197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1047 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1047  fibronectin type III domain-containing protein  100 
 
 		 903 aa  1818    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0231  Ig family protein  44.11 
 
 		 556 aa  213  2e-53  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  34.76 
 
 		 676 aa  150  8e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  33.52 
 
 		 668 aa  145  3e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  31.25 
 
 		 930 aa  140  7.999999999999999e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1601  NHL repeat-containing protein  32.96 
 
 		 491 aa  136  1.9999999999999998e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0447928  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  30.66 
 
 		 831 aa  131  7.000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  31.21 
 
 		 752 aa  128  5e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  29.95 
 
 		 579 aa  126  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  28.37 
 
 		 627 aa  125  4e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  30.5 
 
 		 346 aa  122  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1040  fibronectin type III domain-containing protein  31.27 
 
 		 771 aa  115  3e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  27.98 
 
 		 1293 aa  115  5e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  29.29 
 
 		 709 aa  114  8.000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  28.44 
 
 		 522 aa  112  3e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  31.23 
 
 		 390 aa  103  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0134  Fibronectin type III domain protein  29.41 
 
 		 1628 aa  101  5e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.504623  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.2 
 
 		 343 aa  99.8  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0355  NHL repeat-containing protein  26.96 
 
 		 1030 aa  98.2  6e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64892  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  34.97 
 
 		 930 aa  97.8  9e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3225  NHL repeat-containing protein  31.87 
 
 		 365 aa  96.7  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  28.62 
 
 		 387 aa  96.7  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1073  fibronectin type III domain-containing protein  32.13 
 
 		 9585 aa  95.5  4e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0264  Fibronectin type III domain protein  29.49 
 
 		 480 aa  95.1  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.375315  normal  0.632573 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1167  hypothetical protein  25.29 
 
 		 588 aa  94.7  7e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.0121867 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0258  NHL repeat-containing protein  32.5 
 
 		 343 aa  92  5e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2818  hypothetical protein  28.82 
 
 		 392 aa  92  5e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.587259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0742  NHL repeat-containing protein  27.81 
 
 		 355 aa  91.3  7e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.150031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0746  NHL repeat-containing protein  26.47 
 
 		 418 aa  90.5  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0030  hypothetical protein  38.46 
 
 		 334 aa  90.1  2e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  28.79 
 
 		 1163 aa  89.4  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3838  NHL repeat-containing protein  25.72 
 
 		 360 aa  87.8  8e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000127539  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1379  NHL repeat-containing protein  25.6 
 
 		 319 aa  86.7  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0368543 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  27.13 
 
 		 391 aa  85.1  0.000000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0327  Peptidase S53 propeptide  32.55 
 
 		 1199 aa  84.7  0.000000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0684029  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3159  NHL repeat containing protein  32.51 
 
 		 372 aa  84.7  0.000000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3673  fibronectin type III domain-containing protein  26.17 
 
 		 2170 aa  83.6  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20402 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2755  NHL repeat-containing protein  32.84 
 
 		 347 aa  82.8  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1788  NHL repeat-containing protein  29.34 
 
 		 354 aa  81.6  0.00000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.565326  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4088  serine/threonine protein kinase  25.55 
 
 		 850 aa  81.6  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  27.82 
 
 		 1146 aa  81.3  0.00000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0617  NHL repeat-containing protein  29.08 
 
 		 361 aa  78.2  0.0000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0567002  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  27.76 
 
 		 1750 aa  77.8  0.0000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1920  NHL repeat-containing protein  26.14 
 
 		 343 aa  77.4  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00542747  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4135  NHL repeat-containing protein  27.66 
 
 		 368 aa  77.4  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  25.75 
 
 		 1079 aa  76.3  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2282  NHL repeat containing protein  26.98 
 
 		 373 aa  74.7  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.11837 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0422  hypothetical protein  25.43 
 
 		 1068 aa  73.9  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.248115  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2914  NHL repeat-containing protein  24.81 
 
 		 898 aa  73.2  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0718376  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1869  NHL repeat-containing protein  26.28 
 
 		 353 aa  72.8  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0563587 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2897  NHL repeat-containing protein  26.67 
 
 		 363 aa  73.6  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.645365  normal  0.499228 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3109  NHL repeat containing protein  29.95 
 
