153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3159 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3159  NHL repeat containing protein  100 
 
 		 372 aa  768    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2755  NHL repeat-containing protein  56.16 
 
 		 347 aa  408  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3109  NHL repeat containing protein  47.68 
 
 		 355 aa  317  1e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3225  NHL repeat-containing protein  45.18 
 
 		 365 aa  296  3e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0258  NHL repeat-containing protein  43.12 
 
 		 343 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1788  NHL repeat-containing protein  37.72 
 
 		 354 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.565326  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1920  NHL repeat-containing protein  36.22 
 
 		 343 aa  209  8e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00542747  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2897  NHL repeat-containing protein  34.49 
 
 		 363 aa  188  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.645365  normal  0.499228 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0742  NHL repeat-containing protein  33.9 
 
 		 355 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.150031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3838  NHL repeat-containing protein  32.49 
 
 		 360 aa  183  3e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000127539  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4124  NHL repeat-containing protein  32.22 
 
 		 359 aa  181  2e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.640446 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1869  NHL repeat-containing protein  36.17 
 
 		 353 aa  177  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0563587 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0617  NHL repeat-containing protein  31.38 
 
 		 361 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0567002  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0746  NHL repeat-containing protein  33.58 
 
 		 418 aa  155  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4135  NHL repeat-containing protein  32.63 
 
 		 368 aa  151  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  32.36 
 
 		 930 aa  142  8e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  30.88 
 
 		 831 aa  140  3e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  31.27 
 
 		 676 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  32.6 
 
 		 668 aa  138  2e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0923  NHL repeat-containing protein  28.66 
 
 		 379 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2758  NHL repeat-containing protein  31.85 
 
 		 396 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3162  NHL repeat containing protein  29.28 
 
 		 395 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0256  NHL repeat-containing protein  26.9 
 
 		 384 aa  126  5e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  31.82 
 
 		 391 aa  126  6e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  33.03 
 
 		 346 aa  125  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1601  NHL repeat-containing protein  30.08 
 
 		 491 aa  120  3.9999999999999996e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0447928  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  31 
 
 		 709 aa  119  7.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  28 
 
 		 579 aa  119  9e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  29.89 
 
 		 522 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  32.26 
 
 		 343 aa  117  5e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  27.99 
 
 		 387 aa  109  7.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3222  NHL repeat-containing protein  26.97 
 
 		 412 aa  107  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  29.52 
 
 		 390 aa  106  5e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3112  NHL repeat containing protein  25.76 
 
 		 436 aa  106  7e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  32.47 
 
 		 1146 aa  106  8e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  36.09 
 
 		 1293 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  38.71 
 
 		 752 aa  105  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1379  NHL repeat-containing protein  30.32 
 
 		 319 aa  104  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0368543 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  26.55 
 
 		 627 aa  101  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  37.58 
 
 		 930 aa  101  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  31.58 
 
 		 1163 aa  100  6e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1167  hypothetical protein  27.66 
 
 		 588 aa  99  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.0121867 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0355  NHL repeat-containing protein  30.67 
 
 		 1030 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64892  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3475  NHL repeat protein  33.33 
 
 		 1140 aa  97.4  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2818  hypothetical protein  27.65 
 
 		 392 aa  95.9  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.587259  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2885  NHL repeat-containing protein  29.28 
 
 		 888 aa  95.1  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0556  NHL repeat-containing protein  29.36 
 
 		 899 aa  95.1  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2282  NHL repeat containing protein  34.57 
 
 		 373 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.11837 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0477  NHL repeat-containing protein  32.13 
 
 		 525 aa  89.4  8e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.176502 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  27.78 
 
 		 1079 aa  87.4  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3865  NHL repeat-containing protein  26.48 
 
 		 1177 aa  86.7  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1869  NHL repeat containing protein  30.81 
 
 		 307 aa  86.7  6e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1836  NHL repeat-containing protein  27.78 
 
