208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1395 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  100 
 
 		 391 aa  782    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  47.36 
 
 		 390 aa  324  2e-87  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  46.84 
 
 		 668 aa  322  7e-87  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  46.7 
 
 		 387 aa  318  2e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  45.77 
 
 		 676 aa  296  3e-79  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  45.19 
 
 		 343 aa  276  6e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  47.19 
 
 		 831 aa  263  3e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  46.95 
 
 		 346 aa  250  3e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  43.03 
 
 		 579 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  41.71 
 
 		 930 aa  233  3e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  44.52 
 
 		 709 aa  232  9e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  40.85 
 
 		 627 aa  224  3e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  41.4 
 
 		 752 aa  223  3e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  44.58 
 
 		 522 aa  220  3e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1601  NHL repeat-containing protein  41.24 
 
 		 491 aa  207  4e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0447928  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  37.89 
 
 		 1293 aa  191  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2818  hypothetical protein  36.05 
 
 		 392 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.587259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  39.39 
 
 		 930 aa  187  2e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1167  hypothetical protein  33.57 
 
 		 588 aa  164  3e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.0121867 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  35.67 
 
 		 786 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0477  NHL repeat-containing protein  31.62 
 
 		 525 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.176502 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  42.78 
 
 		 1146 aa  135  9e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1359  NHL repeat containing protein  32 
 
 		 439 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  42.5 
 
 		 1163 aa  133  5e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1358  NHL repeat containing protein  34.31 
 
 		 646 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.967304 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1379  NHL repeat-containing protein  33.33 
 
 		 319 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0368543 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0355  NHL repeat-containing protein  32.32 
 
 		 1030 aa  129  9.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64892  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  36.05 
 
 		 1079 aa  128  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3159  NHL repeat containing protein  31.14 
 
 		 372 aa  126  7e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0258  NHL repeat-containing protein  32.42 
 
 		 343 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  28.02 
 
 		 1351 aa  120  3.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0357  NHL repeat containing protein  33.33 
 
 		 700 aa  119  7.999999999999999e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  3.18335e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  30.33 
 
 		 1030 aa  119  7.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  34.28 
 
 		 2296 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1869  NHL repeat-containing protein  35.07 
 
 		 353 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0563587 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  30.99 
 
 		 1750 aa  117  3e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  30.75 
 
 		 1026 aa  116  7.999999999999999e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1342  periplasmic copper-binding  65.12 
 
 		 919 aa  116  7.999999999999999e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3109  NHL repeat containing protein  35.05 
 
 		 355 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0493  Carbohydrate binding family 6  65.91 
 
 		 627 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1869  NHL repeat containing protein  36.69 
 
 		 307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3475  NHL repeat protein  34.92 
 
 		 1140 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1469  Carbohydrate binding family 6  62.65 
 
 		 735 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4135  NHL repeat-containing protein  31.72 
 
 		 368 aa  112  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2779  hypothetical protein  28.9 
 
 		 1051 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2209  Carbohydrate binding family 6  56.57 
 
 		 739 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.858511  normal  0.120589 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0737  hypothetical protein  69.44 
 
 		 294 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0430  hypothetical protein  47.01 
 
 		 403 aa  111  3e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.122087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0736  hypothetical protein  69.44 
 
 		 298 aa  109  6e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0894  periplasmic copper-binding  56.84 
 
 		 433 aa  109  7.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1920  NHL repeat-containing protein  28.67 
 
 		 343 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00542747  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1788  NHL repeat-containing protein  31.19 
 
 		 354 aa  108  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.565326  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4124  NHL repeat-containing protein  31.68 
 
 		 359 aa  106  9e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.640446 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0742  NHL repeat-containing protein  29.43 
 
 		 355 aa  105  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.150031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  68.57 
 
 		 958 aa  105  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2897  NHL repeat-containing protein  27.84 
 
 		 363 aa  104  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.645365  normal  0.499228 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2758  NHL repeat-containing protein  31.93 
 
