More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0814 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_2277  Redoxin domain protein  63.53 
 
 
591 aa  745    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182569  normal  0.459267 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6720  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  60.32 
 
 
619 aa  665    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4497  Redoxin domain protein  58.51 
 
 
691 aa  682    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3908  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  59.63 
 
 
598 aa  647    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6664  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  59.05 
 
 
623 aa  666    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0960267  normal  0.0511098 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2053  Redoxin domain protein  64.13 
 
 
589 aa  746    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0186949  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0816  putative transmembrane protein  58.37 
 
 
622 aa  647    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.420472 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5716  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  59.55 
 
 
622 aa  674    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.610944  normal  0.678998 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1170  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  62.4 
 
 
596 aa  687    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.623408 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5424  redoxin domain-containing protein  58.84 
 
 
604 aa  644    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5356  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  58.05 
 
 
626 aa  647    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.363536  normal  0.314037 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1587  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  60.64 
 
 
619 aa  669    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3069  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  59.67 
 
 
609 aa  650    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0869014  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5960  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  59.58 
 
 
625 aa  656    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.690095 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6244  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  60.64 
 
 
619 aa  669    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.681017  normal  0.800108 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5325  redoxin domain-containing protein  63.53 
 
 
592 aa  747    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.472956 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0814  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  100 
 
 
589 aa  1167    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0629136  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0468  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  56.09 
 
 
589 aa  591  1e-167  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00332396  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0515  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  58.06 
 
 
576 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.136592  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4426  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  57.5 
 
 
596 aa  565  1e-160  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5033  redoxin domain-containing protein  50.76 
 
 
581 aa  520  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.807705  normal  0.724504 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0539  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  55.94 
 
 
435 aa  454  1.0000000000000001e-126  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0299  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  53.13 
 
 
466 aa  451  1e-125  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.257762  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0311  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  52.52 
 
 
466 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.359191  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0868  Redoxin domain protein  52.84 
 
 
469 aa  427  1e-118  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5707  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  45.32 
 
 
403 aa  359  7e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.911728  normal  0.326453 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2089  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  45.28 
 
 
404 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.770973  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0074  thioredoxin-like protein  51.9 
 
 
381 aa  323  4e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.246531  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12889  integral membrane C-type cytochrome biogenesis protein dipZ  32.97 
 
 
695 aa  239  1e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3496  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.93 
 
 
570 aa  213  5.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.40474  normal  0.105344 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17110  cytochrome c biogenesis protein  31.62 
 
 
659 aa  205  2e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.473762  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0817  redoxin domain-containing protein  33.33 
 
 
369 aa  200  7e-50  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.234537 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4602  Redoxin domain protein  53.25 
 
 
188 aa  194  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3911  hypothetical protein  55.56 
 
 
189 aa  190  7e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0397  hypothetical protein  57.45 
 
 
193 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.325766 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6172  Redoxin domain protein  48.89 
 
 
187 aa  182  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4169  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  53.9 
 
 
200 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5017  redoxin domain-containing protein  56.03 
 
 
193 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.150202  normal  0.769586 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1911  redoxin domain-containing protein  54.55 
 
 
184 aa  181  4e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.58722  normal  0.231287 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5143  redoxin domain-containing protein  52.78 
 
 
197 aa  180  7e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00131261  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3111  redoxin  55.32 
 
 
193 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4615  redoxin domain-containing protein  52.78 
 
 
197 aa  179  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5256  redoxin domain-containing protein  55.32 
 
 
193 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3290  redoxin domain-containing protein  53.85 
 
 
178 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.680402  normal  0.588727 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2405  redoxin domain protein  53.85 
 
 
178 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5686  redoxin domain-containing protein  53.96 
 
 
186 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.131775 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3458  redoxin domain-containing protein  57.14 
 
 
193 aa  174  5.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.255545  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2010  redoxin domain-containing protein  52.45 
 
 
178 aa  173  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1839  hypothetical protein  39.19 
 
 
249 aa  125  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4099  NHL repeat containing protein  36.99 
 
 
581 aa  120  4.9999999999999996e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.649178  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1286  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.76 
 
