159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4846 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_4846  hypothetical protein  100 
 
 
178 aa  358  2e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.892642  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0182  hypothetical protein  53.37 
 
 
189 aa  192  3e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0774687  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0192  hypothetical protein  57.99 
 
 
187 aa  185  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0211  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  57.99 
 
 
187 aa  184  5e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.506232  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2688  hypothetical protein  56.67 
 
 
188 aa  176  2e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.885834  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1501  hypothetical protein  45.95 
 
 
190 aa  175  3e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.223609  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1376  hypothetical protein  49.13 
 
 
181 aa  174  8e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0061  hypothetical protein  56 
 
 
161 aa  157  8e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.861882  normal  0.105753 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0069  hypothetical protein  52.67 
 
 
164 aa  148  5e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5686  redoxin domain-containing protein  32.9 
 
 
186 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.131775 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6172  Redoxin domain protein  31.72 
 
 
187 aa  69.7  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2405  redoxin domain protein  31.51 
 
 
178 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3207  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.85 
 
 
688 aa  65.5  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.23742  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1890  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.51 
 
 
171 aa  65.5  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.326681  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3290  redoxin domain-containing protein  30.34 
 
 
178 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.680402  normal  0.588727 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3901  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.46 
 
 
641 aa  61.2  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0816  putative transmembrane protein  29.45 
 
 
622 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.420472 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2010  redoxin domain-containing protein  29.45 
 
 
178 aa  61.2  0.000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4497  Redoxin domain protein  28.77 
 
 
691 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4169  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.23 
 
 
200 aa  60.8  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3908  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.12 
 
 
598 aa  60.8  0.000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1911  redoxin domain-containing protein  28.77 
 
 
184 aa  60.8  0.000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.58722  normal  0.231287 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12889  integral membrane C-type cytochrome biogenesis protein dipZ  26.45 
 
 
695 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19090  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  29.89 
 
 
699 aa  59.7  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.718374  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2089  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.4 
 
 
404 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.770973  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4615  redoxin domain-containing protein  31.88 
 
 
197 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3458  redoxin domain-containing protein  32.03 
 
 
193 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.255545  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3670  NHL repeat-containing protein  28.81 
 
 
503 aa  57.8  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4602  Redoxin domain protein  27.46 
 
 
188 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0397  hypothetical protein  30.28 
 
 
193 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.325766 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0103  hypothetical protein  32.14 
 
 
156 aa  57  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.76812 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6967  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.75 
 
 
612 aa  57  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.265007  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0047  hypothetical protein  33.33 
 
 
165 aa  56.6  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.147207  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3716  NHL repeat containing protein  28.93 
 
 
674 aa  56.6  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5325  redoxin domain-containing protein  27.56 
 
 
592 aa  56.6  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.472956 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5143  redoxin domain-containing protein  31.16 
 
 
197 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00131261  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0048  Redoxin domain protein  33.33 
 
 
172 aa  57  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0534182  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3111  redoxin  29.69 
 
 
193 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3914  NHL repeat-containing protein  28.87 
 
 
672 aa  55.8  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5256  redoxin domain-containing protein  29.69 
 
 
193 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5017  redoxin domain-containing protein  29.69 
 
 
193 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.150202  normal  0.769586 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3280  thioredoxin-related protein  25.66 
 
 
171 aa  55.5  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5033  redoxin domain-containing protein  29.92 
 
 
581 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.807705  normal  0.724504 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0403  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  23.93 
 
 
174 aa  55.5  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000117414  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25270  NHL repeat protein  32.52 
 
 
697 aa  55.1  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.671028  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0364  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.52 
 
 
170 aa  54.7  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000189648  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0173  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.21 
 
 
639 aa  54.7  0.0000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00772059 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5707  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  25.69 
 
 
403 aa  54.7  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.911728  normal  0.326453 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3229  thioredoxin-related protein  28.76 
 
