More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_6172 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_6172  Redoxin domain protein  100 
 
 		 187 aa  389  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3911  hypothetical protein  66.26 
 
 		 189 aa  233  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4602  Redoxin domain protein  66.67 
 
 		 188 aa  226  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5686  redoxin domain-containing protein  61.04 
 
 		 186 aa  209  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.131775 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0816  putative transmembrane protein  61.9 
 
 		 622 aa  209  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.420472 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0397  hypothetical protein  60 
 
 		 193 aa  207  7e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.325766 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3458  redoxin domain-containing protein  54.65 
 
 		 193 aa  206  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.255545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4497  Redoxin domain protein  61.9 
 
 		 691 aa  206  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5017  redoxin domain-containing protein  60 
 
 		 193 aa  206  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.150202  normal  0.769586 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4615  redoxin domain-containing protein  58.55 
 
 		 197 aa  205  3e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5143  redoxin domain-containing protein  57.89 
 
 		 197 aa  202  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00131261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3111  redoxin  58.55 
 
 		 193 aa  202  3e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5256  redoxin domain-containing protein  58.55 
 
 		 193 aa  202  3e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2053  Redoxin domain protein  54.86 
 
 		 589 aa  200  8e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0186949  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2277  Redoxin domain protein  56.88 
 
 		 591 aa  200  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182569  normal  0.459267 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3069  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  56.73 
 
 		 609 aa  200  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0869014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5325  redoxin domain-containing protein  59.72 
 
 		 592 aa  198  3e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.472956 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5424  redoxin domain-containing protein  54.19 
 
 		 604 aa  198  5e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6664  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  60.71 
 
 		 623 aa  194  7e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0960267  normal  0.0511098 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0539  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  55.41 
 
 		 435 aa  193  1e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0468  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  53.85 
 
 		 589 aa  191  5e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00332396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1170  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  58.33 
 
 		 596 aa  191  8e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.623408 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0311  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  59.29 
 
 		 466 aa  190  1e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.359191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0299  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  59.29 
 
 		 466 aa  189  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.257762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5707  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  57.75 
 
 		 403 aa  189  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.911728  normal  0.326453 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5960  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  55.97 
 
 		 625 aa  189  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.690095 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1587  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  54.49 
 
 		 619 aa  188  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6244  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  54.49 
 
 		 619 aa  188  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.681017  normal  0.800108 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5716  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  55.97 
 
 		 622 aa  188  4e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.610944  normal  0.678998 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6720  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  57.52 
 
 		 619 aa  188  4e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3908  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  55.86 
 
 		 598 aa  188  5e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2089  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  56.55 
 
 		 404 aa  188  5e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.770973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5033  redoxin domain-containing protein  57.04 
 
 		 581 aa  187  8e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.807705  normal  0.724504 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5356  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  60.56 
 
 		 626 aa  187  8e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.363536  normal  0.314037 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0868  Redoxin domain protein  57.14 
 
 		 469 aa  185  4e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4169  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  50.91 
 
 		 200 aa  183  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0814  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  54.23 
 
 		 589 aa  180  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0629136  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4426  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  57.14 
 
 		 596 aa  178  4.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0817  redoxin domain-containing protein  46.52 
 
 		 369 aa  174  8e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.234537 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2405  redoxin domain protein  53.57 
 
 		 178 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1911  redoxin domain-containing protein  45.3 
 
 		 184 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.58722  normal  0.231287 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3290  redoxin domain-containing protein  52.14 
 
 		 178 aa  168  5e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.680402  normal  0.588727 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12889  integral membrane C-type cytochrome biogenesis protein dipZ  51.05 
 
 		 695 aa  167  5e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17110  cytochrome c biogenesis protein  51.35 
 
 		 659 aa  167  1e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.473762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0515  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  42.77 
 
 		 576 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.136592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2010  redoxin domain-containing protein  41.67 
 
 		 178 aa  160  7e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0074  thioredoxin-like protein  42.86 
 
 		 381 aa  160  1e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.246531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3496  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  46.62 
 
 		 570 aa  142  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.40474  normal  0.105344 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1839  hypothetical protein  41.5 
 
 		 249 aa  135  4e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1286  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  39.44 
 
 		 493 aa  124  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4099  NHL repeat containing protein  36.27 
 
 		 581 aa  122  3e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.649178  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3670  NHL repeat-containing protein  39.04 
 
