18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2968 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_2968  hypothetical protein  100 
 
 
162 aa  334  2.9999999999999997e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0103  hypothetical protein  47.3 
 
 
156 aa  145  3e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.76812 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0123  hypothetical protein  51.22 
 
 
84 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0069  hypothetical protein  35.97 
 
 
164 aa  77  0.00000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0061  hypothetical protein  33.33 
 
 
161 aa  66.6  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.861882  normal  0.105753 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0182  hypothetical protein  31.25 
 
 
189 aa  66.2  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0774687  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1501  hypothetical protein  29.2 
 
 
190 aa  63.5  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.223609  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0211  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.77 
 
 
187 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.506232  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0192  hypothetical protein  32.77 
 
 
187 aa  58.5  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1376  hypothetical protein  29.37 
 
 
181 aa  56.2  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2688  hypothetical protein  28.03 
 
 
188 aa  50.4  0.000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.885834  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4846  hypothetical protein  27.94 
 
 
178 aa  46.6  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.892642  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1252  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.96 
 
 
221 aa  44.3  0.0007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0204  periplasmic protein thiol/disulphide oxidoreductase DsbE  25.34 
 
 
198 aa  43.9  0.0009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.466624  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2290  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.91 
 
 
186 aa  43.9  0.0009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.348422 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2682  thioredoxin  23.73 
 
 
183 aa  41.6  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6429  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  22.3 
 
 
715 aa  41.6  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0633633  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3484  redoxin domain-containing protein  22.94 
 
 
180 aa  40.8  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.234166  normal  0.21665 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>