170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3225 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3225  NHL repeat-containing protein  100 
 
 		 365 aa  746    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2755  NHL repeat-containing protein  50 
 
 		 347 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3159  NHL repeat containing protein  45.79 
 
 		 372 aa  292  7e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3109  NHL repeat containing protein  44.41 
 
 		 355 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0258  NHL repeat-containing protein  41.78 
 
 		 343 aa  238  1e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1788  NHL repeat-containing protein  37.43 
 
 		 354 aa  212  7e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.565326  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0742  NHL repeat-containing protein  39.22 
 
 		 355 aa  207  2e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.150031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1920  NHL repeat-containing protein  34.41 
 
 		 343 aa  200  3e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00542747  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4124  NHL repeat-containing protein  35.21 
 
 		 359 aa  193  3e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.640446 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1869  NHL repeat-containing protein  36.67 
 
 		 353 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0563587 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2897  NHL repeat-containing protein  33.33 
 
 		 363 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.645365  normal  0.499228 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3838  NHL repeat-containing protein  34.38 
 
 		 360 aa  169  6e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000127539  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0617  NHL repeat-containing protein  33.64 
 
 		 361 aa  154  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0567002  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4135  NHL repeat-containing protein  31.52 
 
 		 368 aa  151  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  36.95 
 
 		 346 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0256  NHL repeat-containing protein  32.29 
 
 		 384 aa  143  5e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0923  NHL repeat-containing protein  30.56 
 
 		 379 aa  139  6e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2758  NHL repeat-containing protein  30.67 
 
 		 396 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0746  NHL repeat-containing protein  31.19 
 
 		 418 aa  134  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  33.33 
 
 		 522 aa  130  3e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  29.6 
 
 		 930 aa  130  3e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  31.73 
 
 		 831 aa  130  3e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1601  NHL repeat-containing protein  33.08 
 
 		 491 aa  130  5.0000000000000004e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0447928  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  31 
 
 		 676 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  36.74 
 
 		 668 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  31.02 
 
 		 579 aa  125  1e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  37.21 
 
 		 343 aa  120  3e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3162  NHL repeat containing protein  27.25 
 
 		 395 aa  119  6e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  39.23 
 
 		 1293 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1379  NHL repeat-containing protein  34.58 
 
 		 319 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0368543 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  29.17 
 
 		 387 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3112  NHL repeat containing protein  25.91 
 
 		 436 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3222  NHL repeat-containing protein  29.32 
 
 		 412 aa  114  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  29.5 
 
 		 752 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1167  hypothetical protein  31.79 
 
 		 588 aa  108  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.0121867 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  30.66 
 
 		 390 aa  108  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  35.34 
 
 		 627 aa  107  4e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  30.15 
 
 		 709 aa  105  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  32.14 
 
 		 391 aa  102  7e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0355  NHL repeat-containing protein  32.42 
 
 		 1030 aa  101  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64892  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  34.21 
 
 		 1163 aa  99.4  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2282  NHL repeat containing protein  33.33 
 
 		 373 aa  97.1  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.11837 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1047  fibronectin type III domain-containing protein  31.87 
 
 		 903 aa  96.7  5e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1836  NHL repeat-containing protein  32.05 
 
 		 906 aa  95.9  9e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2885  NHL repeat-containing protein  36.32 
 
 		 888 aa  95.1  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  32.63 
 
 		 1146 aa  94.7  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3865  NHL repeat-containing protein  29.48 
 
 		 1177 aa  94.4  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  34.34 
 
 		 930 aa  94  4e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0556  NHL repeat-containing protein  31.56 
 
 		 899 aa  93.2  7e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0477  NHL repeat-containing protein  29.96 
 
 		 525 aa  90.1  5e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.176502 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2914  NHL repeat-containing protein  31.05 
 
 		 898 aa  89.4  9e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0718376  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4004  ABC transporter related protein  31.74 
 
 		 639 aa  89.4  9e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.774502  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2818  hypothetical protein  30 
 