 		 503 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1280  NHL repeat-containing protein  38.73 
 
 		 504 aa  112  5e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.164299  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0173  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  40.3 
 
 		 639 aa  109  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772059 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1718  NHL repeat-containing protein  38.73 
 
 		 487 aa  107  1e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25270  NHL repeat protein  38.3 
 
 		 697 aa  107  1e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.671028  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3914  NHL repeat-containing protein  42.54 
 
 		 672 aa  107  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3207  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  38.81 
 
 		 688 aa  106  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.23742  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19090  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  40.3 
 
 		 699 aa  106  2e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.718374  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38790  Peroxiredoxin  38.27 
 
 		 644 aa  106  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.605672 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35610  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  36.88 
 
 		 634 aa  106  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3716  NHL repeat containing protein  42.54 
 
 		 674 aa  105  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2446  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  38.3 
 
 		 628 aa  103  1e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0385674 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0097  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.32 
 
 		 612 aa  103  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.328632  hitchhiker  0.000931017 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0100  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.32 
 
 		 612 aa  103  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3901  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  38.1 
 
 		 641 aa  102  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6967  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.57 
 
 		 612 aa  99  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.265007  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0567  Redoxin domain protein  35.9 
 
 		 498 aa  98.2  5e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4253  putative NHL repeat protein  38.21 
 
 		 584 aa  92.4  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.376441  normal  0.79365 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1221  peroxiredoxin-like protein  30.26 
 
 		 173 aa  83.6  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0217  redoxin domain-containing protein  35.14 
 
 		 171 aa  80.9  0.000000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.219465 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2412  Redoxin domain protein  26.92 
 
 		 167 aa  80.1  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0270  putative transmembrane protein  34.46 
 
 		 174 aa  79  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1223  hypothetical protein  31.25 
 
 		 172 aa  75.5  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4901  Redoxin domain protein  36.29 
 
 		 165 aa  75.9  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.273187  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0181  alkyl hydroperoxide reductase  30.82 
 
 		 183 aa  75.1  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0243778  normal  0.461108 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3927  thioredoxin-like  29.51 
 
 		 174 aa  74.7  0.0000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298512  normal  0.186192 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0350  redoxin domain-containing protein  34.15 
 
 		 168 aa  74.3  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112402 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0405  redoxin domain-containing protein  33.33 
 
 		 203 aa  73.6  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0547  peroxiredoxin-like protein  28.12 
 
 		 168 aa  72.8  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0247  Redoxin domain protein  30.6 
 
 		 165 aa  72.4  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.549118  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0233  thioredoxin-like protein  32.84 
 
 		 179 aa  71.6  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4448  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.29 
 
 		 382 aa  71.6  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.510113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0287  Redoxin domain protein  34.15 
 
 		 167 aa  71.2  0.000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.610229  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0292  redoxin domain-containing protein  34.15 
 
 		 167 aa  71.2  0.000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000102715 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2803  putative thioredoxin  27.88 
 
 		 172 aa  70.9  0.000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.482325  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0196  Redoxin domain protein  32.59 
 
 		 185 aa  71.2  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0104775 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0333  putative transmembrane protein  32.59 
 
 		 213 aa  70.5  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.847937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0190  Redoxin domain protein  31.85 
 
 		 186 aa  70.5  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.968687  normal  0.596413 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1501  hypothetical protein  29.87 
 
 		 190 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.223609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0318  hypothetical protein  33.88 
 
 		 166 aa  70.1  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0164115  normal  0.0202423 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1895  redoxin domain-containing protein  29.77 
 
 		 189 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.132277 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0760  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.33 
 
 		 228 aa  68.9  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.173874 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4194  putative thiol-disulfide isomerase and thioredoxins  33.6 
 
 		 176 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.462178 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.26 
 
 		 187 aa  68.6  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0182  hypothetical protein  31.17 
 
 		 189 aa  68.6  0.00000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0774687  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0228  redoxin domain-containing protein  31.97 
 
 		 174 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.454071  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2408  hypothetical protein  27.86 
 
 		 160 aa  68.2  0.00000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.908805  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1959  redoxin domain-containing protein  27.42 
 
 		 189 aa  68.6  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0329542  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2095  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.4 
 
 		 288 aa  67.8  0.00000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.411423  normal  0.210806 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>