More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0515 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_0515  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  100 
 
 
576 aa  1141    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.136592  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0814  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  57.39 
 
 
589 aa  621  1e-176  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0629136  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5325  redoxin domain-containing protein  55.07 
 
 
592 aa  619  1e-176  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.472956 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2277  Redoxin domain protein  54.9 
 
 
591 aa  620  1e-176  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182569  normal  0.459267 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2053  Redoxin domain protein  54.92 
 
 
589 aa  609  1e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0186949  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4497  Redoxin domain protein  47.69 
 
 
691 aa  536  1e-151  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1170  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  51.51 
 
 
596 aa  536  1e-151  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.623408 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5424  redoxin domain-containing protein  50.66 
 
 
604 aa  530  1e-149  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6720  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  48.81 
 
 
619 aa  529  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1587  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  48.81 
 
 
619 aa  528  1e-148  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6244  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  48.81 
 
 
619 aa  528  1e-148  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.681017  normal  0.800108 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5716  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  49.52 
 
 
622 aa  527  1e-148  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.610944  normal  0.678998 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3069  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  49.67 
 
 
609 aa  526  1e-148  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0869014  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6664  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  47.96 
 
 
623 aa  521  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0960267  normal  0.0511098 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3908  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  50.75 
 
 
598 aa  514  1e-144  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0816  putative transmembrane protein  48.39 
 
 
622 aa  511  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.420472 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5960  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  49.52 
 
 
625 aa  514  1e-144  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.690095 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5356  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  48.72 
 
 
626 aa  502  1e-141  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.363536  normal  0.314037 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0468  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  48.7 
 
 
589 aa  493  9.999999999999999e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00332396  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4426  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  49.67 
 
 
596 aa  476  1e-133  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5033  redoxin domain-containing protein  47.98 
 
 
581 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.807705  normal  0.724504 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0868  Redoxin domain protein  46.72 
 
 
469 aa  346  6e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0539  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  46.03 
 
 
435 aa  346  6e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0299  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  43.09 
 
 
466 aa  340  5e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.257762  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0311  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  43.09 
 
 
466 aa  339  7e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.359191  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5707  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  44.91 
 
 
403 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.911728  normal  0.326453 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2089  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  44.04 
 
 
404 aa  336  9e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.770973  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0074  thioredoxin-like protein  45.97 
 
 
381 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.246531  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12889  integral membrane C-type cytochrome biogenesis protein dipZ  29.77 
 
 
695 aa  219  8.999999999999998e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0817  redoxin domain-containing protein  31.01 
 
 
369 aa  201  3e-50  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.234537 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3496  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.51 
 
 
570 aa  198  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.40474  normal  0.105344 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17110  cytochrome c biogenesis protein  29.29 
 
 
659 aa  188  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.473762  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4602  Redoxin domain protein  50.62 
 
 
188 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3911  hypothetical protein  52.82 
 
 
189 aa  177  4e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5017  redoxin domain-containing protein  53.57 
 
 
193 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.150202  normal  0.769586 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3111  redoxin  53.57 
 
 
193 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5256  redoxin domain-containing protein  53.57 
 
 
193 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0397  hypothetical protein  52.14 
 
 
193 aa  173  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.325766 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5143  redoxin domain-containing protein  52.14 
 
 
197 aa  171  3e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00131261  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4615  redoxin domain-containing protein  52.14 
 
 
197 aa  170  6e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3290  redoxin domain-containing protein  50.35 
 
 
178 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.680402  normal  0.588727 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1911  redoxin domain-containing protein  50.35 
 
 
184 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.58722  normal  0.231287 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2405  redoxin domain protein  51.06 
 
 
178 aa  163  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6172  Redoxin domain protein  42.77 
 
 
187 aa  162  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3458  redoxin domain-containing protein  51.88 
 
 
193 aa  162  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.255545  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5686  redoxin domain-containing protein  46.67 
 
 
186 aa  160  5e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.131775 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2010  redoxin domain-containing protein  48.94 
 
 
178 aa  160  8e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4169  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  47.52 
 
 
200 aa  159  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1839  hypothetical protein  41.3 
 
