292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2446 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_35610  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  65.24 
 
 		 634 aa  806    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6967  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  59.93 
 
 		 612 aa  668    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.265007  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3207  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  58.86 
 
 		 688 aa  734    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.23742  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3716  NHL repeat containing protein  56.14 
 
 		 674 aa  682    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0173  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  63.92 
 
 		 639 aa  766    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772059 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19090  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  54.57 
 
 		 699 aa  669    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.718374  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3914  NHL repeat-containing protein  54.65 
 
 		 672 aa  661    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3901  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  62.15 
 
 		 641 aa  755    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0097  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  58.35 
 
 		 612 aa  672    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.328632  hitchhiker  0.000931017 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2446  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  100 
 
 		 628 aa  1262    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0385674 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0100  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  57.21 
 
 		 612 aa  660    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38790  Peroxiredoxin  52.59 
 
 		 644 aa  588  1e-167  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.605672 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25270  NHL repeat protein  47.41 
 
 		 697 aa  555  1e-156  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.671028  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4253  putative NHL repeat protein  41.33 
 
 		 584 aa  375  1e-102  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.376441  normal  0.79365 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1286  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  41.61 
 
 		 493 aa  322  9.000000000000001e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3670  NHL repeat-containing protein  40.53 
 
 		 503 aa  312  1e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1280  NHL repeat-containing protein  40.97 
 
 		 504 aa  297  3e-79  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.164299  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4099  NHL repeat containing protein  36.62 
 
 		 581 aa  289  8e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.649178  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0567  Redoxin domain protein  36.77 
 
 		 498 aa  269  1e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1718  NHL repeat-containing protein  37.16 
 
 		 487 aa  221  3.9999999999999997e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1402  NHL repeat containing protein  33.41 
 
 		 470 aa  166  1.0000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.649211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00583  hypothetical protein  31.86 
 
 		 472 aa  145  2e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5686  redoxin domain-containing protein  44.53 
 
 		 186 aa  126  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.131775 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0397  hypothetical protein  43.75 
 
 		 193 aa  118  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.325766 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3458  redoxin domain-containing protein  42.96 
 
 		 193 aa  118  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.255545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5017  redoxin domain-containing protein  42.97 
 
 		 193 aa  117  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.150202  normal  0.769586 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3111  redoxin  42.97 
 
 		 193 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5256  redoxin domain-containing protein  42.97 
 
 		 193 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0539  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  38.81 
 
 		 435 aa  115  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5033  redoxin domain-containing protein  38.24 
 
 		 581 aa  115  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.807705  normal  0.724504 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3069  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.69 
 
 		 609 aa  114  5e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0869014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0868  Redoxin domain protein  41.01 
 
 		 469 aa  114  5e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5143  redoxin domain-containing protein  42.02 
 
 		 197 aa  114  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00131261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0814  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  37.04 
 
 		 589 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0629136  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4615  redoxin domain-containing protein  43.24 
 
 		 197 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0468  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  38.06 
 
 		 589 aa  112  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00332396  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4426  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.42 
 
 		 596 aa  112  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4602  Redoxin domain protein  38 
 
 		 188 aa  111  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5424  redoxin domain-containing protein  40.71 
 
 		 604 aa  110  6e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0817  redoxin domain-containing protein  37.31 
 
 		 369 aa  110  7.000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.234537 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0816  putative transmembrane protein  38.52 
 
 		 622 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.420472 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0299  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  37.14 
 
 		 466 aa  110  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.257762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1170  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  37.78 
 
 		 596 aa  109  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.623408 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0311  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  34.24 
 
 		 466 aa  109  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.359191  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2277  Redoxin domain protein  35.1 
 
 		 591 aa  109  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182569  normal  0.459267 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3911  hypothetical protein  36.84 
 
 		 189 aa  108  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0074  thioredoxin-like protein  39.42 
 
 		 381 aa  108  4e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.246531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4497  Redoxin domain protein  37.04 
 
 		 691 aa  107  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2053  Redoxin domain protein  34.44 
 
 		 589 aa  106  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0186949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0515  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  34.48 
 
 		 576 aa  106  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.136592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5325  redoxin domain-containing protein  34.44 
 
