasmic copper-binding  63.49 
 
 
919 aa  94.7  4e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2209  Carbohydrate binding family 6  60.32 
 
 
739 aa  94  7e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.858511  normal  0.120589 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  64.62 
 
 
709 aa  93.6  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  63.49 
 
 
390 aa  93.2  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1795  hypothetical protein  68.33 
 
 
361 aa  91.3  4e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.242338  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2292  hypothetical protein  60.94 
 
 
110 aa  90.5  7e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.352852 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  71.7 
 
 
343 aa  90.5  8e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0894  periplasmic copper-binding  60.32 
 
 
433 aa  86.7  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0648  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  57.14 
 
 
547 aa  85.9  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.201749  normal  0.0862091 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  34.63 
 
 
1531 aa  82.4  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2459  beta-lactamase domain protein  41.12 
 
 
479 aa  82.4  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2499  PKD  34.17 
 
 
374 aa  72  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00083014  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0894  hypothetical protein  43.59 
 
 
472 aa  71.2  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.7858  normal  0.169635 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3046  hypothetical protein  49.21 
 
 
528 aa  69.7  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1456  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.5 
 
 
594 aa  69.7  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.661246  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2498  PKD  31.3 
 
 
465 aa  68.2  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.0000170724  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3047  hypothetical protein  29.92 
 
 
325 aa  63.5  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1457  hypothetical protein  33.61 
 
 
170 aa  62.4  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1833  periplasmic copper-binding  45.76 
 
 
595 aa  60.8  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.107364 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0627  hypothetical protein  29.29 
 
 
275 aa  48.9  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0213  peptidase C1A papain  23.15 
 
 
814 aa  47.8  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.590308 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0431  Carbohydrate binding family 6  29.31 
 
 
966 aa  46.6  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.174739  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1863  hypothetical protein  27.51 
 
 
409 aa  45.1  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0988  glycoside hydrolase family 10  34.92 
 
 
975 aa  44.7  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.661558  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>