More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2203 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_2203  redoxin domain-containing protein  100 
 
 
203 aa  393  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0341  redoxin domain-containing protein  41.07 
 
 
203 aa  101  6e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1468  Redoxin domain-containing protein  41.6 
 
 
164 aa  99.8  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0261888  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6120  redoxin domain-containing protein  46.61 
 
 
209 aa  99  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.16555  normal  0.593362 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4563  redoxin domain-containing protein  46.15 
 
 
237 aa  97.4  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3826  redoxin domain-containing protein  41.84 
 
 
279 aa  96.7  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1992  twin-arginine translocation pathway signal  36.81 
 
 
199 aa  93.6  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2109  redoxin  39.09 
 
 
271 aa  92  6e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3560  redoxin domain-containing protein  37.59 
 
 
278 aa  91.3  9e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3802  redoxin domain-containing protein  41.04 
 
 
278 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1628  redoxin domain-containing protein  40.3 
 
 
278 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0881722  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4236  redoxin domain protein  40.3 
 
 
278 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3937  thiol:disulfide interchange protein DsbE, putative  37.5 
 
 
290 aa  88.2  7e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.144233  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4240  redoxin domain-containing protein  39.86 
 
 
332 aa  88.2  7e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0223129  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00100  putative thiol:disulfide interchange protein  37.07 
 
 
277 aa  88.2  8e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0344  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  39.45 
 
 
183 aa  87.4  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00014833  hitchhiker  0.000312976 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0510  putative secreted protein  40 
 
 
209 aa  87.4  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.113668  normal  0.171566 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.09 
 
 
166 aa  86.3  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000277693  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1759  hypothetical protein  36.15 
 
 
279 aa  85.5  5e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.416831  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5008  Redoxin domain protein  42.98 
 
 
248 aa  85.5  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.437471  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2593  putative thiol:disulfide interchange protein  41.96 
 
 
276 aa  85.5  5e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.357458  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0940  periplasmic protein thiol/disulfide oxidoreductase DsbE  38.81 
 
 
185 aa  84.7  9e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.126048 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3774  thiol-disulfide isomerase-like protein  41.67 
 
 
173 aa  84.3  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.166782  normal  0.0186728 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2015  Redoxin domain protein  39.45 
 
 
169 aa  84.3  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.878112  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2704  hypothetical protein  40 
 
 
205 aa  83.6  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.396222  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2395  thioredoxin-like protein  38.21 
 
 
278 aa  81.6  0.000000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000335524  hitchhiker  0.0000244413 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3410  thiol:disulfide interchange protein DsbE  40.32 
 
 
189 aa  81.6  0.000000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0176012  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3262  redoxin domain-containing protein  39.6 
 
 
269 aa  81.3  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0170639  normal  0.755125 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5120  redoxin domain-containing protein  39.6 
 
 
269 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.329832 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2761  thiol:disulfide interchange protein  38.35 
 
 
278 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.376077  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32600  thiol:disulfide interchange protein  38.35 
 
 
278 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.251961  normal  0.0539892 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0841  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.94 
 
 
174 aa  80.5  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0434  thiol:disulfide interchange protein DsbE  39.1 
 
 
181 aa  79.7  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.494469  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3551  thioredoxin family protein  37.17 
 
 
184 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1356  redoxin domain-containing protein  37.93 
 
 
278 aa  79.3  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.052167  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0087  thiol-disulfide isomerase-like protein  38.68 
 
 
170 aa  79.3  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.653321  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1793  thioredoxin family protein  37.5 
 
 
184 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2789  thiol:disulfide interchange protein  40.44 
 
 
269 aa  79.3  0.00000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0520  Redoxin domain protein  35.79 
 
 
196 aa  79  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4210  redoxin domain-containing protein  34.96 
 
 
269 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8082  Redoxin domain protein  35.48 
 
 
180 aa  79  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4318  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.43 
 
 
204 aa  79  0.00000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.077918 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2261  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.59 
 
 
191 aa  78.6  0.00000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.124304  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2252  putative thiol:disulfide interchange protein  37.4 
 
 
271 aa  78.6  0.00000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1710  Redoxin domain protein  39.29 
 
 
208 aa  78.6  0.00000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1596  ahpC/TSA family protein  31.16 
 
 
191 aa  78.6  0.00000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.613915  hitchhiker  0.000293615 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3817  thiol-disulfide oxidoreductase  28.46 
 
