28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1812 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1812  NHL repeat containing protein  100 
 
 		 397 aa  815    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0109  NHL repeat containing protein  69.31 
 
 		 397 aa  583  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.894409 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0113  NHL repeat containing protein  69.57 
 
 		 397 aa  584  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0790  NHL repeat-containing protein  66.08 
 
 		 395 aa  556  1e-157  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.395295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4601  NHL repeat-containing protein  63.9 
 
 		 390 aa  513  1e-144  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3874  NHL repeat containing protein  63.9 
 
 		 388 aa  509  1e-143  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0711  NHL repeat protein  54.91 
 
 		 398 aa  402  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0859  NHL repeat containing protein  54.91 
 
 		 398 aa  402  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3754  NHL repeat containing protein  52.14 
 
 		 398 aa  395  1e-109  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3206  NHL repeat-containing protein  54.3 
 
 		 419 aa  391  1e-107  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0470  hypothetical protein  51.36 
 
 		 371 aa  381  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.043698 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3798  NHL repeat-containing protein  43.79 
 
 		 367 aa  277  2e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.88272 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0477  NHL repeat containing protein  42.05 
 
 		 368 aa  265  8e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.517472  normal  0.232991 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1073  NHL repeat-containing protein  42.3 
 
 		 362 aa  253  5.000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0871328  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3229  NHL repeat containing protein  41.21 
 
 		 380 aa  251  1e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.657691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2370  NHL repeat-containing protein  39.73 
 
 		 397 aa  243  3e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0112642 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3876  NHL repeat containing protein  36.49 
 
 		 379 aa  219  7e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1402  NHL repeat containing protein  26.48 
 
 		 470 aa  61.6  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.649211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  26.26 
 
 		 1026 aa  57  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2272  glycoside hydrolase family 26  27.27 
 
 		 711 aa  53.1  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.738347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  26.46 
 
 		 1750 aa  52  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  24.25 
 
 		 1079 aa  51.2  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2063  NHL repeat containing protein  22.67 
 
 		 652 aa  48.5  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1718  NHL repeat-containing protein  30.77 
 
 		 487 aa  48.9  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00583  hypothetical protein  23.83 
 
 		 472 aa  47.8  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4099  NHL repeat containing protein  25.91 
 
 		 581 aa  47.8  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.649178  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1869  NHL repeat containing protein  23.81 
 
 		 307 aa  46.6  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  24.82 
 
 		 522 aa  45.1  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>