31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_0109 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_0109  NHL repeat containing protein  100 
 
 
397 aa  814    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.894409 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0113  NHL repeat containing protein  98.24 
 
 
397 aa  802    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1812  NHL repeat containing protein  69.31 
 
 
397 aa  583  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0790  NHL repeat-containing protein  68.7 
 
 
395 aa  569  1e-161  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.395295  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4601  NHL repeat-containing protein  66.76 
 
 
390 aa  525  1e-148  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3874  NHL repeat containing protein  65.51 
 
 
388 aa  521  1e-147  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0859  NHL repeat containing protein  54.93 
 
 
398 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0711  NHL repeat protein  54.93 
 
 
398 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3206  NHL repeat-containing protein  51.9 
 
 
419 aa  397  1e-109  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3754  NHL repeat containing protein  50.53 
 
 
398 aa  383  1e-105  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0470  hypothetical protein  49.86 
 
 
371 aa  374  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.043698 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3798  NHL repeat-containing protein  43.36 
 
 
367 aa  279  7e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.88272 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0477  NHL repeat containing protein  42.93 
 
 
368 aa  258  1e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.517472  normal  0.232991 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3229  NHL repeat containing protein  42.08 
 
 
380 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.657691  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1073  NHL repeat-containing protein  40.66 
 
 
362 aa  234  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0871328  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2370  NHL repeat-containing protein  38.9 
 
 
397 aa  233  5e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0112642 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3876  NHL repeat containing protein  38.26 
 
 
379 aa  212  7.999999999999999e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  24.4 
 
 
1079 aa  59.3  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2063  NHL repeat containing protein  24.67 
 
 
652 aa  58.5  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2272  glycoside hydrolase family 26  29.2 
 
 
711 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.738347  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1402  NHL repeat containing protein  26.76 
 
 
470 aa  57.4  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.649211  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  26.85 
 
 
522 aa  53.9  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1280  NHL repeat-containing protein  24.34 
 
 
504 aa  52.4  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.164299  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00583  hypothetical protein  27.85 
 
 
472 aa  52  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2917  NHL repeat containing protein  26.36 
 
 
623 aa  51.2  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.304592  normal  0.453442 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4099  NHL repeat containing protein  25.29 
 
 
581 aa  48.9  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.649178  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1718  NHL repeat-containing protein  26.97 
 
 
487 aa  46.2  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0027  Fibronectin type III domain protein  27.85 
 
 
460 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4004  ABC transporter related protein  32.48 
 
 
639 aa  44.7  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.774502  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4088  serine/threonine protein kinase  27.04 
 
 
850 aa  43.9  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527089  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0359  NHL repeat-containing protein  23.75 
 
 
448 aa  43.5  0.007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.570534 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>