More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6120 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_6120  redoxin domain-containing protein  100 
 
 
209 aa  414  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.16555  normal  0.593362 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0510  putative secreted protein  72.62 
 
 
209 aa  246  3e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.113668  normal  0.171566 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4573  Redoxin domain protein  41.86 
 
 
191 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2704  hypothetical protein  45.58 
 
 
205 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.396222  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0594  redoxin domain-containing protein  53.33 
 
 
172 aa  121  8e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0572  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  40.31 
 
 
189 aa  120  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220825  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4431  Redoxin domain protein  43.92 
 
 
193 aa  112  6e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0628  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  40.1 
 
 
206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.603467  hitchhiker  0.00557817 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5008  Redoxin domain protein  42.36 
 
 
248 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.437471  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2202  redoxin domain-containing protein  38.5 
 
 
194 aa  108  8.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0269  Redoxin domain-containing protein  43.56 
 
 
188 aa  107  9.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.352663  normal  0.890492 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8082  Redoxin domain protein  36.99 
 
 
180 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4098  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  40 
 
 
191 aa  105  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.311906 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5203  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  38.98 
 
 
201 aa  105  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17970  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  40.11 
 
 
203 aa  104  8e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4518  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  40.12 
 
 
191 aa  100  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000658769 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0926  Redoxin domain protein  41.86 
 
 
199 aa  100  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0827  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.6 
 
 
179 aa  99.8  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5746  redoxin domain-containing protein  39.41 
 
 
188 aa  99  5e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.487229  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2203  redoxin domain-containing protein  46.61 
 
 
203 aa  99  5e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3240  redoxin domain-containing protein  38.32 
 
 
198 aa  98.6  6e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.36 
 
 
166 aa  97.8  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000277693  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4563  redoxin domain-containing protein  38.1 
 
 
237 aa  97.1  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0444  Redoxin domain protein  39.55 
 
 
176 aa  95.9  4e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.567513  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3292  redoxin domain-containing protein  39.13 
 
 
200 aa  95.5  5e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3091  Redoxin domain protein  37.68 
 
 
203 aa  93.2  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5382  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.59 
 
 
240 aa  94  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24350  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  34.03 
 
 
203 aa  92  5e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0501  redoxin domain-containing protein  37.57 
 
 
200 aa  92.4  5e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2724  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.77 
 
 
188 aa  91.3  9e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.32328  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4484  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.85 
 
 
195 aa  91.3  9e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.810998 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0685  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  38.07 
 
 
203 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0705  redoxin domain-containing protein  38.07 
 
 
203 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.106229 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3927  thioredoxin-like  37.58 
 
 
174 aa  90.9  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298512  normal  0.186192 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1248  redoxin  38.35 
 
 
192 aa  90.5  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.525672 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0692  redoxin  38.07 
 
 
203 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.988682  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2283  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.57 
 
 
199 aa  89.7  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000858823  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10537  thioredoxin  37.93 
 
 
216 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.154005  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4473  redoxin domain-containing protein  35.68 
 
 
203 aa  90.5  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4304  redoxin domain-containing protein  35.68 
 
 
203 aa  90.5  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.213617  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4204  redoxin domain-containing protein  35.68 
 
 
203 aa  90.5  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0251  redoxin domain-containing protein  37.29 
 
 
213 aa  90.1  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2734  Redoxin domain protein  38.62 
 
 
204 aa  89.7  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0627049  normal  0.0544448 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24260  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  33.53 
 
 
196 aa  89.4  3e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0670449  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1959  redoxin domain-containing protein  42.75 
 
 
189 aa  89.7  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0329542  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0521  Redoxin domain protein  34.34 
 
 
206 aa  89  4e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000754545  hitchhiker  0.00309639 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0325  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.11 
 
 
189 aa  89.4  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0365546 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2276  Redoxin domain protein  35.43 
 
 
171 aa  89  5e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5664  redoxin domain-containing protein  34.85 
 
 
223 aa  89  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5347  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.85 
 
 
223 aa  89  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0274  cytochrome c biogenesis protein, putative  26.97 
 
 
194 aa  88.6  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3474  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.69 
 
