177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0192 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_0192  hypothetical protein  100 
 
 
187 aa  372  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0211  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  98.4 
 
 
187 aa  367  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.506232  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1501  hypothetical protein  50.53 
 
 
190 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.223609  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1376  hypothetical protein  52.02 
 
 
181 aa  196  1.0000000000000001e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4846  hypothetical protein  58.38 
 
 
178 aa  194  6e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.892642  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0182  hypothetical protein  52.25 
 
 
189 aa  191  7e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0774687  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0061  hypothetical protein  56.29 
 
 
161 aa  171  5.999999999999999e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.861882  normal  0.105753 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2688  hypothetical protein  52.94 
 
 
188 aa  168  4e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.885834  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0069  hypothetical protein  56 
 
 
164 aa  167  1e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5686  redoxin domain-containing protein  30.67 
 
 
186 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.131775 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19090  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  37.5 
 
 
699 aa  74.3  0.000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.718374  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5033  redoxin domain-containing protein  28.38 
 
 
581 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.807705  normal  0.724504 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3911  hypothetical protein  27.4 
 
 
189 aa  72.8  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2277  Redoxin domain protein  30.81 
 
 
591 aa  72  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182569  normal  0.459267 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6172  Redoxin domain protein  29.01 
 
 
187 aa  71.6  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3207  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.84 
 
 
688 aa  71.6  0.000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.23742  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0103  hypothetical protein  34.03 
 
 
156 aa  70.5  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.76812 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4602  Redoxin domain protein  27.45 
 
 
188 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3914  NHL repeat-containing protein  33.79 
 
 
672 aa  69.3  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2446  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.29 
 
 
628 aa  68.9  0.00000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0385674 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3716  NHL repeat containing protein  33.79 
 
 
674 aa  68.9  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0814  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.47 
 
 
589 aa  68.9  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0629136  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1170  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.03 
 
 
596 aa  67.8  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.623408 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0539  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.74 
 
 
435 aa  67.8  0.00000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0816  putative transmembrane protein  28.3 
 
 
622 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.420472 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5325  redoxin domain-containing protein  30.37 
 
 
592 aa  67  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.472956 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3670  NHL repeat-containing protein  30.07 
 
 
503 aa  66.6  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2053  Redoxin domain protein  28.24 
 
 
589 aa  66.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0186949  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35610  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  34.72 
 
 
634 aa  66.2  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6967  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.36 
 
 
612 aa  66.6  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.265007  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4497  Redoxin domain protein  28.4 
 
 
691 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3901  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.09 
 
 
641 aa  66.2  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2968  hypothetical protein  32.37 
 
 
162 aa  66.2  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2089  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.13 
 
 
404 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.770973  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0515  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.57 
 
 
576 aa  65.5  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.136592  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0299  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.67 
 
 
466 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.257762  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1286  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.17 
 
 
493 aa  63.9  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0097  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.66 
 
 
612 aa  63.9  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.328632  hitchhiker  0.000931017 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5707  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.56 
 
 
403 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.911728  normal  0.326453 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0311  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.85 
 
 
466 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.359191  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0173  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.19 
 
 
639 aa  63.5  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00772059 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25270  NHL repeat protein  33.33 
 
 
697 aa  62.8  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.671028  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0100  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.88 
 
 
612 aa  62.4  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4099  NHL repeat containing protein  34.11 
 
 
581 aa  62  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.649178  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12889  integral membrane C-type cytochrome biogenesis protein dipZ  29.3 
 
 
695 aa  61.6  0.000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3908  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  25.33 
 
 
598 aa  61.2  0.000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0468  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.87 
 
 
589 aa  61.2  0.000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00332396  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4169  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.57 
 
 
200 aa  60.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0868  Redoxin domain protein  27.91 
 
 
469 aa  60.8  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1445  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.94 
 
 
182 aa  60.5  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4426  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.27 
 
