13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0103 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0103  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  322  1e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.76812 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2968  hypothetical protein  47.3 
 
 		 162 aa  145  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0123  hypothetical protein  76.83 
 
 		 84 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1501  hypothetical protein  33.82 
 
 		 190 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.223609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1376  hypothetical protein  34.29 
 
 		 181 aa  77.8  0.00000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0069  hypothetical protein  36.43 
 
 		 164 aa  71.6  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0061  hypothetical protein  34.29 
 
 		 161 aa  70.5  0.000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.861882  normal  0.105753 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0182  hypothetical protein  32.64 
 
 		 189 aa  67.4  0.00000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0774687  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0192  hypothetical protein  33.58 
 
 		 187 aa  66.2  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0211  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.58 
 
 		 187 aa  66.2  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.506232  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2688  hypothetical protein  30.43 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.885834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4846  hypothetical protein  32.14 
 
 		 178 aa  57.4  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.892642  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3457  hypothetical protein  25.83 
 
 		 167 aa  40.4  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>