More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_3024 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_3024  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 1230 aa  2521    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.446617  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  26.11 
 
 		 676 aa  167  1.0000000000000001e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  28.09 
 
 		 930 aa  154  1e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  25.91 
 
 		 831 aa  153  2e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  28.88 
 
 		 1293 aa  152  4e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  27.35 
 
 		 668 aa  148  7.0000000000000006e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1167  hypothetical protein  23.59 
 
 		 588 aa  120  1.9999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.0121867 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  33.97 
 
 		 343 aa  110  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  29.92 
 
 		 752 aa  98.2  8e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0477  NHL repeat-containing protein  25.93 
 
 		 525 aa  98.2  9e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.176502 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  26.01 
 
 		 579 aa  93.2  3e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  31.53 
 
 		 522 aa  90.9  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2917  hypothetical protein  29.15 
 
 		 527 aa  90.5  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000178577 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  30.61 
 
 		 930 aa  88.6  6e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  26.67 
 
 		 627 aa  87.8  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1601  NHL repeat-containing protein  29.61 
 
 		 491 aa  87  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0447928  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3109  NHL repeat containing protein  29.02 
 
 		 355 aa  86.3  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  23.19 
 
 		 346 aa  86.7  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0355  NHL repeat-containing protein  25 
 
 		 1030 aa  84.3  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64892  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  27.09 
 
 		 391 aa  84  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  27.21 
 
 		 709 aa  83.6  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2818  hypothetical protein  25.37 
 
 		 392 aa  83.6  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.587259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1101  Fibronectin type III domain protein  35.23 
 
 		 1462 aa  81.3  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  29.6 
 
 		 390 aa  79.3  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3156  Fibronectin type III domain protein  30.73 
 
 		 741 aa  75.9  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7155  Glucodextranase N  35.39 
 
 		 1160 aa  75.1  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0849564  normal  0.457795 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0258  NHL repeat-containing protein  27.54 
 
 		 343 aa  73.6  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  31.02 
 
 		 387 aa  73.2  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1295  fibronectin type III domain-containing protein  28.65 
 
 		 410 aa  71.6  0.00000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0742  NHL repeat-containing protein  28.34 
 
 		 355 aa  71.6  0.00000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.150031  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1415  fibronectin type III domain-containing protein  28.65 
 
 		 410 aa  71.2  0.0000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  29.35 
 
 		 1146 aa  70.9  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3159  NHL repeat containing protein  23.42 
 
 		 372 aa  70.1  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2282  NHL repeat containing protein  30.05 
 
 		 373 aa  69.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.11837 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0400  chitinase  33.53 
 
 		 598 aa  68.9  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.0000106126  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2755  NHL repeat-containing protein  29.81 
 
 		 347 aa  68.9  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1379  NHL repeat-containing protein  24.61 
 
 		 319 aa  68.9  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0368543 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  30.77 
 
 		 455 aa  68.6  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  30.77 
 
 		 455 aa  68.6  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2758  NHL repeat-containing protein  33.95 
 
 		 396 aa  68.2  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  30.99 
 
 		 786 aa  67.8  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4124  NHL repeat-containing protein  31.48 
 
 		 359 aa  67.8  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.640446 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4135  NHL repeat-containing protein  24.11 
 
 		 368 aa  67  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0923  NHL repeat-containing protein  29.68 
 
 		 379 aa  66.6  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0408  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.21 
 
 		 693 aa  66.6  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.785735  normal  0.15039 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1050  NHL repeat-containing protein  25.5 
 
 		 318 aa  65.9  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.400914  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3222  NHL repeat-containing protein  29.15 
 
 		 412 aa  65.9  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1788  NHL repeat-containing protein  29.17 
 
 		 354 aa  65.5  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.565326  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2824  chitin binding protein, putative  29.81 
 
 		 455 aa  65.1  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00573769  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  31.56 
 
 		 6885 aa  64.3  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3225  NHL repeat-containing protein  28.02 
 
