More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_07200 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_07200  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  100 
 
 
181 aa  355  9.999999999999999e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.246784 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0521  Redoxin domain protein  61.27 
 
 
206 aa  208  3e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000754545  hitchhiker  0.00309639 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2734  Redoxin domain protein  59.88 
 
 
204 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0627049  normal  0.0544448 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0444  Redoxin domain protein  54.24 
 
 
176 aa  182  2.0000000000000003e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.567513  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3254  Redoxin domain protein  53.93 
 
 
198 aa  174  4e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0648017  normal  0.303521 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4433  redoxin domain-containing protein  45.11 
 
 
208 aa  149  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.390962  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4473  redoxin domain-containing protein  47.44 
 
 
203 aa  147  7e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4304  redoxin domain-containing protein  47.44 
 
 
203 aa  147  7e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.213617  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4204  redoxin domain-containing protein  47.44 
 
 
203 aa  147  7e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24260  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  46.05 
 
 
196 aa  143  1e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0670449  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3292  redoxin domain-containing protein  45 
 
 
200 aa  140  8e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3091  Redoxin domain protein  41.81 
 
 
203 aa  139  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17970  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  41.99 
 
 
203 aa  138  3.9999999999999997e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0628  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  42.69 
 
 
206 aa  129  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.603467  hitchhiker  0.00557817 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2704  hypothetical protein  41.01 
 
 
205 aa  127  8.000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.396222  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24350  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  41.21 
 
 
203 aa  122  4e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4563  redoxin domain-containing protein  51.64 
 
 
237 aa  120  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4431  Redoxin domain protein  36.21 
 
 
193 aa  119  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0572  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  40.36 
 
 
189 aa  117  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220825  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5008  Redoxin domain protein  37.14 
 
 
248 aa  114  8.999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.437471  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0269  Redoxin domain-containing protein  40.41 
 
 
188 aa  108  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.352663  normal  0.890492 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2202  redoxin domain-containing protein  37.85 
 
 
194 aa  107  8.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0501  redoxin domain-containing protein  37.8 
 
 
200 aa  101  5e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4573  Redoxin domain protein  34.29 
 
 
191 aa  94.7  6e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0827  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.99 
 
 
179 aa  93.6  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0251  redoxin domain-containing protein  32.26 
 
 
213 aa  92.8  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0689  Redoxin domain protein  43.8 
 
 
188 aa  92.4  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0960762  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2869  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  38.57 
 
 
200 aa  90.9  8e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0926  Redoxin domain protein  41.09 
 
 
199 aa  89.7  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6717  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  39.23 
 
 
195 aa  87.8  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3240  redoxin domain-containing protein  37.32 
 
 
198 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4098  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  38.2 
 
 
191 aa  87  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.311906 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5746  redoxin domain-containing protein  37.32 
 
 
188 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.487229  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6120  redoxin domain-containing protein  33.33 
 
 
209 aa  83.2  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.16555  normal  0.593362 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8082  Redoxin domain protein  31.17 
 
 
180 aa  82.4  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4518  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  39.86 
 
 
191 aa  82  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000658769 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4484  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  38.66 
 
 
195 aa  81.3  0.000000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.810998 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5203  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.05 
 
 
201 aa  81.3  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0325  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.56 
 
 
189 aa  79  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0365546 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02940  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  37.16 
 
 
183 aa  78.2  0.00000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0986235  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0510  putative secreted protein  37.01 
 
 
209 aa  78.2  0.00000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.113668  normal  0.171566 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0861  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.46 
 
 
189 aa  78.2  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.155376  hitchhiker  0.00638708 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0841  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.71 
 
 
174 aa  75.5  0.0000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0049  Redoxin domain protein  25.9 
 
 
180 aa  75.1  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2812  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.88 
 
 
240 aa  75.1  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0032  Redoxin domain protein  29.41 
 
 
182 aa  74.7  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000358102  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0052  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.93 
 
 
200 aa  74.7  0.0000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.148538 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3710  redoxin domain-containing protein  37.5 
 
 
218 aa  74.3  0.0000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5664  redoxin domain-containing protein  37.5 
 
 
223 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5347  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.5 
 