 
169 aa  88.6  7e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.163841 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0190  cytochrome c biogenesis protein, putative  26.97 
 
 
201 aa  88.2  8e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.648376  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2812  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.68 
 
 
240 aa  88.2  8e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3412  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.38 
 
 
169 aa  87.4  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0866  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.06 
 
 
183 aa  87.8  1e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1890  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.82 
 
 
171 aa  87.8  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.326681  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0717  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  38.21 
 
 
191 aa  87.8  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.17044  normal  0.602428 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1358  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  38.69 
 
 
179 aa  86.7  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000315647  hitchhiker  0.00000356135 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0689  Redoxin domain protein  38.85 
 
 
188 aa  87  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0960762  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18200  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.43 
 
 
178 aa  87  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000397372  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0272  thioredoxin family protein  40.83 
 
 
182 aa  87  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.900103 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2869  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.76 
 
 
200 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0520  periplasmic protein thiol  36.79 
 
 
199 aa  87  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.797158  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0204  periplasmic protein thiol/disulphide oxidoreductase DsbE  39.69 
 
 
198 aa  87.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.466624  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3710  redoxin domain-containing protein  34.34 
 
 
218 aa  87  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0344  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.38 
 
 
183 aa  86.3  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00014833  hitchhiker  0.000312976 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3254  Redoxin domain protein  40.3 
 
 
198 aa  86.3  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0648017  normal  0.303521 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0240  Redoxin domain protein  32.1 
 
 
188 aa  85.9  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4129  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  41.86 
 
 
200 aa  85.9  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.213063  normal  0.330883 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3028  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  41.94 
 
 
174 aa  85.5  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04554  thioredoxin  39.17 
 
 
200 aa  85.5  5e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0760  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35 
 
 
228 aa  85.5  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.173874 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4433  redoxin domain-containing protein  39.44 
 
 
208 aa  85.1  7e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.390962  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2000  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  38.93 
 
 
173 aa  84.7  9e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.236605  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1355  thiol-disulfide oxidoreductase  26.12 
 
 
173 aa  84.7  9e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2624  Redoxin domain protein  36.79 
 
 
204 aa  84.7  9e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2618  Redoxin domain protein  41.13 
 
 
174 aa  84  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.548372 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1598  thiol-disulfide oxidoreductase  26.12 
 
 
173 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.966744  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1356  thiol-disulfide oxidoreductase  26.12 
 
 
173 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0413  periplasmic protein thiol  39.86 
 
 
197 aa  84.7  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0861  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.34 
 
 
189 aa  84.3  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.155376  hitchhiker  0.00638708 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2784  putative thioredoxin-related transmembrane protein  40.32 
 
 
174 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.744775 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07200  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  33.33 
 
 
181 aa  83.2  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.246784 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1468  Redoxin domain-containing protein  34.06 
 
 
164 aa  83.6  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0261888  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1860  cytochrome c biogenesis protein, thiol-disulfide interchange protein  38.93 
 
 
173 aa  83.2  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1234  redoxin domain-containing protein  33.33 
 
 
167 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1561  thioredoxin  34.92 
 
 
164 aa  82.8  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00616006  normal  0.258468 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0866  redoxin domain-containing protein  39.29 
 
 
200 aa  82.8  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.141982  normal  0.0297264 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1396  thiol-disulfide oxidoreductase  26.12 
 
 
173 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1793  thioredoxin family protein  34.09 
 
 
184 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3603  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.19 
 
 
183 aa  82.4  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3551  thioredoxin family protein  34.09 
 
 
184 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0841  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.94 
 
 
174 aa  82  0.000000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0032  Redoxin domain protein  35.25 
 
 
182 aa  82  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000358102  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1703  redoxin domain-containing protein  36.69 
 
 
273 aa  82.4  0.000000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1566  thiol-disulfide oxidoreductase  26.87 
 
 
173 aa  82  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.62392e-19 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2777  redoxin domain-containing protein  40.16 
 
 
182 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.769829  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2013  thiol:disulfide interchange protein, thioredoxin family protein  32.41 
 
 
176 aa  81.6  0.000000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2395  thioredoxin-like protein  33.59 
 
 
278 aa  81.6  0.000000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000335524  hitchhiker  0.0000244413 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>