 
596 aa  60.1  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5424  redoxin domain-containing protein  26.57 
 
 
604 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38790  Peroxiredoxin  34.03 
 
 
644 aa  59.7  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.605672 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0074  thioredoxin-like protein  29.71 
 
 
381 aa  59.3  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.246531  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1587  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.07 
 
 
619 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6244  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.07 
 
 
619 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.681017  normal  0.800108 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6720  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.07 
 
 
619 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1252  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  23.61 
 
 
221 aa  58.5  0.00000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5017  redoxin domain-containing protein  28.03 
 
 
193 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.150202  normal  0.769586 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3458  redoxin domain-containing protein  28.79 
 
 
193 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.255545  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3280  thioredoxin-related protein  26.8 
 
 
171 aa  57.4  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6664  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.37 
 
 
623 aa  57  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0960267  normal  0.0511098 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3496  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.49 
 
 
570 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.40474  normal  0.105344 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3111  redoxin  28.03 
 
 
193 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5256  redoxin domain-containing protein  28.03 
 
 
193 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0397  hypothetical protein  26.75 
 
 
193 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.325766 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3069  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.41 
 
 
609 aa  55.8  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0869014  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5356  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.27 
 
 
626 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.363536  normal  0.314037 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5716  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.97 
 
 
622 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.610944  normal  0.678998 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4615  redoxin domain-containing protein  25 
 
 
197 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5960  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.97 
 
 
625 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.690095 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0567  Redoxin domain protein  30.77 
 
 
498 aa  54.3  0.0000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0432  redoxin domain-containing protein  28.37 
 
 
169 aa  54.3  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0116447 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0272  thioredoxin family protein  27.61 
 
 
182 aa  53.5  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.900103 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1890  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.64 
 
 
171 aa  53.5  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.326681  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2145  Redoxin domain protein  25.37 
 
 
172 aa  53.5  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.765284  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5143  redoxin domain-containing protein  24.26 
 
 
197 aa  53.1  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00131261  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4444  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.07 
 
 
196 aa  52.8  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.133035 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0274  cytochrome c biogenesis protein, putative  28.57 
 
 
194 aa  52  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1857  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.35 
 
 
280 aa  52  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0190  cytochrome c biogenesis protein, putative  28.57 
 
 
201 aa  52  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.648376  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3229  thioredoxin-related protein  27.45 
 
 
170 aa  52  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000047722  normal  0.231945 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0817  redoxin domain-containing protein  24.07 
 
 
369 aa  52  0.000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.234537 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1503  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.05 
 
 
437 aa  50.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0873558  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3424  Redoxin domain protein  26.19 
 
 
183 aa  50.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0519333  normal  0.0539833 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0475  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.78 
 
 
157 aa  50.8  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0330837 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1911  redoxin domain-containing protein  26.35 
 
 
184 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.58722  normal  0.231287 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0860  Redoxin domain protein  27.73 
 
 
162 aa  49.7  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00216693  normal  0.0861373 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2431  putative thioredoxin  25.52 
 
 
164 aa  50.1  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1280  NHL repeat-containing protein  29.17 
 
 
504 aa  50.4  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.164299  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2046  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  27.64 
 
 
437 aa  49.3  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0189188  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1718  NHL repeat-containing protein  28.1 
 
 
487 aa  48.9  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0403  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.18 
 
 
174 aa  48.9  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000117414  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0243  redoxin domain-containing protein  23.74 
 
 
184 aa  48.5  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.487537  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0760  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.93 
 
 
228 aa  48.5  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.173874 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07200  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  32.33 
 
 
181 aa  48.1  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.246784 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1146  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  26.52 
 
 
433 aa  48.1  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.299964  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0534  putative thioredoxin  24.6 
 
 
180 aa  48.1  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.677226 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6861  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.37 
 
 
191 aa  47.8  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0403  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.84 
 
 
174 aa  47  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>