234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3207 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0097  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  55.85 
 
 
612 aa  661    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.328632  hitchhiker  0.000931017 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19090  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  54.44 
 
 
699 aa  674    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.718374  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35610  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  64.57 
 
 
634 aa  798    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3207  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  100 
 
 
688 aa  1355    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.23742  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3914  NHL repeat-containing protein  51.51 
 
 
672 aa  659    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2446  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  58.86 
 
 
628 aa  734    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0385674 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3716  NHL repeat containing protein  53.01 
 
 
674 aa  663    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0100  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  55.7 
 
 
612 aa  659    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3901  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  64.94 
 
 
641 aa  795    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0173  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  65.89 
 
 
639 aa  805    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00772059 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6967  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  53.18 
 
 
612 aa  615  9.999999999999999e-175  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.265007  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38790  Peroxiredoxin  48.93 
 
 
644 aa  560  1e-158  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.605672 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4253  putative NHL repeat protein  42.94 
 
 
584 aa  378  1e-103  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.376441  normal  0.79365 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3670  NHL repeat-containing protein  37.18 
 
 
503 aa  286  9e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1286  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.33 
 
 
493 aa  285  3.0000000000000004e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1280  NHL repeat-containing protein  37.11 
 
 
504 aa  280  8e-74  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.164299  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4099  NHL repeat containing protein  34.31 
 
 
581 aa  266  8.999999999999999e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.649178  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0567  Redoxin domain protein  30.37 
 
 
498 aa  226  1e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1718  NHL repeat-containing protein  34.34 
 
 
487 aa  191  4e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25270  NHL repeat protein  50 
 
 
697 aa  150  8e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.671028  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00583  hypothetical protein  30.41 
 
 
472 aa  132  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1402  NHL repeat containing protein  28.42 
 
 
470 aa  127  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.649211  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5143  redoxin domain-containing protein  39.31 
 
 
197 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00131261  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4615  redoxin domain-containing protein  40.15 
 
 
197 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0397  hypothetical protein  39.44 
 
 
193 aa  115  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.325766 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5686  redoxin domain-containing protein  38.35 
 
 
186 aa  114  8.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.131775 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3911  hypothetical protein  36.23 
 
 
189 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0468  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  38.52 
 
 
589 aa  111  5e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00332396  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5017  redoxin domain-containing protein  37.76 
 
 
193 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.150202  normal  0.769586 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4602  Redoxin domain protein  35.14 
 
 
188 aa  108  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0817  redoxin domain-containing protein  35.07 
 
 
369 aa  108  4e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.234537 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0515  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  34.62 
 
 
576 aa  108  5e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.136592  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6172  Redoxin domain protein  38.81 
 
 
187 aa  106  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0814  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  36.57 
 
 
589 aa  106  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0629136  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3111  redoxin  40.62 
 
 
193 aa  106  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5256  redoxin domain-containing protein  40.62 
 
 
193 aa  106  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4426  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.18 
 
 
596 aa  104  5e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0539  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  37.86 
 
 
435 aa  103  9e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3458  redoxin domain-containing protein  38.66 
 
 
193 aa  103  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.255545  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0074  thioredoxin-like protein  39.58 
 
 
381 aa  101  5e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.246531  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0816  putative transmembrane protein  35.82 
 
 
622 aa  100  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.420472 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3496  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.29 
 
 
570 aa  100  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.40474  normal  0.105344 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2089  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  35.04 
 
 
404 aa  100  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.770973  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5033  redoxin domain-containing protein  35.29 
 
 
581 aa  100  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.807705  normal  0.724504 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2053  Redoxin domain protein  32.86 
 
 
589 aa  99  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0186949  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5707  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.85 
 
 
403 aa  99  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.911728  normal  0.326453 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1170  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  37.31 
 
 
596 aa  99  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.623408 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5424  redoxin domain-containing protein  35.07 
 
 
604 aa  98.6  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3069  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.81 
 
 
609 aa  97.8  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0869014  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4497  Redoxin domain protein  34.33 
 
 
691 aa  97.4  9e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2277  Redoxin domain protein  32.14 
 
