More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_17110 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_17110  cytochrome c biogenesis protein  100 
 
 
659 aa  1328    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.473762  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12889  integral membrane C-type cytochrome biogenesis protein dipZ  49.77 
 
 
695 aa  602  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3496  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  49.26 
 
 
570 aa  486  1e-136  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.40474  normal  0.105344 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4497  Redoxin domain protein  31 
 
 
691 aa  240  5.999999999999999e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5424  redoxin domain-containing protein  30.97 
 
 
604 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1170  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.53 
 
 
596 aa  234  3e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.623408 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0468  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.98 
 
 
589 aa  232  2e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00332396  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0816  putative transmembrane protein  29.72 
 
 
622 aa  227  6e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.420472 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5325  redoxin domain-containing protein  30.28 
 
 
592 aa  224  3e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.472956 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2277  Redoxin domain protein  32.22 
 
 
591 aa  222  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182569  normal  0.459267 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5033  redoxin domain-containing protein  30.23 
 
 
581 aa  217  7e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.807705  normal  0.724504 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5960  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.11 
 
 
625 aa  216  9e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.690095 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5716  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.93 
 
 
622 aa  214  4.9999999999999996e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.610944  normal  0.678998 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1587  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.29 
 
 
619 aa  211  4e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6244  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.29 
 
 
619 aa  211  4e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.681017  normal  0.800108 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6720  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.05 
 
 
619 aa  209  9e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2053  Redoxin domain protein  30.35 
 
 
589 aa  208  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0186949  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6664  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.26 
 
 
623 aa  207  6e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0960267  normal  0.0511098 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3069  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.72 
 
 
609 aa  205  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0869014  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0539  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  36.12 
 
 
435 aa  204  6e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2089  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.64 
 
 
404 aa  201  3e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.770973  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0814  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.26 
 
 
589 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0629136  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0299  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.98 
 
 
466 aa  192  1e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.257762  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5707  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.87 
 
 
403 aa  193  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.911728  normal  0.326453 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0868  Redoxin domain protein  33 
 
 
469 aa  193  1e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0311  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.55 
 
 
466 aa  188  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.359191  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3908  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.78 
 
 
598 aa  188  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5356  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  34.03 
 
 
626 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.363536  normal  0.314037 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0817  redoxin domain-containing protein  31.76 
 
 
369 aa  179  2e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.234537 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4615  redoxin domain-containing protein  53.64 
 
 
197 aa  177  7e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5143  redoxin domain-containing protein  52.98 
 
 
197 aa  174  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00131261  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0515  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.96 
 
 
576 aa  173  7.999999999999999e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.136592  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4426  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.17 
 
 
596 aa  170  6e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5017  redoxin domain-containing protein  51.3 
 
 
193 aa  170  7e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.150202  normal  0.769586 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3911  hypothetical protein  48.73 
 
 
189 aa  168  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3111  redoxin  50.31 
 
 
193 aa  169  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5256  redoxin domain-containing protein  50.31 
 
 
193 aa  169  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5686  redoxin domain-containing protein  53.29 
 
 
186 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.131775 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6172  Redoxin domain protein  51.35 
 
 
187 aa  167  4e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1911  redoxin domain-containing protein  46.41 
 
 
184 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.58722  normal  0.231287 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3458  redoxin domain-containing protein  54.68 
 
 
193 aa  165  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.255545  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0074  thioredoxin-like protein  34.04 
 
 
381 aa  163  1e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.246531  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0397  hypothetical protein  50.65 
 
 
193 aa  162  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.325766 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4602  Redoxin domain protein  50.68 
 
 
188 aa  162  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2405  redoxin domain protein  45.1 
 
 
178 aa  156  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3290  redoxin domain-containing protein  45.1 
 
 
178 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.680402  normal  0.588727 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2010  redoxin domain-containing protein  44.44 
 
 
178 aa  154  7e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4169  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  46.9 
 
 
200 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1839  hypothetical protein  28.57 
 
 
249 aa  116  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25270  NHL repeat protein  34.16 
 
 
697 aa  104  4e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.671028  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6967  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.37 
 
