100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2914 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_2914  NHL repeat-containing protein  100 
 
 
315 aa  644    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  30.98 
 
 
668 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  31.63 
 
 
676 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  31.77 
 
 
930 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  31.98 
 
 
346 aa  107  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  29.45 
 
 
831 aa  105  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  29.46 
 
 
627 aa  99  8e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  33.88 
 
 
579 aa  98.6  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2818  hypothetical protein  29.35 
 
 
392 aa  96.7  5e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.587259  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  29.44 
 
 
752 aa  95.1  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  32.77 
 
 
391 aa  94.7  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1167  hypothetical protein  25.83 
 
 
588 aa  93.6  4e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.0121867 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  28.57 
 
 
709 aa  93.2  5e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  29.58 
 
 
522 aa  89.7  5e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  29.26 
 
 
1293 aa  89.7  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.53 
 
 
343 aa  89.7  6e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1601  NHL repeat-containing protein  28.32 
 
 
491 aa  85.9  9e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0447928  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  38.57 
 
 
930 aa  83.2  0.000000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  27.78 
 
 
387 aa  80.9  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0355  NHL repeat-containing protein  28.96 
 
 
1030 aa  78.6  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64892  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1379  NHL repeat-containing protein  28.02 
 
 
319 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0368543 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0742  NHL repeat-containing protein  33.16 
 
 
355 aa  76.6  0.0000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.150031  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1869  NHL repeat containing protein  27.2 
 
 
307 aa  73.9  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3222  NHL repeat-containing protein  26.64 
 
 
412 aa  72  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0477  NHL repeat-containing protein  30.37 
 
 
525 aa  72  0.00000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.176502 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1047  fibronectin type III domain-containing protein  28.57 
 
 
903 aa  72  0.00000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  27.98 
 
 
786 aa  71.2  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  28.92 
 
 
390 aa  70.9  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  25.58 
 
 
1146 aa  70.1  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  26.79 
 
 
1163 aa  69.3  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0556  NHL repeat-containing protein  26.38 
 
 
899 aa  66.6  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0357  NHL repeat containing protein  30.56 
 
 
700 aa  65.9  0.0000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  3.18335e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0746  NHL repeat-containing protein  28.49 
 
 
418 aa  65.5  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3162  NHL repeat containing protein  24.91 
 
 
395 aa  65.1  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3838  NHL repeat-containing protein  26.37 
 
 
360 aa  65.1  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000127539  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3109  NHL repeat containing protein  29.95 
 
 
355 aa  63.9  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1920  NHL repeat-containing protein  26.78 
 
 
343 aa  63.2  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00542747  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3159  NHL repeat containing protein  27.89 
 
 
372 aa  62.8  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0258  NHL repeat-containing protein  26.83 
 
 
343 aa  62.4  0.000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1869  NHL repeat-containing protein  27.51 
 
 
353 aa  61.2  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0563587 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2755  NHL repeat-containing protein  28.57 
 
 
347 aa  60.5  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2897  NHL repeat-containing protein  26.04 
 
 
363 aa  60.5  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.645365  normal  0.499228 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3225  NHL repeat-containing protein  29.73 
 
 
365 aa  58.5  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1861  Phage tail protein  30.07 
 
 
747 aa  58.9  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1358  NHL repeat containing protein  24.01 
 
 
646 aa  58.2  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.967304 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2914  NHL repeat-containing protein  27.19 
 
 
898 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0718376  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1359  NHL repeat containing protein  25.74 
 
 
439 aa  57.4  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0923  NHL repeat-containing protein  25.57 
 
 
379 aa  57.4  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2282  NHL repeat containing protein  24.81 
 
 
373 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.11837 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  23.97 
 
 
1079 aa  57  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0422  hypothetical protein  27.78 
 
 
1068 aa  57  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.248115  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3024  TPR repeat-containing protein  29.29 
 
 
1230 aa  56.6  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.446617  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1132  hypothetical protein  23.14 
 
 
323 aa  55.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425317  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3430  hypothetical protein  29.25 
 