 		 365 aa  64.3  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3865  NHL repeat-containing protein  28.49 
 
 		 1177 aa  63.5  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0357  NHL repeat containing protein  22.75 
 
 		 700 aa  63.9  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  3.18335e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2487  putative chitinase  31.28 
 
 		 455 aa  63.5  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4160  glycoside hydrolase family 18  32.09 
 
 		 762 aa  63.2  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.299546 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1869  NHL repeat-containing protein  27.27 
 
 		 353 aa  63.2  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0563587 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1219  fibronectin type III domain-containing protein  22.77 
 
 		 388 aa  63.2  0.00000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1869  NHL repeat containing protein  25.59 
 
 		 307 aa  62.8  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0422  hypothetical protein  21.17 
 
 		 1068 aa  62.8  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.248115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0036  chitin-binding domain protein  31.12 
 
 		 456 aa  62.4  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0067572  normal  0.0435633 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2803  putative chitinase  29.59 
 
 		 455 aa  62  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  23.81 
 
 		 1834 aa  62  0.00000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2150  hypothetical protein  22.93 
 
 		 321 aa  62  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.909302 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2897  NHL repeat-containing protein  27.13 
 
 		 363 aa  61.6  0.00000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.645365  normal  0.499228 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0957  PA14 domain protein  31.19 
 
 		 3802 aa  61.6  0.00000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.168147 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1001  hypothetical protein  22.62 
 
 		 479 aa  61.2  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.234002  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2598  chitin-binding domain-containing protein  29.23 
 
 		 455 aa  61.2  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3162  NHL repeat containing protein  28.28 
 
 		 395 aa  60.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0692  fibronectin type III domain-containing protein  32.77 
 
 		 465 aa  60.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  31.86 
 
 		 265 aa  60.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3673  fibronectin type III domain-containing protein  30.32 
 
 		 2170 aa  60.5  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20402 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04370  hypothetical protein  45.71 
 
 		 445 aa  60.1  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  28.95 
 
 		 3145 aa  60.1  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0640  Fibronectin type III domain protein  25.15 
 
 		 404 aa  59.7  0.0000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1811  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 596 aa  59.7  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.541585  normal  0.135887 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0446  fibronectin type III domain-containing protein  26.09 
 
 		 409 aa  59.3  0.0000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0256  NHL repeat-containing protein  28.68 
 
 		 384 aa  59.3  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3475  NHL repeat protein  25.63 
 
 		 1140 aa  58.9  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  28.85 
 
 		 455 aa  58.9  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  28.85 
 
 		 455 aa  58.5  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1920  NHL repeat-containing protein  31.5 
 
 		 343 aa  58.5  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00542747  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  33.05 
 
 		 767 aa  58.5  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  25.23 
 
 		 1079 aa  58.5  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0610  fibronectin type III domain-containing protein/ chitin binding domain-containing protein  31.64 
 
 		 464 aa  58.5  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1047  fibronectin type III domain-containing protein  24.8 
 
 		 903 aa  58.5  0.0000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0610  fibronectin type III domain protein  22.65 
 
 		 404 aa  58.2  0.0000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  25.82 
 
 		 1163 aa  58.2  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2845  putative chitinase  29.05 
 
 		 455 aa  58.2  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00670529  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2523  chitin-binding protein  29.61 
 
 		 455 aa  58.2  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  32.76 
 
 		 626 aa  58.2  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  32.76 
 
 		 614 aa  57.8  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  32.76 
 
 		 626 aa  57.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.63 
 
 		 565 aa  57.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  32.76 
 
 		 614 aa  57.8  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  31.9 
 
 		 626 aa  57.4  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0728  serine/threonine protein kinase  28.49 
 
 		 683 aa  57.8  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  32.76 
 
 		 614 aa  57.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  32.76 
 
 		 614 aa  58.2  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.87 
 
 		 689 aa  57.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  32.76 
 
 		 614 aa  57.8  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>