 		 906 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1047  fibronectin type III domain-containing protein  32.51 
 
 		 903 aa  85.1  0.000000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2816  NHL repeat-containing protein  26.45 
 
 		 386 aa  84  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306413  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2914  NHL repeat-containing protein  26.7 
 
 		 898 aa  83.6  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0718376  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  28.26 
 
 		 786 aa  83.2  0.000000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  24.54 
 
 		 1030 aa  80.1  0.00000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0357  NHL repeat containing protein  28 
 
 		 700 aa  78.6  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  3.18335e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0728  serine/threonine protein kinase  34.81 
 
 		 683 aa  77  0.0000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4004  ABC transporter related protein  26.64 
 
 		 639 aa  76.6  0.0000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.774502  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0422  hypothetical protein  29.88 
 
 		 1068 aa  76.3  0.0000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.248115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  27.07 
 
 		 1351 aa  75.9  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3024  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 1230 aa  75.1  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.446617  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2150  hypothetical protein  28.48 
 
 		 321 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.909302 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4764  NHL repeat-containing protein  33.11 
 
 		 284 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2137  hypothetical protein  27.95 
 
 		 322 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.982688 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2265  NHL repeat-containing protein  25.16 
 
 		 963 aa  73.9  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.397951  normal  0.439164 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3058  NHL repeat protein  25.91 
 
 		 404 aa  73.6  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1861  Phage tail protein  26.58 
 
 		 747 aa  72  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2878  hypothetical protein  30.6 
 
 		 364 aa  70.5  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.461679  normal  0.172876 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2296  hypothetical protein  27.27 
 
 		 684 aa  70.1  0.00000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2135  hypothetical protein  26.32 
 
 		 326 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1192  NHL repeat containing protein  29.28 
 
 		 405 aa  66.6  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2505  NHL repeat-containing protein  27.52 
 
 		 315 aa  66.2  0.0000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.990992  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13557  hypothetical protein  27.19 
 
 		 343 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000762607 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  26.37 
 
 		 1750 aa  64.7  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1050  NHL repeat-containing protein  27.33 
 
 		 318 aa  64.3  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.400914  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0408  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  23.32 
 
 		 693 aa  64.7  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.785735  normal  0.15039 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4750  NHL repeat-containing protein  33.91 
 
 		 279 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.869111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  27.48 
 
 		 2296 aa  63.5  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2914  NHL repeat-containing protein  27.89 
 
 		 315 aa  63.5  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4759  NHL repeat-containing protein  30.51 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  26.19 
 
 		 1026 aa  63.2  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4088  serine/threonine protein kinase  34.69 
 
 		 850 aa  62.8  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0496  NHL repeat-containing protein  30.34 
 
 		 937 aa  62.4  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1997  NHL repeat-containing protein  22.81 
 
 		 303 aa  62  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000426581  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1358  NHL repeat containing protein  25.32 
 
 		 646 aa  62  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.967304 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1132  hypothetical protein  27 
 
 		 323 aa  62  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0370  Fibronectin type III domain protein  28.16 
 
 		 841 aa  62  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.800383  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1056  NHL repeat-containing protein  26.96 
 
 		 328 aa  60.8  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  23.45 
 
 		 1292 aa  60.8  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3430  hypothetical protein  25 
 
 		 913 aa  60.8  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.836468  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0989  NHL repeat-containing protein  29.94 
 
 		 630 aa  60.5  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0570  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  25.39 
 
 		 334 aa  59.7  0.00000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.910733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3219  hypothetical protein  24.89 
 
 		 318 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3066  NHL repeat-containing protein  23.42 
 
 		 297 aa  57.8  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0241  tetratricopeptide repeat domain protein  30.77 
 
 		 668 aa  58.2  0.0000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.113606  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2272  glycoside hydrolase family 26  28.68 
 
 		 711 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.738347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3164  NHL repeat containing protein  23.4 
 
 		 297 aa  57  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>