 
223 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0866  redoxin domain-containing protein  36.99 
 
 
200 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.141982  normal  0.0297264 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0475  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.17 
 
 
173 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10537  thioredoxin  37.88 
 
 
216 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.154005  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1036  Redoxin domain protein  36.75 
 
 
196 aa  73.2  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2682  thioredoxin  34.13 
 
 
183 aa  73.2  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0594  redoxin domain-containing protein  35.4 
 
 
172 aa  73.2  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0705  redoxin domain-containing protein  37.9 
 
 
203 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.106229 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0685  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.9 
 
 
203 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0692  redoxin  37.9 
 
 
203 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.988682  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.3 
 
 
166 aa  71.6  0.000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000277693  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2597  Redoxin domain protein  34.48 
 
 
220 aa  71.2  0.000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5382  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.5 
 
 
240 aa  71.2  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2624  Redoxin domain protein  35.36 
 
 
204 aa  71.2  0.000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2673  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  41.18 
 
 
204 aa  70.9  0.000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.153714  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3603  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.34 
 
 
183 aa  69.7  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3412  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.29 
 
 
169 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0050  redoxin domain-containing protein  27.74 
 
 
180 aa  69.7  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.577845  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1959  redoxin domain-containing protein  34.59 
 
 
189 aa  69.7  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0329542  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0240  Redoxin domain protein  31.01 
 
 
188 aa  69.3  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1445  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.34 
 
 
182 aa  69.3  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1954  thioredoxin  37.5 
 
 
184 aa  68.9  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0243  redoxin domain-containing protein  30.25 
 
 
184 aa  68.9  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.487537  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2203  redoxin domain-containing protein  39.47 
 
 
203 aa  68.6  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0284  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.89 
 
 
188 aa  68.2  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.503124  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18200  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.99 
 
 
178 aa  68.2  0.00000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000397372  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.57 
 
 
187 aa  67.8  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4453  thiol:disulfide interchange protein  32.64 
 
 
158 aa  67.8  0.00000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.115351  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0247  Redoxin domain protein  29.5 
 
 
165 aa  67.8  0.00000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.549118  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3474  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.92 
 
 
169 aa  67.8  0.00000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.163841 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0030  Redoxin domain protein  28.06 
 
 
179 aa  67.4  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0469  redoxin domain-containing protein  28.46 
 
 
190 aa  67.4  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0051  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.68 
 
 
178 aa  66.6  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.523254  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2939  redoxin domain-containing protein  32.03 
 
 
179 aa  66.6  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.670984  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1928  thioredoxin family thiol:disulfide interchange protein  30.08 
 
 
183 aa  66.2  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.652807  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0190  Redoxin domain protein  25 
 
 
186 aa  65.9  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.968687  normal  0.596413 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0023  redoxin domain-containing protein  28.29 
 
 
167 aa  65.9  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.239793  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1468  Redoxin domain-containing protein  32.17 
 
 
164 aa  65.5  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0261888  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36790  thioredoxin  33.87 
 
 
156 aa  65.5  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3927  thioredoxin-like  29.77 
 
 
174 aa  65.5  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298512  normal  0.186192 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1234  redoxin domain-containing protein  33.96 
 
 
167 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1208  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.83 
 
 
154 aa  65.1  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0022  thiol:disulfide interchange protein, thioredoxin family protein  30.51 
 
 
175 aa  65.1  0.0000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.117242 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2046  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  28.95 
 
 
437 aa  65.1  0.0000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0189188  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2006  redoxin domain-containing protein  28.57 
 
 
176 aa  64.7  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0112011  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1355  thiol-disulfide oxidoreductase  23.48 
 
 
173 aa  64.7  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3846  cytochrome c biogenesis protein CcmG  33.77 
 
 
180 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.971219  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1054  thioredoxin  28.21 
 
 
173 aa  63.9  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000221964  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0547  peroxiredoxin-like protein  31.71 
 
 
168 aa  63.9  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0228  redoxin domain-containing protein  27.78 
 
 
174 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.454071  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1358  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.97 
 
 
179 aa  63.9  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000315647  hitchhiker  0.00000356135 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>