168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1402 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1402  NHL repeat containing protein  100 
 
 		 470 aa  936    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.649211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00583  hypothetical protein  67.09 
 
 		 472 aa  610  1e-173  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0567  Redoxin domain protein  34.69 
 
 		 498 aa  234  3e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1286  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.58 
 
 		 493 aa  218  2e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4099  NHL repeat containing protein  31.4 
 
 		 581 aa  212  1e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.649178  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3670  NHL repeat-containing protein  30.02 
 
 		 503 aa  203  6e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1718  NHL repeat-containing protein  32.16 
 
 		 487 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1280  NHL repeat-containing protein  31.02 
 
 		 504 aa  195  2e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.164299  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0097  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.05 
 
 		 612 aa  171  3e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.328632  hitchhiker  0.000931017 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2446  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.69 
 
 		 628 aa  169  7e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0385674 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0100  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.11 
 
 		 612 aa  169  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3901  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.7 
 
 		 641 aa  165  2.0000000000000002e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0173  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.96 
 
 		 639 aa  159  9e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772059 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35610  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  30.82 
 
 		 634 aa  147  5e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38790  Peroxiredoxin  29.9 
 
 		 644 aa  143  6e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.605672 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6967  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.03 
 
 		 612 aa  142  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.265007  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25270  NHL repeat protein  30.07 
 
 		 697 aa  142  1.9999999999999998e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.671028  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3914  NHL repeat-containing protein  28.81 
 
 		 672 aa  133  6e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19090  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  31.32 
 
 		 699 aa  130  5.0000000000000004e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.718374  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3207  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.24 
 
 		 688 aa  127  4.0000000000000003e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.23742  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3716  NHL repeat containing protein  28.74 
 
 		 674 aa  125  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4253  putative NHL repeat protein  30.61 
 
 		 584 aa  119  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.376441  normal  0.79365 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2063  NHL repeat containing protein  26.98 
 
 		 652 aa  114  5e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2779  hypothetical protein  31.16 
 
 		 1051 aa  100  7e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  32.69 
 
 		 1750 aa  96.3  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6443  NHL repeat containing protein  32.94 
 
 		 344 aa  93.2  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0027  Fibronectin type III domain protein  33.01 
 
 		 460 aa  90.9  5e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  30.39 
 
 		 1351 aa  85.5  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  30.63 
 
 		 1026 aa  81.6  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0408  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  31.94 
 
 		 693 aa  78.6  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.785735  normal  0.15039 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  28.23 
 
 		 1030 aa  76.6  0.0000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6664  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.74 
 
 		 623 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0960267  normal  0.0511098 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0074  thioredoxin-like protein  31.76 
 
 		 381 aa  76.3  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.246531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  30.43 
 
 		 1130 aa  76.3  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5960  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.74 
 
 		 625 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.690095 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5716  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.74 
 
 		 622 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.610944  normal  0.678998 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4602  Redoxin domain protein  29.93 
 
 		 188 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  27.89 
 
 		 522 aa  74.7  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4088  serine/threonine protein kinase  29.17 
 
 		 850 aa  73.9  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5033  redoxin domain-containing protein  28.86 
 
 		 581 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.807705  normal  0.724504 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0814  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.92 
 
 		 589 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0629136  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5325  redoxin domain-containing protein  29.17 
 
 		 592 aa  72.8  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.472956 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2329  NHL repeat containing protein  34.33 
 
 		 404 aa  72  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0716797  normal  0.125112 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3069  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.72 
 
 		 609 aa  72  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0869014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2265  NHL repeat-containing protein  30.13 
 
 		 963 aa  72.4  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.397951  normal  0.439164 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1587  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.54 
 
 		 619 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6244  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.54 
 
 		 619 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.681017  normal  0.800108 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  32.18 
 
 		 2296 aa  71.6  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6720  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.54 
 
 		 619 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0397  hypothetical protein  28.36 
 
