24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4601 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014248  Aazo_3874  NHL repeat containing protein  77.58 
 
 
388 aa  638    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4601  NHL repeat-containing protein  100 
 
 
390 aa  800    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0109  NHL repeat containing protein  66.76 
 
 
397 aa  525  1e-148  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.894409 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0113  NHL repeat containing protein  67.02 
 
 
397 aa  526  1e-148  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0790  NHL repeat-containing protein  66.93 
 
 
395 aa  516  1.0000000000000001e-145  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.395295  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1812  NHL repeat containing protein  63.9 
 
 
397 aa  513  1e-144  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0859  NHL repeat containing protein  52.81 
 
 
398 aa  389  1e-107  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0711  NHL repeat protein  52.81 
 
 
398 aa  389  1e-107  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3206  NHL repeat-containing protein  53.23 
 
 
419 aa  389  1e-107  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3754  NHL repeat containing protein  49.73 
 
 
398 aa  374  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0470  hypothetical protein  49.06 
 
 
371 aa  361  1e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.043698 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0477  NHL repeat containing protein  45.58 
 
 
368 aa  281  1e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.517472  normal  0.232991 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3798  NHL repeat-containing protein  45.22 
 
 
367 aa  280  2e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.88272 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2370  NHL repeat-containing protein  42.9 
 
 
397 aa  251  1e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0112642 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3229  NHL repeat containing protein  42.42 
 
 
380 aa  248  1e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.657691  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1073  NHL repeat-containing protein  43.21 
 
 
362 aa  246  4e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0871328  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3876  NHL repeat containing protein  35.26 
 
 
379 aa  208  1e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2063  NHL repeat containing protein  29.59 
 
 
652 aa  49.7  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  24.2 
 
 
1079 aa  49.7  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2272  glycoside hydrolase family 26  27.85 
 
 
711 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.738347  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  27.44 
 
 
1750 aa  47.4  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1402  NHL repeat containing protein  22.33 
 
 
470 aa  46.2  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.649211  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  26.83 
 
 
1163 aa  44.7  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  25.98 
 
 
1146 aa  44.3  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>