 		 392 aa  89  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.587259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  29.2 
 
 		 786 aa  88.6  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3475  NHL repeat protein  30.65 
 
 		 1140 aa  87.8  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2137  hypothetical protein  30.84 
 
 		 322 aa  87  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.982688 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2816  NHL repeat-containing protein  29.97 
 
 		 386 aa  85.9  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4764  NHL repeat-containing protein  31.47 
 
 		 284 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1869  NHL repeat containing protein  29.24 
 
 		 307 aa  84.7  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2135  hypothetical protein  29.49 
 
 		 326 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2296  hypothetical protein  30.77 
 
 		 684 aa  81.3  0.00000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1997  NHL repeat-containing protein  28.1 
 
 		 303 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000426581  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0357  NHL repeat containing protein  27.56 
 
 		 700 aa  80.1  0.00000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  3.18335e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3219  hypothetical protein  32.14 
 
 		 318 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1132  hypothetical protein  28.27 
 
 		 323 aa  75.9  0.0000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0422  hypothetical protein  24.32 
 
 		 1068 aa  75.9  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.248115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2878  hypothetical protein  30.09 
 
 		 364 aa  75.5  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.461679  normal  0.172876 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  28.14 
 
 		 1351 aa  73.9  0.000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2493  NHL repeat-containing protein  25.91 
 
 		 260 aa  73.6  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  28.96 
 
 		 1834 aa  72.4  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1050  NHL repeat-containing protein  25.54 
 
 		 318 aa  72.4  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.400914  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2272  glycoside hydrolase family 26  32.98 
 
 		 711 aa  70.5  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.738347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2150  hypothetical protein  27.56 
 
 		 321 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.909302 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1192  NHL repeat containing protein  28.64 
 
 		 405 aa  69.7  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3058  NHL repeat protein  27.65 
 
 		 404 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7086  serine/threonine protein kinase  28.11 
 
 		 732 aa  68.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0408  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.27 
 
 		 693 aa  67.8  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.785735  normal  0.15039 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4759  NHL repeat-containing protein  32.77 
 
 		 211 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1056  NHL repeat-containing protein  25.11 
 
 		 328 aa  67.4  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0496  NHL repeat-containing protein  30.43 
 
 		 937 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0433  NHL domain/cytochrome c family protein  26.09 
 
 		 930 aa  67  0.0000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.102411  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  28.45 
 
 		 1079 aa  67  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2505  NHL repeat-containing protein  32.48 
 
 		 315 aa  66.6  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.990992  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3430  hypothetical protein  30.23 
 
 		 913 aa  67  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.836468  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1861  Phage tail protein  27.31 
 
 		 747 aa  66.2  0.0000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  26.48 
 
 		 1750 aa  65.5  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0728  serine/threonine protein kinase  26.85 
 
 		 683 aa  65.1  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  23.05 
 
 		 1030 aa  64.3  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0370  Fibronectin type III domain protein  31.75 
 
 		 841 aa  64.7  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.800383  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3024  TPR repeat-containing protein  28.02 
 
 		 1230 aa  64.3  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.446617  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2779  hypothetical protein  26.62 
 
 		 1051 aa  63.9  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1359  NHL repeat containing protein  26.5 
 
 		 439 aa  62.8  0.000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10949  transmembrane serine/threonine-protein kinase D pknD  28.04 
 
 		 664 aa  62.8  0.000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2265  NHL repeat-containing protein  26.96 
 
 		 963 aa  62.8  0.000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.397951  normal  0.439164 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  27.6 
 
 		 1026 aa  62.4  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1988  hypothetical protein  29.59 
 
 		 322 aa  61.6  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1383  serine/threonine protein kinase  34.33 
 
 		 678 aa  60.5  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0132851 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.31 
 
 		 1292 aa  60.5  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7126  serine/threonine protein kinase  27.19 
 
 		 770 aa  60.1  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2454  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.99 
 
 		 305 aa  59.7  0.00000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0662478 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>