More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_4099 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_4099  NHL repeat containing protein  100 
 
 
581 aa  1198    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.649178  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3670  NHL repeat-containing protein  49.51 
 
 
503 aa  492  9.999999999999999e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1286  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  48.41 
 
 
493 aa  479  1e-134  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1280  NHL repeat-containing protein  44.82 
 
 
504 aa  418  9.999999999999999e-116  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.164299  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1718  NHL repeat-containing protein  41.72 
 
 
487 aa  360  3e-98  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0097  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  40 
 
 
612 aa  327  4.0000000000000003e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.328632  hitchhiker  0.000931017 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0100  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  40.2 
 
 
612 aa  322  9.000000000000001e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38790  Peroxiredoxin  38.01 
 
 
644 aa  310  2.9999999999999997e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.605672 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6967  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  40.55 
 
 
612 aa  301  3e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.265007  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0567  Redoxin domain protein  33.8 
 
 
498 aa  290  5.0000000000000004e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2446  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.62 
 
 
628 aa  289  8e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0385674 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25270  NHL repeat protein  38.69 
 
 
697 aa  285  2.0000000000000002e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.671028  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35610  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  34.3 
 
 
634 aa  282  1e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3914  NHL repeat-containing protein  35.32 
 
 
672 aa  280  7e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0173  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.78 
 
 
639 aa  278  3e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00772059 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4253  putative NHL repeat protein  35.81 
 
 
584 aa  276  1.0000000000000001e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.376441  normal  0.79365 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3716  NHL repeat containing protein  34.01 
 
 
674 aa  272  2e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3207  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.31 
 
 
688 aa  266  8e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.23742  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19090  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  36.86 
 
 
699 aa  265  1e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.718374  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3901  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.31 
 
 
641 aa  263  6e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00583  hypothetical protein  31.78 
 
 
472 aa  211  4e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1402  NHL repeat containing protein  31.4 
 
 
470 aa  198  2.0000000000000003e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.649211  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2277  Redoxin domain protein  45.86 
 
 
591 aa  144  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182569  normal  0.459267 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2053  Redoxin domain protein  44.19 
 
 
589 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0186949  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5325  redoxin domain-containing protein  44.74 
 
 
592 aa  135  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.472956 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0468  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  43.62 
 
 
589 aa  135  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00332396  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2063  NHL repeat containing protein  32.05 
 
 
652 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5707  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  43.75 
 
 
403 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.911728  normal  0.326453 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4426  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  46.04 
 
 
596 aa  128  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0539  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  41.72 
 
 
435 aa  128  3e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2089  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  43.75 
 
 
404 aa  128  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.770973  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0816  putative transmembrane protein  42.18 
 
 
622 aa  127  7e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.420472 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5424  redoxin domain-containing protein  39.55 
 
 
604 aa  125  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0397  hypothetical protein  43.38 
 
 
193 aa  124  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.325766 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4497  Redoxin domain protein  38.69 
 
 
691 aa  124  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5686  redoxin domain-containing protein  39.86 
 
 
186 aa  124  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.131775 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5356  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  42.45 
 
 
626 aa  124  6e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.363536  normal  0.314037 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3908  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  37.02 
 
 
598 aa  123  9e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3911  hypothetical protein  42.86 
 
 
189 aa  123  9e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3069  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.43 
 
 
609 aa  123  9e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0869014  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0868  Redoxin domain protein  41.43 
 
 
469 aa  123  9.999999999999999e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6664  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  40.37 
 
 
623 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0960267  normal  0.0511098 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6172  Redoxin domain protein  36.27 
 
 
187 aa  122  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6720  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  41.33 
 
 
619 aa  121  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1587  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  40.79 
 
 
619 aa  121  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6244  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  40.79 
 
 
619 aa  121  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.681017  normal  0.800108 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5143  redoxin domain-containing protein  40.43 
 
 
197 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00131261  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3111  redoxin  41.84 
 
 
193 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5256  redoxin domain-containing protein  41.84 
 
 
193 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4615  redoxin domain-containing protein  40.43 
 