 		 355 aa  73.2  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0989  NHL repeat-containing protein  34.06 
 
 		 630 aa  72.8  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3865  NHL repeat-containing protein  24.72 
 
 		 1177 aa  72.8  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2885  NHL repeat-containing protein  29.9 
 
 		 888 aa  72.4  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2063  NHL repeat containing protein  35.76 
 
 		 652 aa  72  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2914  NHL repeat-containing protein  28.57 
 
 		 315 aa  72  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0357  NHL repeat containing protein  27.86 
 
 		 700 aa  70.5  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  3.18335e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  29.37 
 
 		 2296 aa  70.1  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3475  NHL repeat protein  30.43 
 
 		 1140 aa  69.7  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0896  Fibronectin type III domain protein  28.72 
 
 		 804 aa  70.5  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  28.9 
 
 		 786 aa  68.6  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  24.54 
 
 		 1834 aa  68.6  0.0000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4124  NHL repeat-containing protein  25 
 
 		 359 aa  68.2  0.0000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.640446 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04160  beta-1,3-glucanase  29.81 
 
 		 1067 aa  67.8  0.0000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2454  fibronectin, type III  27.53 
 
 		 1042 aa  66.6  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2036  fibronectin, type III domain-containing protein  30.48 
 
 		 2068 aa  65.9  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1869  NHL repeat containing protein  25.62 
 
 		 307 aa  65.9  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1101  Fibronectin type III domain protein  28.2 
 
 		 1462 aa  65.5  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4253  fibronectin type III domain-containing protein  25.09 
 
 		 680 aa  64.7  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2469  fibronectin, type III  27.2 
 
 		 3507 aa  64.7  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  24.86 
 
 		 1030 aa  64.3  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7155  Glucodextranase N  28.8 
 
 		 1160 aa  63.9  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0849564  normal  0.457795 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1192  NHL repeat containing protein  25.68 
 
 		 405 aa  63.9  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3668  fibronectin type III domain-containing protein  26.79 
 
 		 836 aa  63.9  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  24.2 
 
 		 1292 aa  63.2  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2816  NHL repeat-containing protein  25.62 
 
 		 386 aa  63.5  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  25.06 
 
 		 6885 aa  63.2  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1359  NHL repeat containing protein  26.2 
 
 		 439 aa  62.8  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0477  NHL repeat-containing protein  25.96 
 
 		 525 aa  60.8  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.176502 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0912  fibronectin, type III/multicopper oxidase, type 2  24.36 
 
 		 1380 aa  60.1  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27230  subtilisin-like serine protease  25.32 
 
 		 801 aa  60.1  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0273209  normal  0.322238 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3780  hypothetical protein  25.52 
 
 		 377 aa  60.1  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3794  fibronectin type III domain-containing protein  25.57 
 
 		 1973 aa  60.1  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2272  glycoside hydrolase family 26  24.84 
 
 		 711 aa  59.3  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.738347  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3162  NHL repeat containing protein  24.75 
 
 		 395 aa  59.3  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4089  serine/threonine protein kinase  24.16 
 
 		 772 aa  59.3  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1128  hypothetical protein  28.85 
 
 		 3911 aa  59.3  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2917  NHL repeat containing protein  24.09 
 
 		 623 aa  58.9  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.304592  normal  0.453442 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0556  NHL repeat-containing protein  22.9 
 
 		 899 aa  58.9  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2535  hypothetical protein  36.89 
 
 		 670 aa  58.9  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0256  NHL repeat-containing protein  25.22 
 
 		 384 aa  58.5  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  26.09 
 
 		 1351 aa  58.9  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4764  NHL repeat-containing protein  23.74 
 
 		 284 aa  58.5  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1861  Phage tail protein  27.45 
 
 		 747 aa  58.5  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3550  fibronectin, type III domain-containing protein  28.49 
 
 		 2476 aa  58.5  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2466  fibronectin type III domain-containing protein  26.11 
 
 		 1887 aa  58.5  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401987  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2212  chitin-binding domain-containing protein  28.88 
 
 		 459 aa  58.2  0.0000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000239148  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3024  TPR repeat-containing protein  24.8 
 
 		 1230 aa  58.2  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.446617  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0427  Fibronectin type III domain protein  25.08 
 
 		 2039 aa  57  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>