163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0746 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0746  NHL repeat-containing protein  100 
 
 
418 aa  861    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3159  NHL repeat containing protein  33.58 
 
 
372 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2755  NHL repeat-containing protein  34.21 
 
 
347 aa  160  4e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1788  NHL repeat-containing protein  31.42 
 
 
354 aa  158  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.565326  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1869  NHL repeat-containing protein  32.93 
 
 
353 aa  153  5e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0563587 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3225  NHL repeat-containing protein  31.19 
 
 
365 aa  150  3e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3109  NHL repeat containing protein  32.54 
 
 
355 aa  150  5e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1920  NHL repeat-containing protein  28.62 
 
 
343 aa  146  6e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00542747  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0742  NHL repeat-containing protein  30.94 
 
 
355 aa  144  4e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.150031  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2897  NHL repeat-containing protein  28.74 
 
 
363 aa  138  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.645365  normal  0.499228 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3838  NHL repeat-containing protein  31.56 
 
 
360 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000127539  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  32.84 
 
 
831 aa  133  6.999999999999999e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4124  NHL repeat-containing protein  30.18 
 
 
359 aa  132  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.640446 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0258  NHL repeat-containing protein  32.06 
 
 
343 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  31.38 
 
 
930 aa  127  3e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4135  NHL repeat-containing protein  30.72 
 
 
368 aa  127  3e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  34.96 
 
 
668 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0256  NHL repeat-containing protein  29.31 
 
 
384 aa  126  7e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  32.97 
 
 
579 aa  125  1e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0617  NHL repeat-containing protein  28.07 
 
 
361 aa  124  3e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0567002  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  31.91 
 
 
346 aa  121  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0923  NHL repeat-containing protein  30 
 
 
379 aa  120  7e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  33.33 
 
 
676 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1601  NHL repeat-containing protein  27.4 
 
 
491 aa  116  6e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0447928  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  27.21 
 
 
752 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3162  NHL repeat containing protein  24.18 
 
 
395 aa  114  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  32.12 
 
 
387 aa  114  3e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1167  hypothetical protein  35.19 
 
 
588 aa  113  7.000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.0121867 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1379  NHL repeat-containing protein  35.12 
 
 
319 aa  112  9e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0368543 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0355  NHL repeat-containing protein  32.56 
 
 
1030 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64892  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  30.77 
 
 
522 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  31.63 
 
 
391 aa  110  5e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  28.57 
 
 
627 aa  108  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2758  NHL repeat-containing protein  28.37 
 
 
396 aa  108  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  31.23 
 
 
343 aa  107  5e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3222  NHL repeat-containing protein  30.14 
 
 
412 aa  105  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2282  NHL repeat containing protein  30 
 
 
373 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.11837 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  37.59 
 
 
709 aa  104  4e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3112  NHL repeat containing protein  25.89 
 
 
436 aa  102  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  40.32 
 
 
930 aa  100  7e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  37.91 
 
 
1293 aa  99.8  9e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2818  hypothetical protein  33.33 
 
 
392 aa  94.4  4e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.587259  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  30.97 
 
 
390 aa  94  5e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3475  NHL repeat protein  29.21 
 
 
1140 aa  93.6  7e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  33.16 
 
 
1146 aa  93.2  8e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0357  NHL repeat containing protein  31.36 
 
 
700 aa  91.7  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  3.18335e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  33.16 
 
 
1163 aa  91.3  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1047  fibronectin type III domain-containing protein  26.47 
 
 
903 aa  90.5  5e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  29.12 
 
 
786 aa  89.4  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0477  NHL repeat-containing protein  27.39 
 
 
525 aa  84.3  0.000000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.176502 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  30.32 
 
 
1750 aa  83.6  0.000000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4764  NHL repeat-containing protein  34.88 
 
 
284 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3219  hypothetical protein  31.94 
 
 
318 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116128  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2137  hypothetical protein  29.94 
 