 		 193 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.325766 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1791  NHL repeat containing protein  28.67 
 
 		 425 aa  71.2  0.00000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.326453  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5356  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.54 
 
 		 626 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.363536  normal  0.314037 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3458  redoxin domain-containing protein  31.3 
 
 		 193 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.255545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2053  Redoxin domain protein  26.99 
 
 		 589 aa  70.5  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0186949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7287  serine/threonine protein kinase  30.45 
 
 		 892 aa  70.5  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0443497  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3911  hypothetical protein  29.41 
 
 		 189 aa  69.7  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1359  NHL repeat containing protein  30.86 
 
 		 439 aa  69.3  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0515  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  33.33 
 
 		 576 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.136592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5143  redoxin domain-containing protein  27.21 
 
 		 197 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00131261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4615  redoxin domain-containing protein  27.21 
 
 		 197 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3290  redoxin domain-containing protein  28.57 
 
 		 178 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.680402  normal  0.588727 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4089  serine/threonine protein kinase  30.24 
 
 		 772 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2917  NHL repeat containing protein  26.23 
 
 		 623 aa  68.9  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.304592  normal  0.453442 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5424  redoxin domain-containing protein  28.87 
 
 		 604 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  26.21 
 
 		 346 aa  67.8  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2277  Redoxin domain protein  27.61 
 
 		 591 aa  67.8  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182569  normal  0.459267 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1358  NHL repeat containing protein  27.68 
 
 		 646 aa  67.8  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.967304 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1170  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.22 
 
 		 596 aa  67.4  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.623408 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3111  redoxin  28.57 
 
 		 193 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5256  redoxin domain-containing protein  28.57 
 
 		 193 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5017  redoxin domain-containing protein  27.78 
 
 		 193 aa  67  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.150202  normal  0.769586 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0816  putative transmembrane protein  30 
 
 		 622 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.420472 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4169  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.26 
 
 		 200 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1839  hypothetical protein  27.45 
 
 		 249 aa  65.1  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3908  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  25.7 
 
 		 598 aa  63.9  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  24.08 
 
 		 752 aa  63.9  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0539  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.17 
 
 		 435 aa  63.2  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4063  NHL repeat-containing protein  28.37 
 
 		 1763 aa  63.2  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.512891  normal  0.666526 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5686  redoxin domain-containing protein  25.37 
 
 		 186 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.131775 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5707  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.4 
 
 		 403 aa  62  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.911728  normal  0.326453 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0890  hypothetical protein  25.46 
 
 		 310 aa  61.6  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1911  redoxin domain-containing protein  26.43 
 
 		 184 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.58722  normal  0.231287 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1812  NHL repeat containing protein  26.48 
 
 		 397 aa  61.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6172  Redoxin domain protein  24.49 
 
 		 187 aa  61.2  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4497  Redoxin domain protein  28.57 
 
 		 691 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0311  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.24 
 
 		 466 aa  60.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.359191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  26.51 
 
 		 1292 aa  60.8  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0817  redoxin domain-containing protein  24.48 
 
 		 369 aa  59.7  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.234537 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0299  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.53 
 
 		 466 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.257762  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2405  redoxin domain protein  25.71 
 
 		 178 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4426  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.28 
 
 		 596 aa  58.5  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2089  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  26.9 
 
 		 404 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.770973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  25.55 
 
 		 930 aa  58.5  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2010  redoxin domain-containing protein  23.57 
 
 		 178 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0109  NHL repeat containing protein  26.76 
 
 		 397 aa  57.4  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.894409 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0868  Redoxin domain protein  28.67 
 
 		 469 aa  57.8  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0468  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.76 
 
 		 589 aa  57.4  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00332396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04460  methionine-R-sulfoxide reductase/methionine-S-sulfoxide reductase  28.15 
 
 		 735 aa  57  0.0000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.361205  normal  0.714911 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  21.88 
 
 		 831 aa  56.6  0.0000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  21.92 
 
 		 676 aa  55.8  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>