More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1036 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_1036  Redoxin domain protein  100 
 
 
196 aa  394  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2624  Redoxin domain protein  60.53 
 
 
204 aa  210  1e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2673  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  59.89 
 
 
204 aa  204  7e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.153714  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5746  redoxin domain-containing protein  51.14 
 
 
188 aa  177  7e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.487229  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3240  redoxin domain-containing protein  51.14 
 
 
198 aa  177  9e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0692  redoxin  52.94 
 
 
203 aa  175  4e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.988682  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0685  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  52.94 
 
 
203 aa  175  4e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0705  redoxin domain-containing protein  52.94 
 
 
203 aa  175  4e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.106229 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2869  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  53.01 
 
 
200 aa  174  9e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3710  redoxin domain-containing protein  49.46 
 
 
218 aa  172  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4484  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  48.11 
 
 
195 aa  171  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.810998 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5347  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  49.46 
 
 
223 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5664  redoxin domain-containing protein  49.46 
 
 
223 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2812  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  49.48 
 
 
240 aa  169  4e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0866  redoxin domain-containing protein  51.41 
 
 
200 aa  168  5e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.141982  normal  0.0297264 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10537  thioredoxin  48.24 
 
 
216 aa  167  7e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.154005  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5382  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  47.72 
 
 
240 aa  165  4e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0052  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  50.28 
 
 
200 aa  165  5e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.148538 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6717  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  44.89 
 
 
195 aa  144  6e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0926  Redoxin domain protein  40 
 
 
199 aa  144  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0689  Redoxin domain protein  40.78 
 
 
188 aa  131  6.999999999999999e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0960762  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0572  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  36.11 
 
 
189 aa  112  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220825  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02940  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  39.41 
 
 
183 aa  110  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0986235  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4098  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  40.11 
 
 
191 aa  108  5e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.311906 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2704  hypothetical protein  36.16 
 
 
205 aa  107  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.396222  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5008  Redoxin domain protein  36 
 
 
248 aa  103  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.437471  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4518  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  42.38 
 
 
191 aa  102  5e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000658769 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4431  Redoxin domain protein  38.06 
 
 
193 aa  101  5e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0827  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.7 
 
 
179 aa  100  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0251  redoxin domain-containing protein  37.74 
 
 
213 aa  96.7  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3091  Redoxin domain protein  33.16 
 
 
203 aa  96.7  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0444  Redoxin domain protein  38.75 
 
 
176 aa  95.9  3e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.567513  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0521  Redoxin domain protein  34.48 
 
 
206 aa  95.9  4e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000754545  hitchhiker  0.00309639 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4573  Redoxin domain protein  32.78 
 
 
191 aa  95.1  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3292  redoxin domain-containing protein  33.33 
 
 
200 aa  92  5e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4473  redoxin domain-containing protein  33.16 
 
 
203 aa  90.5  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4304  redoxin domain-containing protein  33.16 
 
 
203 aa  90.5  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.213617  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4204  redoxin domain-containing protein  33.16 
 
 
203 aa  90.5  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0510  putative secreted protein  39.04 
 
 
209 aa  89  5e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.113668  normal  0.171566 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2202  redoxin domain-containing protein  32.31 
 
 
194 aa  88.2  6e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2734  Redoxin domain protein  35.2 
 
 
204 aa  84.3  9e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0627049  normal  0.0544448 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0269  Redoxin domain-containing protein  32.48 
 
 
188 aa  82  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.352663  normal  0.890492 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0501  redoxin domain-containing protein  34.64 
 
 
200 aa  81.6  0.000000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4563  redoxin domain-containing protein  38.52 
 
 
237 aa  81.3  0.000000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6120  redoxin domain-containing protein  37.44 
 
 
209 aa  80.9  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.16555  normal  0.593362 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8082  Redoxin domain protein  32.89 
 
 
180 aa  80.5  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3254  Redoxin domain protein  35.96 
 
 
198 aa  80.5  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0648017  normal  0.303521 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1234  redoxin domain-containing protein  33.03 
 
 
167 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0628  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.12 
 
 
206 aa  79.3  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.603467  hitchhiker  0.00557817 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1959  redoxin domain-containing protein  37.19 
 
 
189 aa  77.8  0.00000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0329542  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0240  Redoxin domain protein  32.97 
 