 
249 aa  127  4.0000000000000003e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4099  NHL repeat containing protein  39.04 
 
 
581 aa  119  1.9999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.649178  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3670  NHL repeat-containing protein  34.34 
 
 
503 aa  116  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19090  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  38.46 
 
 
699 aa  109  1e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.718374  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0173  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.33 
 
 
639 aa  108  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00772059 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3207  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.62 
 
 
688 aa  107  4e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.23742  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2446  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.48 
 
 
628 aa  106  1e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0385674 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0097  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.54 
 
 
612 aa  106  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.328632  hitchhiker  0.000931017 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38790  Peroxiredoxin  35.09 
 
 
644 aa  105  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.605672 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0100  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.94 
 
 
612 aa  105  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6967  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.42 
 
 
612 aa  104  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.265007  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35610  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  33.54 
 
 
634 aa  104  5e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25270  NHL repeat protein  35.56 
 
 
697 aa  104  5e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.671028  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1286  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.97 
 
 
493 aa  104  5e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3914  NHL repeat-containing protein  35.26 
 
 
672 aa  104  5e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3716  NHL repeat containing protein  36.88 
 
 
674 aa  103  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0739  putative cytochrome C-type biogenesis protein  20.4 
 
 
403 aa  96.3  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0112308  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3901  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.45 
 
 
641 aa  93.6  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0721  cytochrome C biogenesis protein  19.05 
 
 
403 aa  90.9  5e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1280  NHL repeat-containing protein  35.59 
 
 
504 aa  90.1  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.164299  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04460  methionine-R-sulfoxide reductase/methionine-S-sulfoxide reductase  24.27 
 
 
735 aa  82.8  0.00000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.361205  normal  0.714911 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4168  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  33.19 
 
 
238 aa  82.8  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0567  Redoxin domain protein  29.41 
 
 
498 aa  82  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1718  NHL repeat-containing protein  30.21 
 
 
487 aa  80.9  0.00000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4253  putative NHL repeat protein  34.27 
 
 
584 aa  75.1  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.376441  normal  0.79365 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04380  cytochrome c biogenesis protein  22.22 
 
 
396 aa  74.7  0.000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181653 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0625  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  24 
 
 
445 aa  72  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.254144  normal  0.888006 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1851  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  21.04 
 
 
409 aa  70.5  0.00000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1402  NHL repeat containing protein  33.33 
 
 
470 aa  68.9  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.649211  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1857  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.33 
 
 
280 aa  67.8  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00583  hypothetical protein  32.77 
 
 
472 aa  67.8  0.0000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0547  peroxiredoxin-like protein  31.75 
 
 
168 aa  66.6  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1223  hypothetical protein  28 
 
 
172 aa  67  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4444  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.26 
 
 
196 aa  63.9  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.133035 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0247  Redoxin domain protein  30.16 
 
 
165 aa  63.2  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.549118  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0760  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.26 
 
 
228 aa  62  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.173874 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1111  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.68 
 
 
227 aa  62  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000199763  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0861  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.4 
 
 
189 aa  61.6  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.155376  hitchhiker  0.00638708 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0736  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.29 
 
 
222 aa  61.2  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.592681  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0632  cytochrome c-type biogenesis protein  32.74 
 
 
216 aa  60.8  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.159383  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1768  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.61 
 
 
446 aa  60.5  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.197214  normal  0.508736 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0325  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.46 
 
 
189 aa  60.1  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0365546 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0333  putative transmembrane protein  27.84 
 
 
213 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.847937  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1607  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.98 
 
 
403 aa  59.7  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.313576  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3738  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.44 
 
 
246 aa  58.9  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0812643  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0350  redoxin domain-containing protein  31.34 
 
 
168 aa  58.9  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00112402 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2724  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.63 
 
 
188 aa  59.3  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.32328  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3524  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.19 
 
 
242 aa  58.5  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.239201  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4600  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.19 
 
 
242 aa  58.5  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0405  redoxin domain-containing protein  30.3 
 
 
203 aa  58.2  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3584  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.57 
 
 
164 aa  58.2  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2284  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.47 
 
 
223 aa  58.2  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000156188  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>