 
170 aa  54.7  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000047722  normal  0.231945 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0868  Redoxin domain protein  31.72 
 
 
469 aa  53.9  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35610  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  29.6 
 
 
634 aa  53.5  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0097  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.75 
 
 
612 aa  53.9  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.328632  hitchhiker  0.000931017 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0468  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.21 
 
 
589 aa  53.5  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00332396  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0403  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  23.31 
 
 
174 aa  53.5  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1170  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.67 
 
 
596 aa  53.1  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.623408 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0100  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.75 
 
 
612 aa  53.5  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0628  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.77 
 
 
206 aa  53.1  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.603467  hitchhiker  0.00557817 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2277  Redoxin domain protein  26.77 
 
 
591 aa  53.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182569  normal  0.459267 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0539  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  26.43 
 
 
435 aa  52.4  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2446  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28 
 
 
628 aa  52.8  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0385674 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1286  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.65 
 
 
493 aa  52.8  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3911  hypothetical protein  25.87 
 
 
189 aa  52  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6664  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.74 
 
 
623 aa  52  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0960267  normal  0.0511098 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0074  thioredoxin-like protein  31.65 
 
 
381 aa  52.4  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.246531  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3524  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.75 
 
 
207 aa  51.6  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717599  normal  0.280067 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1857  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.77 
 
 
280 aa  51.2  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1960  hypothetical protein  33.06 
 
 
163 aa  51.2  0.000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.73446 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5716  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.39 
 
 
622 aa  51.2  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.610944  normal  0.678998 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4099  NHL repeat containing protein  29.23 
 
 
581 aa  51.2  0.000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.649178  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2053  Redoxin domain protein  25 
 
 
589 aa  51.2  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0186949  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1587  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.1 
 
 
619 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5960  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.39 
 
 
625 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.690095 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6244  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.1 
 
 
619 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.681017  normal  0.800108 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6267  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28 
 
 
658 aa  50.8  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6720  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.1 
 
 
619 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3069  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.94 
 
 
609 aa  49.7  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0869014  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1252  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  21.18 
 
 
221 aa  49.7  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1445  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.44 
 
 
182 aa  50.1  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4515  Redoxin domain protein  30.19 
 
 
182 aa  49.3  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.706217  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1146  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  26.42 
 
 
433 aa  48.9  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.299964  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0921  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.22 
 
 
195 aa  48.9  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.122938 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1718  NHL repeat-containing protein  29.91 
 
 
487 aa  48.9  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0814  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  24.65 
 
 
589 aa  48.5  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0629136  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1358  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.77 
 
 
179 aa  48.5  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000315647  hitchhiker  0.00000356135 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0515  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.61 
 
 
576 aa  48.5  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.136592  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0530  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.56 
 
 
168 aa  48.5  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.120927  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5356  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.39 
 
 
626 aa  48.1  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.363536  normal  0.314037 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2145  Redoxin domain protein  24.44 
 
 
172 aa  48.1  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.765284  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5203  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  23.18 
 
 
201 aa  48.1  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2734  Redoxin domain protein  25.93 
 
 
204 aa  47.8  0.00008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0627049  normal  0.0544448 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07200  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  29.01 
 
 
181 aa  47.8  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.246784 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2682  thioredoxin  26.92 
 
 
183 aa  47.4  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2968  hypothetical protein  27.94 
 
 
162 aa  47  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.42 
 
 
166 aa  45.8  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000277693  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3537  Redoxin domain protein  34.59 
 
 
182 aa  45.8  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.694899  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0240  Redoxin domain protein  23.66 
 
 
188 aa  45.8  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2283  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.95 
 
 
199 aa  45.8  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000858823  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3424  Redoxin domain protein  25.95 
 
 
183 aa  46.2  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0519333  normal  0.0539833 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0506  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  23.53 
 
 
175 aa  45.8  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0010915  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3473  Redoxin domain protein  34.59 
 
 
178 aa  45.8  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.576052  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>