 
173 aa  78.2  0.00000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000518727 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0511  redoxin domain-containing protein  36.92 
 
 
270 aa  78.2  0.00000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.662182 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1383  thiol-disulfide oxidoreductase  28.46 
 
 
173 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1494  thiol-disulfide oxidoreductase  28.46 
 
 
173 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1493  redoxin domain-containing protein  42.02 
 
 
190 aa  77.8  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1528  thiol-disulfide oxidoreductase  28.46 
 
 
173 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4186  redoxin domain-containing protein  34.15 
 
 
269 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.855693  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4837  redoxin  34.15 
 
 
269 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3329  redoxin domain-containing protein  34.15 
 
 
269 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.531271 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3412  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.86 
 
 
169 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1355  thiol-disulfide oxidoreductase  27.64 
 
 
173 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1561  thioredoxin  37.01 
 
 
164 aa  77  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00616006  normal  0.258468 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4129  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  40.34 
 
 
200 aa  76.6  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.213063  normal  0.330883 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2921  Thiol-disulfide isomerase/thioredoxin-like  38.18 
 
 
269 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.253355  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4431  Redoxin domain protein  37.17 
 
 
193 aa  76.6  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0926  Redoxin domain protein  42.2 
 
 
199 aa  76.6  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4573  Redoxin domain protein  38.4 
 
 
191 aa  76.6  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2397  Redoxin domain protein  36.84 
 
 
267 aa  77  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.675955  normal  0.672629 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1566  thiol-disulfide oxidoreductase  28.46 
 
 
173 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.62392e-19 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1904  thioredoxin family protein  36.61 
 
 
184 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000368388  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2883  Redoxin domain-containing protein  34.33 
 
 
270 aa  75.9  0.0000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3603  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.08 
 
 
183 aa  75.9  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3474  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.86 
 
 
169 aa  75.5  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.163841 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1852  thioredoxin family protein  36.61 
 
 
184 aa  75.5  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.056942  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1627  thioredoxin family protein  36.61 
 
 
184 aa  75.5  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000123929  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1597  thioredoxin family protein  36.61 
 
 
184 aa  75.5  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0109831  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3720  ahpC/TSA family protein  32.03 
 
 
191 aa  75.5  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1221  peroxiredoxin-like protein  39 
 
 
173 aa  75.5  0.0000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0594  redoxin domain-containing protein  41.41 
 
 
172 aa  75.5  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1829  thioredoxin family protein  36.61 
 
 
184 aa  75.5  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1648  thioredoxin family protein  35.71 
 
 
184 aa  75.5  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000012411  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1779  thioredoxin family protein  35.71 
 
 
184 aa  75.5  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.710861  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3738  redoxin domain-containing protein  38.84 
 
 
268 aa  75.1  0.0000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3550  redoxin domain-containing protein  41.67 
 
 
278 aa  75.1  0.0000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.054429 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4473  redoxin domain-containing protein  42.48 
 
 
203 aa  75.1  0.0000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4304  redoxin domain-containing protein  42.48 
 
 
203 aa  75.1  0.0000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.213617  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4204  redoxin domain-containing protein  42.48 
 
 
203 aa  75.1  0.0000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2397  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.61 
 
 
173 aa  74.7  0.0000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2202  redoxin domain-containing protein  34.38 
 
 
194 aa  74.7  0.0000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1647  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.28 
 
 
184 aa  74.7  0.0000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.227241  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2939  redoxin domain-containing protein  41.28 
 
 
179 aa  74.7  0.0000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.670984  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3638  ahpC/TSA family protein  30.43 
 
 
191 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00315479  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3632  ahpC/TSA family protein  29.66 
 
 
191 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0183092  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3405  ahpC/TSA family protein  29.71 
 
 
191 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3367  AhpC/TSA family protein  29.71 
 
 
191 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0144546  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1036  Redoxin domain protein  39.09 
 
 
196 aa  73.9  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3674  ahpC/TSA family protein  29.71 
 
 
191 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.309572  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5883  Redoxin domain protein  44.83 
 
 
192 aa  74.3  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1108  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.52 
 
 
193 aa  73.9  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3298  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.97 
 
 
191 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.61408  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1234  redoxin domain-containing protein  39.08 
 
 
167 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3623  ahpC/TSA family protein  29.71 
 
 
191 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000131744 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1412  Redoxin domain protein  40.5 
 
 
263 aa  73.9  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2903  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.17 
 
 
184 aa  73.2  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>