 
591 aa  97.1  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182569  normal  0.459267 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0868  Redoxin domain protein  38.98 
 
 
469 aa  96.3  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0299  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  33.58 
 
 
466 aa  95.1  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.257762  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1587  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.62 
 
 
619 aa  94.4  7e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6244  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.62 
 
 
619 aa  94.4  7e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.681017  normal  0.800108 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6720  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.62 
 
 
619 aa  94.4  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0311  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  33.58 
 
 
466 aa  94.4  7e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.359191  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12889  integral membrane C-type cytochrome biogenesis protein dipZ  32.08 
 
 
695 aa  94  8e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17110  cytochrome c biogenesis protein  34.46 
 
 
659 aa  93.6  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.473762  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6664  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  35.82 
 
 
623 aa  92.8  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0960267  normal  0.0511098 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1911  redoxin domain-containing protein  35.07 
 
 
184 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.58722  normal  0.231287 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3908  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  33.58 
 
 
598 aa  92  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5960  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  35.07 
 
 
625 aa  92  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.690095 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5325  redoxin domain-containing protein  32.84 
 
 
592 aa  92.4  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.472956 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5716  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  35.07 
 
 
622 aa  92  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.610944  normal  0.678998 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5356  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  34.33 
 
 
626 aa  92  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.363536  normal  0.314037 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3290  redoxin domain-containing protein  35.54 
 
 
178 aa  90.9  7e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.680402  normal  0.588727 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1839  hypothetical protein  36.47 
 
 
249 aa  90.9  7e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2405  redoxin domain protein  35.07 
 
 
178 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2010  redoxin domain-containing protein  34.71 
 
 
178 aa  86.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4169  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.58 
 
 
200 aa  84  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1359  NHL repeat containing protein  26.19 
 
 
439 aa  67.8  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0211  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.5 
 
 
187 aa  67.4  0.0000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.506232  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0192  hypothetical protein  37.5 
 
 
187 aa  66.6  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2082  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.71 
 
 
380 aa  66.2  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  26.56 
 
 
1292 aa  65.1  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0547  peroxiredoxin-like protein  31.34 
 
 
168 aa  63.5  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04460  methionine-R-sulfoxide reductase/methionine-S-sulfoxide reductase  30.23 
 
 
735 aa  62  0.00000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.361205  normal  0.714911 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6264  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.31 
 
 
173 aa  61.6  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.92814  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4846  hypothetical protein  31.76 
 
 
178 aa  61.6  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.892642  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1501  hypothetical protein  33.55 
 
 
190 aa  61.2  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.223609  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2276  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.91 
 
 
342 aa  60.5  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.54286  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1376  hypothetical protein  31.03 
 
 
181 aa  60.5  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1789  Redoxin domain protein  28.68 
 
 
165 aa  59.3  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2265  NHL repeat-containing protein  26.46 
 
 
963 aa  59.7  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.397951  normal  0.439164 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2779  hypothetical protein  24.48 
 
 
1051 aa  59.7  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1391  Redoxin domain protein  28.68 
 
 
165 aa  59.7  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2205  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.16 
 
 
232 aa  59.3  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000183966 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4444  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.11 
 
 
196 aa  58.9  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.133035 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2137  thiol-disulfide oxidoreductase  27.27 
 
 
156 aa  58.5  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.213967 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2135  thiol-disulfide oxidoreductase  27.27 
 
 
165 aa  58.5  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2245  redoxin domain-containing protein  27.27 
 
 
165 aa  58.5  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1234  redoxin domain-containing protein  30.08 
 
 
167 aa  58.2  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4431  Redoxin domain protein  33.08 
 
 
193 aa  57.4  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0721  cytochrome C biogenesis protein  26.77 
 
 
403 aa  57.4  0.0000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2283  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.92 
 
 
199 aa  57  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000858823  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0739  putative cytochrome C-type biogenesis protein  25.98 
 
 
403 aa  57.4  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0112308  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1818  redoxin domain-containing protein  33.33 
 
 
165 aa  56.6  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.165387  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1533  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.13 
 
 
193 aa  57  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0760  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.57 
 
 
228 aa  57  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.173874 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>