85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2816 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_2816  NHL repeat-containing protein  100 
 
 		 386 aa  781    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0742  NHL repeat-containing protein  32.82 
 
 		 355 aa  135  8e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.150031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  32.04 
 
 		 668 aa  106  6e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1788  NHL repeat-containing protein  30.07 
 
 		 354 aa  96.7  6e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.565326  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  25 
 
 		 676 aa  94.7  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1920  NHL repeat-containing protein  26.52 
 
 		 343 aa  90.5  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00542747  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  26.64 
 
 		 752 aa  89.7  7e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  28.1 
 
 		 930 aa  89.4  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2897  NHL repeat-containing protein  29.57 
 
 		 363 aa  88.2  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.645365  normal  0.499228 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1601  NHL repeat-containing protein  27.7 
 
 		 491 aa  87.4  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0447928  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2755  NHL repeat-containing protein  27 
 
 		 347 aa  87.4  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  25.55 
 
 		 346 aa  86.7  6e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3225  NHL repeat-containing protein  29.97 
 
 		 365 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2818  hypothetical protein  25.25 
 
 		 392 aa  84.7  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.587259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1379  NHL repeat-containing protein  30.62 
 
 		 319 aa  84  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0368543 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3159  NHL repeat containing protein  26.45 
 
 		 372 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0617  NHL repeat-containing protein  28.75 
 
 		 361 aa  82.8  0.000000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0567002  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4124  NHL repeat-containing protein  27.67 
 
 		 359 aa  82.4  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.640446 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  26.97 
 
 		 831 aa  82  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  26.72 
 
 		 579 aa  81.3  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  27.34 
 
 		 522 aa  80.1  0.00000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  28.78 
 
 		 1146 aa  80.1  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1869  NHL repeat-containing protein  28.11 
 
 		 353 aa  80.1  0.00000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0563587 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.64 
 
 		 343 aa  79.7  0.00000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3222  NHL repeat-containing protein  29.19 
 
 		 412 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  29.25 
 
 		 1163 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1167  hypothetical protein  29.44 
 
 		 588 aa  77.4  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.0121867 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3109  NHL repeat containing protein  28.85 
 
 		 355 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3838  NHL repeat-containing protein  25.45 
 
 		 360 aa  73.9  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000127539  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3162  NHL repeat containing protein  30.37 
 
 		 395 aa  73.6  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  25.19 
 
 		 391 aa  71.2  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  28.67 
 
 		 930 aa  70.9  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0258  NHL repeat-containing protein  27.99 
 
 		 343 aa  70.5  0.00000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0256  NHL repeat-containing protein  27.92 
 
 		 384 aa  70.1  0.00000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  26.54 
 
 		 709 aa  68.2  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0477  NHL repeat-containing protein  25 
 
 		 525 aa  68.6  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.176502 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  25.35 
 
 		 627 aa  67.4  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0746  NHL repeat-containing protein  29.61 
 
 		 418 aa  67.4  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0357  NHL repeat containing protein  24.2 
 
 		 700 aa  67  0.0000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  3.18335e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4135  NHL repeat-containing protein  30.62 
 
 		 368 aa  66.6  0.0000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  26.34 
 
 		 387 aa  66.2  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4004  ABC transporter related protein  27.18 
 
 		 639 aa  65.5  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.774502  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  27.46 
 
 		 390 aa  64.3  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1869  NHL repeat containing protein  25.99 
 
 		 307 aa  64.7  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2758  NHL repeat-containing protein  26.32 
 
 		 396 aa  64.3  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  25.63 
 
 		 1293 aa  63.2  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1047  fibronectin type III domain-containing protein  25.62 
 
 		 903 aa  63.5  0.000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0355  NHL repeat-containing protein  27.96 
 
 		 1030 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64892  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1192  NHL repeat containing protein  24.46 
 
 		 405 aa  61.2  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3475  NHL repeat protein  26.34 
 
 		 1140 aa  55.5  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  23.89 
 
 		 786 aa  55.5  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1383  serine/threonine protein kinase  27.65 
 
 		 678 aa  55.5  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0132851 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0923  NHL repeat-containing protein  25.88 
 
 		 379 aa  53.9  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2135  hypothetical protein  23.36 
 
 		 326 aa  53.5  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2236  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  25.47 
 
 		 719 aa  52.4  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1132  hypothetical protein  24.77 
 
 		 323 aa  52.4  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2150  hypothetical protein  28.49 
 
 		 321 aa  51.2  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.909302 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4750  NHL repeat-containing protein  32.43 
 
 		 279 aa  51.2  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.869111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2282  NHL repeat containing protein  26.75 
 
 		 373 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.11837 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2265  NHL repeat-containing protein  23.74 
 
 		 963 aa  49.3  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.397951  normal  0.439164 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3865  NHL repeat-containing protein  23.38 
 
 		 1177 aa  49.3  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0422  hypothetical protein  22.02 
 
 		 1068 aa  48.9  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.248115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0556  NHL repeat-containing protein  29.6 
 
 		 899 aa  48.9  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2272  glycoside hydrolase family 26  29.19 
 
 		 711 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.738347  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3112  NHL repeat containing protein  24.32 
 
 		 436 aa  47.8  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3024  TPR repeat-containing protein  28 
 
 		 1230 aa  47.8  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.446617  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0496  NHL repeat-containing protein  25.84 
 
 		 937 aa  47.4  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  20.83 
 
 		 1079 aa  47.4  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0408  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.31 
 
 		 693 aa  47.4  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.785735  normal  0.15039 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3058  NHL repeat protein  25.93 
 
 		 404 aa  47.4  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  23.9 
 
 		 1750 aa  46.6  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2885  NHL repeat-containing protein  25.9 
 
 		 888 aa  46.6  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1988  hypothetical protein  42.65 
 
 		 322 aa  46.6  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0241  tetratricopeptide repeat domain protein  23.56 
 
 		 668 aa  46.2  0.0009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.113606  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2137  hypothetical protein  23.36 
 
 		 322 aa  46.2  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.982688 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1050  NHL repeat-containing protein  24.54 
 
 		 318 aa  45.8  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.400914  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2914  NHL repeat-containing protein  25.48 
 
 		 898 aa  46.2  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0718376  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4764  NHL repeat-containing protein  40 
 
 		 284 aa  46.2  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3066  NHL repeat-containing protein  24.82 
 
 		 297 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2296  hypothetical protein  31.5 
 
 		 684 aa  45.4  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3259  NHL repeat containing protein  24.72 
 
 		 297 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0728  serine/threonine protein kinase  27.83 
 
 		 683 aa  43.5  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1056  NHL repeat-containing protein  26.16 
 
 		 328 aa  43.5  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2779  hypothetical protein  30.1 
 
 		 1051 aa  43.5  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0370  Fibronectin type III domain protein  25.71 
 
 		 841 aa  43.1  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.800383  normal  0.932394 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>