 
322 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.982688 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1869  NHL repeat containing protein  27.41 
 
 
307 aa  78.6  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3865  NHL repeat-containing protein  28.83 
 
 
1177 aa  77.4  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3058  NHL repeat protein  26.55 
 
 
404 aa  77.4  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4750  NHL repeat-containing protein  35.95 
 
 
279 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.869111  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2265  NHL repeat-containing protein  27.54 
 
 
963 aa  76.6  0.0000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.397951  normal  0.439164 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4004  ABC transporter related protein  31.61 
 
 
639 aa  76.6  0.0000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.774502  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5916  NHL repeat-containing protein  28.28 
 
 
379 aa  76.6  0.0000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.205268  normal  0.0756085 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2779  hypothetical protein  26.79 
 
 
1051 aa  74.3  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2878  hypothetical protein  33.11 
 
 
364 aa  74.3  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.461679  normal  0.172876 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2816  NHL repeat-containing protein  29.61 
 
 
386 aa  73.9  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306413  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1132  hypothetical protein  28.74 
 
 
323 aa  73.9  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425317  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2914  NHL repeat-containing protein  27.13 
 
 
898 aa  73.6  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0718376  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1050  NHL repeat-containing protein  26.7 
 
 
318 aa  73.6  0.000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.400914  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2150  hypothetical protein  27.84 
 
 
321 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.909302 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0422  hypothetical protein  32.26 
 
 
1068 aa  70.9  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.248115  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4759  NHL repeat-containing protein  34.43 
 
 
211 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0408  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  32.37 
 
 
693 aa  70.1  0.00000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.785735  normal  0.15039 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2296  hypothetical protein  34.43 
 
 
684 aa  69.3  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0556  NHL repeat-containing protein  31.22 
 
 
899 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2135  hypothetical protein  27.22 
 
 
326 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1056  NHL repeat-containing protein  28.88 
 
 
328 aa  68.6  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.91 
 
 
1292 aa  68.6  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  26 
 
 
2296 aa  67  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0496  NHL repeat-containing protein  29.95 
 
 
937 aa  66.6  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7126  serine/threonine protein kinase  27.27 
 
 
770 aa  66.6  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4063  NHL repeat-containing protein  25.96 
 
 
1763 aa  66.2  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.512891  normal  0.666526 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  24.45 
 
 
1351 aa  65.1  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10949  transmembrane serine/threonine-protein kinase D pknD  28.51 
 
 
664 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2914  NHL repeat-containing protein  28.49 
 
 
315 aa  65.5  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1359  NHL repeat containing protein  24.77 
 
 
439 aa  65.1  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1192  NHL repeat containing protein  25.18 
 
 
405 aa  63.5  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1836  NHL repeat-containing protein  24.51 
 
 
906 aa  63.5  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2505  NHL repeat-containing protein  29.6 
 
 
315 aa  62.8  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.990992  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2272  glycoside hydrolase family 26  32.47 
 
 
711 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.738347  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3780  hypothetical protein  26.07 
 
 
377 aa  62.8  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4570  NHL repeat containing protein  28.72 
 
 
353 aa  61.6  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.532406 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0989  NHL repeat-containing protein  28.44 
 
 
630 aa  60.5  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  24.39 
 
 
1030 aa  60.8  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1383  serine/threonine protein kinase  29.71 
 
 
678 aa  60.5  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0132851 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4185  serine/threonine protein kinase  24.46 
 
 
719 aa  60.1  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  28.88 
 
 
1079 aa  59.3  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3024  TPR repeat-containing protein  25.08 
 
 
1230 aa  59.7  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.446617  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0177  NHL repeat containing protein  32.56 
 
 
716 aa  58.5  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  27.97 
 
 
1130 aa  58.5  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7086  serine/threonine protein kinase  25.22 
 
 
732 aa  58.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2885  NHL repeat-containing protein  30.4 
 
 
888 aa  57.8  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>