 		 592 aa  104  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.472956 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3496  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.66 
 
 		 570 aa  104  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.40474  normal  0.105344 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6172  Redoxin domain protein  38.3 
 
 		 187 aa  103  8e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2089  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  34.78 
 
 		 404 aa  103  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.770973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5707  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  34.78 
 
 		 403 aa  102  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.911728  normal  0.326453 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17110  cytochrome c biogenesis protein  33.54 
 
 		 659 aa  102  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.473762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3908  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  33.54 
 
 		 598 aa  101  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5356  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  37.78 
 
 		 626 aa  100  7e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.363536  normal  0.314037 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12889  integral membrane C-type cytochrome biogenesis protein dipZ  34.81 
 
 		 695 aa  99  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6664  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  37.78 
 
 		 623 aa  95.5  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0960267  normal  0.0511098 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2063  NHL repeat containing protein  34.68 
 
 		 652 aa  95.1  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1587  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  37.04 
 
 		 619 aa  94.7  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6244  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  37.04 
 
 		 619 aa  94.7  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.681017  normal  0.800108 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6720  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  37.04 
 
 		 619 aa  94.7  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5716  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  36.3 
 
 		 622 aa  94  8e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.610944  normal  0.678998 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5960  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  36.3 
 
 		 625 aa  93.6  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.690095 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1911  redoxin domain-containing protein  33.33 
 
 		 184 aa  91.7  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.58722  normal  0.231287 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4169  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.48 
 
 		 200 aa  90.5  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1359  NHL repeat containing protein  29.17 
 
 		 439 aa  90.1  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3290  redoxin domain-containing protein  33.06 
 
 		 178 aa  87.8  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.680402  normal  0.588727 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2405  redoxin domain protein  32.59 
 
 		 178 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2010  redoxin domain-containing protein  33.06 
 
 		 178 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  28.21 
 
 		 1130 aa  86.3  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1839  hypothetical protein  35 
 
 		 249 aa  84  0.000000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2779  hypothetical protein  27.09 
 
 		 1051 aa  82.8  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0408  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.95 
 
 		 693 aa  81.6  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.785735  normal  0.15039 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  32.44 
 
 		 2296 aa  82  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7287  serine/threonine protein kinase  28.98 
 
 		 892 aa  79.7  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0443497  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0027  Fibronectin type III domain protein  31.23 
 
 		 460 aa  77  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4088  serine/threonine protein kinase  29.41 
 
 		 850 aa  75.9  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2265  NHL repeat-containing protein  30.19 
 
 		 963 aa  75.9  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.397951  normal  0.439164 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1358  NHL repeat containing protein  29.74 
 
 		 646 aa  75.1  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.967304 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  27.6 
 
 		 1030 aa  74.3  0.000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  31.02 
 
 		 1750 aa  73.6  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0625  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.61 
 
 		 445 aa  69.7  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.254144  normal  0.888006 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2917  NHL repeat containing protein  28.1 
 
 		 623 aa  69.3  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.304592  normal  0.453442 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0211  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.94 
 
 		 187 aa  68.9  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.506232  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4185  serine/threonine protein kinase  27.56 
 
 		 719 aa  68.9  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1791  NHL repeat containing protein  26.47 
 
 		 425 aa  68.2  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.326453  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.33 
 
 		 1292 aa  68.2  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0192  hypothetical protein  35.94 
 
 		 187 aa  67.8  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  28.57 
 
 		 1351 aa  67  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0721  cytochrome C biogenesis protein  31.58 
 
 		 403 aa  64.7  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1501  hypothetical protein  33.33 
 
 		 190 aa  64.3  0.000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.223609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2082  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.33 
 
 		 380 aa  63.5  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0739  putative cytochrome C-type biogenesis protein  30.7 
 
 		 403 aa  63.5  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0112308  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6264  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.09 
 
 		 173 aa  62.8  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.92814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2276  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.48 
 
 		 342 aa  62  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.54286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4063  NHL repeat-containing protein  25.79 
 
 		 1763 aa  61.6  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.512891  normal  0.666526 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  23.1 
 
 		 346 aa  61.2  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>