 
493 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3670  NHL repeat-containing protein  37.58 
 
 
503 aa  117  5e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38790  Peroxiredoxin  40.85 
 
 
644 aa  115  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.605672 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2446  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.04 
 
 
628 aa  113  1.0000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0385674 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0173  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  40.3 
 
 
639 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00772059 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25270  NHL repeat protein  36.57 
 
 
697 aa  112  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.671028  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6967  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  40.3 
 
 
612 aa  111  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.265007  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19090  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  39.55 
 
 
699 aa  112  3e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.718374  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0097  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.62 
 
 
612 aa  109  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.328632  hitchhiker  0.000931017 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35610  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  35.82 
 
 
634 aa  108  3e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0100  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.75 
 
 
612 aa  107  5e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3716  NHL repeat containing protein  37.78 
 
 
674 aa  107  5e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3207  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.57 
 
 
688 aa  107  9e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.23742  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3914  NHL repeat-containing protein  37.25 
 
 
672 aa  106  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1280  NHL repeat-containing protein  32.83 
 
 
504 aa  104  5e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.164299  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0739  putative cytochrome C-type biogenesis protein  19.62 
 
 
403 aa  98.6  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0112308  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3901  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.33 
 
 
641 aa  97.8  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0567  Redoxin domain protein  32.87 
 
 
498 aa  96.3  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0721  cytochrome C biogenesis protein  19.38 
 
 
403 aa  95.1  3e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1718  NHL repeat-containing protein  32.8 
 
 
487 aa  93.2  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04460  methionine-R-sulfoxide reductase/methionine-S-sulfoxide reductase  26.24 
 
 
735 aa  83.2  0.00000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.361205  normal  0.714911 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4253  putative NHL repeat protein  35.38 
 
 
584 aa  81.6  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.376441  normal  0.79365 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0625  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25 
 
 
445 aa  81.6  0.00000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.254144  normal  0.888006 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4168  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.39 
 
 
238 aa  81.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1857  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.06 
 
 
280 aa  80.5  0.00000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4444  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.96 
 
 
196 aa  77.8  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.133035 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0547  peroxiredoxin-like protein  34.15 
 
 
168 aa  76.3  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0760  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.33 
 
 
228 aa  72.8  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.173874 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1851  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  20.69 
 
 
409 aa  72.4  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1402  NHL repeat containing protein  28.92 
 
 
470 aa  72  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.649211  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0047  hypothetical protein  35.16 
 
 
165 aa  72  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.147207  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2512  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.89 
 
 
244 aa  72  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.308751  normal  0.32204 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2095  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.54 
 
 
288 aa  72  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.411423  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0048  Redoxin domain protein  36 
 
 
172 aa  71.2  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0534182  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04380  cytochrome c biogenesis protein  22.25 
 
 
396 aa  70.9  0.00000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181653 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4431  Redoxin domain protein  29.85 
 
 
193 aa  70.5  0.00000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1223  hypothetical protein  30.65 
 
 
172 aa  69.3  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0325  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.77 
 
 
189 aa  68.9  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0365546 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1221  peroxiredoxin-like protein  30 
 
 
173 aa  68.9  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4901  Redoxin domain protein  29.2 
 
 
165 aa  68.6  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.273187  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0861  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.24 
 
 
189 aa  68.6  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.155376  hitchhiker  0.00638708 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2724  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.54 
 
 
188 aa  68.2  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.32328  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2412  Redoxin domain protein  28.97 
 
 
167 aa  68.2  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0318  hypothetical protein  29.41 
 
 
166 aa  68.2  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0164115  normal  0.0202423 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0350  redoxin domain-containing protein  29.05 
 
 
168 aa  67.8  0.0000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00112402 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0333  putative transmembrane protein  31.34 
 
 
213 aa  66.2  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.847937  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0405  redoxin domain-containing protein  30.08 
 
 
203 aa  66.6  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0247  Redoxin domain protein  27.97 
 
 
165 aa  66.2  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.549118  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1607  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.22 
 
 
403 aa  65.9  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.313576  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0181  alkyl hydroperoxide reductase  27.11 
 
 
183 aa  65.9  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0243778  normal  0.461108 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>