 
913 aa  55.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.836468  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4088  serine/threonine protein kinase  28.44 
 
 
850 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527089  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  24.12 
 
 
2296 aa  53.9  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0617  NHL repeat-containing protein  25.14 
 
 
361 aa  53.9  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0567002  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0256  NHL repeat-containing protein  28.57 
 
 
384 aa  53.9  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1788  NHL repeat-containing protein  25.32 
 
 
354 aa  54.3  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.565326  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3475  NHL repeat protein  27.51 
 
 
1140 aa  52.8  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10949  transmembrane serine/threonine-protein kinase D pknD  25.26 
 
 
664 aa  52.8  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2758  NHL repeat-containing protein  23.9 
 
 
396 aa  52.4  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4764  NHL repeat-containing protein  27.46 
 
 
284 aa  52.4  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4124  NHL repeat-containing protein  27.35 
 
 
359 aa  52  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.640446 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4135  NHL repeat-containing protein  29.66 
 
 
368 aa  51.6  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2296  hypothetical protein  26.8 
 
 
684 aa  51.6  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  25.07 
 
 
1750 aa  51.6  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2878  hypothetical protein  23.96 
 
 
364 aa  51.6  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.461679  normal  0.172876 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0989  NHL repeat-containing protein  35.16 
 
 
630 aa  51.6  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3058  NHL repeat protein  27.68 
 
 
404 aa  51.6  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  24.11 
 
 
1030 aa  50.8  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2885  NHL repeat-containing protein  33.04 
 
 
888 aa  50.4  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3865  NHL repeat-containing protein  27.96 
 
 
1177 aa  49.7  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1836  NHL repeat-containing protein  28.81 
 
 
906 aa  49.3  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2135  hypothetical protein  23.48 
 
 
326 aa  48.5  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  23.08 
 
 
1351 aa  48.5  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2977  NHL repeat containing protein  29.08 
 
 
665 aa  48.1  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0272113  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  23.63 
 
 
1834 aa  48.1  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1050  NHL repeat-containing protein  22.87 
 
 
318 aa  48.1  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.400914  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4004  ABC transporter related protein  29.51 
 
 
639 aa  47.8  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.774502  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2137  hypothetical protein  27.62 
 
 
322 aa  47.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.982688 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1056  NHL repeat-containing protein  22.27 
 
 
328 aa  47.4  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7287  serine/threonine protein kinase  24.5 
 
 
892 aa  47.8  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0443497  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1627  hypothetical protein  29.46 
 
 
451 aa  46.6  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.901467 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0841  NHL repeat containing protein  25.91 
 
 
621 aa  47  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.81979 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2265  NHL repeat-containing protein  27.49 
 
 
963 aa  46.6  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.397951  normal  0.439164 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  23.89 
 
 
1026 aa  46.2  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3272  NHL repeat containing protein  34.72 
 
 
1095 aa  46.2  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333117  normal  0.0421668 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1402  NHL repeat containing protein  23.99 
 
 
470 aa  45.8  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.649211  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3219  hypothetical protein  25.4 
 
 
318 aa  44.3  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116128  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3112  NHL repeat containing protein  29.19 
 
 
436 aa  43.9  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4185  serine/threonine protein kinase  23.19 
 
 
719 aa  43.5  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  24.91 
 
 
1292 aa  43.1  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0370  Fibronectin type III domain protein  24.48 
 
 
841 aa  43.1  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.800383  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0567  Redoxin domain protein  23.56 
 
 
498 aa  42.7  0.008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1383  serine/threonine protein kinase  25.43 
 
 
678 aa  42.7  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0132851 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0241  tetratricopeptide repeat domain protein  28.26 
 
 
668 aa  42.7  0.009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.113606  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0408  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.75 
 
 
693 aa  42.7  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.785735  normal  0.15039 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2272  glycoside hydrolase family 26  24.81 
 
 
711 aa  42.4  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.738347  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3843  NHL repeat containing protein  27.21 
 
 
1046 aa  42.4  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0246016 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>