 		 396 aa  105  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4088  serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 		 850 aa  105  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2755  NHL repeat-containing protein  31.05 
 
 		 347 aa  104  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2265  NHL repeat-containing protein  31.46 
 
 		 963 aa  103  7e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.397951  normal  0.439164 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3225  NHL repeat-containing protein  32.14 
 
 		 365 aa  102  9e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0746  NHL repeat-containing protein  31.63 
 
 		 418 aa  102  9e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0617  NHL repeat-containing protein  30.84 
 
 		 361 aa  102  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0567002  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1796  PKD domain containing protein  56.41 
 
 		 848 aa  100  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2671  Carbohydrate binding family 6  36.57 
 
 		 581 aa  100  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.684309 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3838  NHL repeat-containing protein  28 
 
 		 360 aa  100  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000127539  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1812  PKD domain containing protein  57.89 
 
 		 787 aa  99.8  7e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.466524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2753  peptidase C1A papain  68.25 
 
 		 561 aa  99.4  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.757043  normal  0.325796 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7287  serine/threonine protein kinase  26.81 
 
 		 892 aa  99.4  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0443497  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0422  hypothetical protein  27.1 
 
 		 1068 aa  98.2  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.248115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0405  Carbohydrate binding family 6  61.43 
 
 		 749 aa  98.2  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.85643 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0859  PKD domain containing protein  64.29 
 
 		 488 aa  97.4  4e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4063  NHL repeat-containing protein  27.96 
 
 		 1763 aa  97.1  5e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.512891  normal  0.666526 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3162  NHL repeat containing protein  33.33 
 
 		 395 aa  96.7  6e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2885  NHL repeat-containing protein  29.83 
 
 		 888 aa  95.5  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2277  hypothetical protein  54.79 
 
 		 389 aa  95.9  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.244625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2137  hypothetical protein  36.69 
 
 		 322 aa  95.9  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.982688 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2618  Carbohydrate binding family 6  63.24 
 
 		 522 aa  95.5  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0533616 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0256  NHL repeat-containing protein  26.98 
 
 		 384 aa  94.7  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2914  NHL repeat-containing protein  33.05 
 
 		 315 aa  94.7  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.76 
 
 		 1292 aa  94.4  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0923  NHL repeat-containing protein  30.41 
 
 		 379 aa  94.7  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3865  NHL repeat-containing protein  35.83 
 
 		 1177 aa  94.4  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3222  NHL repeat-containing protein  29.52 
 
 		 412 aa  94  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  26.35 
 
 		 1130 aa  93.6  5e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0556  NHL repeat-containing protein  29.92 
 
 		 899 aa  92  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10949  transmembrane serine/threonine-protein kinase D pknD  31.11 
 
 		 664 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2150  hypothetical protein  35.23 
 
 		 321 aa  91.7  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.909302 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1050  NHL repeat-containing protein  34.32 
 
 		 318 aa  91.7  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.400914  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3465  copper amine oxidase domain protein  32.35 
 
 		 447 aa  91.7  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1795  hypothetical protein  59.72 
 
 		 361 aa  90.5  4e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.242338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  52.78 
 
 		 869 aa  90.9  4e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1047  fibronectin type III domain-containing protein  28.57 
 
 		 903 aa  89.7  7e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1444  PKD domain containing protein  58.9 
 
 		 479 aa  90.1  7e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0648  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  54.17 
 
 		 547 aa  89  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.201749  normal  0.0862091 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2135  hypothetical protein  33.14 
 
 		 326 aa  89.4  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2292  hypothetical protein  51.39 
 
 		 110 aa  89  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.352852 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2282  NHL repeat containing protein  27.7 
 
 		 373 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.11837 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1132  hypothetical protein  34.5 
 
 		 323 aa  88.6  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3058  NHL repeat protein  28.68 
 
 		 404 aa  88.2  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>