 
188 aa  77.8  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1818  redoxin domain-containing protein  37.96 
 
 
165 aa  77.8  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.165387  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5203  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34 
 
 
201 aa  77.4  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2095  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.41 
 
 
288 aa  76.3  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.411423  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17970  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  29.69 
 
 
203 aa  75.5  0.0000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24350  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  34.19 
 
 
203 aa  75.5  0.0000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1445  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.43 
 
 
182 aa  73.9  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4433  redoxin domain-containing protein  32.22 
 
 
208 aa  73.9  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.390962  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1221  peroxiredoxin-like protein  31.93 
 
 
173 aa  73.2  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2203  redoxin domain-containing protein  39.09 
 
 
203 aa  73.6  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07200  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  36.75 
 
 
181 aa  72.4  0.000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.246784 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2330  redoxin domain-containing protein  28.57 
 
 
182 aa  70.9  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0220843  normal  0.114358 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0861  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.91 
 
 
189 aa  70.5  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.155376  hitchhiker  0.00638708 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0830  redoxin domain-containing protein  24.84 
 
 
329 aa  70.1  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0325  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.95 
 
 
189 aa  69.7  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0365546 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24260  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  30.68 
 
 
196 aa  69.3  0.00000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0670449  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2597  Redoxin domain protein  34.17 
 
 
220 aa  68.6  0.00000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3551  thiol:disulfide interchange protein DsbE, putative  35.63 
 
 
173 aa  68.9  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.571735 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3690  Thiol-disulfide isomerase/thioredoxin-like  31.16 
 
 
183 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.405129 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0509  redoxin domain-containing protein  31.88 
 
 
184 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.36 
 
 
166 aa  68.2  0.00000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000277693  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0124  redoxin  31.16 
 
 
182 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.909527  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0607  redoxin domain-containing protein  31.16 
 
 
182 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1358  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.67 
 
 
179 aa  67.8  0.00000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000315647  hitchhiker  0.00000356135 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0533  redoxin domain-containing protein  33.33 
 
 
183 aa  67  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.917814  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2682  thioredoxin  34.02 
 
 
183 aa  67.4  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0576  redoxin domain-containing protein  30.43 
 
 
183 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000460325 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1566  hypothetical protein  31.31 
 
 
172 aa  67  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0023  redoxin domain-containing protein  30.33 
 
 
167 aa  66.6  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.239793  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0190  cytochrome c biogenesis protein, putative  26.72 
 
 
201 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.648376  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02721  protein disulfide-isomerase  29.37 
 
 
177 aa  66.2  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1070  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.94 
 
 
187 aa  66.2  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0274  cytochrome c biogenesis protein, putative  26.72 
 
 
194 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1680  thioredoxin family protein  29.01 
 
 
173 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0732573  normal  0.832163 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0760  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.08 
 
 
228 aa  65.9  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.173874 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1895  redoxin domain-containing protein  32.61 
 
 
189 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.132277 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2790  putative electron transfer protein  31.46 
 
 
184 aa  65.1  0.0000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2777  redoxin domain-containing protein  31.67 
 
 
182 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.769829  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1860  cytochrome c biogenesis protein, thiol-disulfide interchange protein  32.11 
 
 
173 aa  65.1  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2013  thiol:disulfide interchange protein, thioredoxin family protein  32.86 
 
 
176 aa  65.1  0.0000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0269  thioredoxin, putative  30.71 
 
 
194 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0237  redoxin domain-containing protein  30.71 
 
 
193 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000458104  hitchhiker  0.00000000877704 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0232  redoxin domain-containing protein  30.71 
 
 
193 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000057561  normal  0.0469952 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1857  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.66 
 
 
280 aa  64.7  0.0000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1248  redoxin  33.33 
 
 
192 aa  64.7  0.0000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.525672 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2939  redoxin domain-containing protein  28.7 
 
 
179 aa  64.3  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.670984  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0841  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  38.46 
 
 
174 aa  63.9  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1313  Redoxin domain protein  27.98 
 
 
182 aa  63.9  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000515497  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0049  Redoxin domain protein  27.62 
 
 
180 aa  63.9  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0237  redoxin domain-containing protein  31.5 
 
 
193 aa  64.3  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000132187  unclonable  0.000000000045327 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>