41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_3206 on replicon NC_008036
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008036  Sala_3206  NHL repeat-containing protein  100 
 
 		 419 aa  847    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0859  NHL repeat containing protein  55.95 
 
 		 398 aa  397  1e-109  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0711  NHL repeat protein  55.95 
 
 		 398 aa  397  1e-109  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0109  NHL repeat containing protein  51.9 
 
 		 397 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.894409 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0113  NHL repeat containing protein  51.39 
 
 		 397 aa  394  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0790  NHL repeat-containing protein  53.62 
 
 		 395 aa  394  1e-108  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.395295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1812  NHL repeat containing protein  54.3 
 
 		 397 aa  391  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4601  NHL repeat-containing protein  53.23 
 
 		 390 aa  389  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3874  NHL repeat containing protein  51.35 
 
 		 388 aa  379  1e-104  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3754  NHL repeat containing protein  51.76 
 
 		 398 aa  375  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0470  hypothetical protein  51.76 
 
 		 371 aa  366  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.043698 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3798  NHL repeat-containing protein  44.85 
 
 		 367 aa  286  2.9999999999999996e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.88272 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3229  NHL repeat containing protein  47.43 
 
 		 380 aa  277  3e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.657691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1073  NHL repeat-containing protein  47.08 
 
 		 362 aa  274  3e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0871328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2370  NHL repeat-containing protein  43.18 
 
 		 397 aa  256  8e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0112642 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0477  NHL repeat containing protein  41.74 
 
 		 368 aa  250  3e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.517472  normal  0.232991 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3876  NHL repeat containing protein  34.96 
 
 		 379 aa  194  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2063  NHL repeat containing protein  26.34 
 
 		 652 aa  57.8  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  25.7 
 
 		 1351 aa  52  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  23.21 
 
 		 1079 aa  51.2  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  23.32 
 
 		 522 aa  49.3  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  24.57 
 
 		 1030 aa  48.9  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2917  NHL repeat containing protein  26.05 
 
 		 623 aa  49.3  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.304592  normal  0.453442 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  29.61 
 
 		 1750 aa  48.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2272  glycoside hydrolase family 26  27.67 
 
 		 711 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.738347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  29.08 
 
 		 1146 aa  47.8  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7287  serine/threonine protein kinase  31.82 
 
 		 892 aa  47.4  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0443497  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  27.57 
 
 		 1026 aa  47  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4088  serine/threonine protein kinase  32.16 
 
 		 850 aa  47  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1611  Fibronectin type III domain protein  28.83 
 
 		 805 aa  47  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.000457229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4089  serine/threonine protein kinase  34.25 
 
 		 772 aa  46.2  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1718  NHL repeat-containing protein  25.14 
 
 		 487 aa  46.2  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0027  Fibronectin type III domain protein  34.18 
 
 		 460 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2265  NHL repeat-containing protein  27.57 
 
 		 963 aa  44.7  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.397951  normal  0.439164 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0925  hypothetical protein  29.91 
 
 		 291 aa  44.7  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.759797  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4004  ABC transporter related protein  23.77 
 
 		 639 aa  44.7  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.774502  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0860  hypothetical protein  29.91 
 
 		 291 aa  44.7  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.790744  normal  0.441681 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  23.66 
 
 		 831 aa  44.3  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1861  Phage tail protein  27.89 
 
 		 747 aa  43.9  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3225  NHL repeat-containing protein  26.27 
 
 		 365 aa  43.9  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0995  hypothetical protein  29.91 
 
 		 295 aa  43.9  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.83417 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>