 
197 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1170  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  37.5 
 
 
596 aa  120  6e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.623408 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5716  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  42.45 
 
 
622 aa  120  6e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.610944  normal  0.678998 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5033  redoxin domain-containing protein  39.6 
 
 
581 aa  120  7e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.807705  normal  0.724504 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5960  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  42.45 
 
 
625 aa  120  9e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.690095 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4602  Redoxin domain protein  39.58 
 
 
188 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0814  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  39.33 
 
 
589 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0629136  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5017  redoxin domain-containing protein  41.13 
 
 
193 aa  118  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.150202  normal  0.769586 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0515  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  39.04 
 
 
576 aa  117  5e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.136592  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3458  redoxin domain-containing protein  45.67 
 
 
193 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.255545  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0074  thioredoxin-like protein  32.26 
 
 
381 aa  110  8.000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.246531  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2405  redoxin domain protein  39.29 
 
 
178 aa  108  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0299  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  37.76 
 
 
466 aa  108  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.257762  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3290  redoxin domain-containing protein  38.57 
 
 
178 aa  106  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.680402  normal  0.588727 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0311  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  37.06 
 
 
466 aa  106  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.359191  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  30.97 
 
 
1750 aa  105  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0817  redoxin domain-containing protein  37.86 
 
 
369 aa  105  3e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.234537 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1911  redoxin domain-containing protein  36.43 
 
 
184 aa  104  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.58722  normal  0.231287 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4169  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.71 
 
 
200 aa  104  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12889  integral membrane C-type cytochrome biogenesis protein dipZ  36.36 
 
 
695 aa  104  6e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17110  cytochrome c biogenesis protein  35.81 
 
 
659 aa  103  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.473762  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2010  redoxin domain-containing protein  37.14 
 
 
178 aa  103  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0027  Fibronectin type III domain protein  32.34 
 
 
460 aa  102  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2779  hypothetical protein  28.36 
 
 
1051 aa  99  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  26.54 
 
 
1030 aa  98.6  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6443  NHL repeat containing protein  29.89 
 
 
344 aa  95.9  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2265  NHL repeat-containing protein  29.94 
 
 
963 aa  94  7e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.397951  normal  0.439164 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3496  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.51 
 
 
570 aa  93.6  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.40474  normal  0.105344 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  29.97 
 
 
1351 aa  90.1  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1359  NHL repeat containing protein  28.78 
 
 
439 aa  88.2  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1791  NHL repeat containing protein  28.02 
 
 
425 aa  84.7  0.000000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.326453  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1839  hypothetical protein  28.48 
 
 
249 aa  84.7  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  28.48 
 
 
2296 aa  84  0.000000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2917  NHL repeat containing protein  28.53 
 
 
623 aa  83.6  0.000000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.304592  normal  0.453442 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1358  NHL repeat containing protein  28.27 
 
 
646 aa  80.1  0.00000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.967304 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.74 
 
 
1292 aa  78.2  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4088  serine/threonine protein kinase  27.41 
 
 
850 aa  75.9  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527089  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  27.39 
 
 
1026 aa  75.1  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7287  serine/threonine protein kinase  26.28 
 
 
892 aa  75.1  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0443497  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0408  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.53 
 
 
693 aa  72.8  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.785735  normal  0.15039 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0760  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.22 
 
 
228 aa  70.5  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.173874 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  26.97 
 
 
1130 aa  70.5  0.00000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0625  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.36 
 
 
445 aa  68.6  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.254144  normal  0.888006 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4063  NHL repeat-containing protein  25 
 
 
1763 aa  68.2  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.512891  normal  0.666526 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2724  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.59 
 
 
188 aa  68.2  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.32328  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4444  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.39 
 
 
196 aa  67.4  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.133035 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  26.77 
 
 
1079 aa  67.8  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  24.56 
 
 
930 aa  65.9  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1501  hypothetical protein  31.25 
 
 
190 aa  63.9  0.000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.223609  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2082  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.33 
 
 
380 aa  63.5  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1376  hypothetical protein  31.93 
 
 
181 aa  63.5  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>