 
612 aa  104  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.265007  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38790  Peroxiredoxin  36.99 
 
 
644 aa  103  7e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.605672 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4099  NHL repeat containing protein  35.81 
 
 
581 aa  103  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.649178  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2446  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.54 
 
 
628 aa  102  2e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0385674 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1286  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.67 
 
 
493 aa  102  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0100  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.3 
 
 
612 aa  102  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0097  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.3 
 
 
612 aa  100  7e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.328632  hitchhiker  0.000931017 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3670  NHL repeat-containing protein  30.23 
 
 
503 aa  98.6  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3914  NHL repeat-containing protein  34.75 
 
 
672 aa  99  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19090  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  35.25 
 
 
699 aa  98.2  4e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.718374  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3901  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.97 
 
 
641 aa  97.8  5e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3716  NHL repeat containing protein  34.75 
 
 
674 aa  97.8  5e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0173  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.25 
 
 
639 aa  97.4  8e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00772059 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35610  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  33.81 
 
 
634 aa  96.3  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3207  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.53 
 
 
688 aa  93.6  9e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.23742  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1221  peroxiredoxin-like protein  35.95 
 
 
173 aa  89.4  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0547  peroxiredoxin-like protein  38.06 
 
 
168 aa  87.8  6e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1280  NHL repeat-containing protein  32.47 
 
 
504 aa  86.3  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.164299  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1851  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  24.09 
 
 
409 aa  80.9  0.00000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04380  cytochrome c biogenesis protein  21.26 
 
 
396 aa  79  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181653 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4253  putative NHL repeat protein  33.09 
 
 
584 aa  76.6  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.376441  normal  0.79365 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0721  cytochrome C biogenesis protein  20.5 
 
 
403 aa  73.9  0.000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0625  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  24.55 
 
 
445 aa  72  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.254144  normal  0.888006 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0739  putative cytochrome C-type biogenesis protein  19.42 
 
 
403 aa  70.9  0.00000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0112308  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04460  methionine-R-sulfoxide reductase/methionine-S-sulfoxide reductase  24.22 
 
 
735 aa  70.5  0.0000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.361205  normal  0.714911 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0567  Redoxin domain protein  27.7 
 
 
498 aa  70.1  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1818  redoxin domain-containing protein  29.8 
 
 
165 aa  68.6  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.165387  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2261  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.07 
 
 
191 aa  68.2  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.124304  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1566  hypothetical protein  34.33 
 
 
172 aa  67.8  0.0000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2903  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.67 
 
 
184 aa  67.4  0.0000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2222  thiol-disulfide oxidoreductase  29.01 
 
 
174 aa  66.2  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000493791  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1857  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.71 
 
 
280 aa  65.1  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1718  NHL repeat-containing protein  28.16 
 
 
487 aa  65.1  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0760  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.52 
 
 
228 aa  64.7  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.173874 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1358  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.91 
 
 
179 aa  64.7  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000315647  hitchhiker  0.00000356135 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0475  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.4 
 
 
173 aa  64.3  0.000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2111  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.17 
 
 
390 aa  64.3  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.245531  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3817  thiol-disulfide oxidoreductase  31.78 
 
 
173 aa  63.5  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000518727 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4444  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.08 
 
 
196 aa  63.5  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.133035 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4485  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.43 
 
 
264 aa  62.8  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2559  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.18 
 
 
239 aa  63.2  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.608237  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4901  Redoxin domain protein  34.11 
 
 
165 aa  63.2  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.273187  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1566  thiol-disulfide oxidoreductase  31.78 
 
 
173 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.62392e-19 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4448  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.38 
 
 
382 aa  62.8  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.510113  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0399  thiol-disulfide oxidoreductase  31.97 
 
 
174 aa  62.8  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18200  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.33 
 
 
178 aa  62.4  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000397372  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1355  thiol-disulfide oxidoreductase  31.78 
 
 
173 aa  62  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3317  AhpC/TSA family protein  29.13 
 
 
191 aa  62.4  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1494  thiol-disulfide oxidoreductase  31.78 
 
 
173 aa  62  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3298  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30 
 
 
191 aa  62.4  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.61408  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>