More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4240 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_4240  redoxin domain-containing protein  100 
 
 
332 aa  641    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0223129  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2789  thiol:disulfide interchange protein  44.72 
 
 
269 aa  193  4e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1759  hypothetical protein  40.14 
 
 
279 aa  183  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.416831  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2395  thioredoxin-like protein  40.07 
 
 
278 aa  183  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000335524  hitchhiker  0.0000244413 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3826  redoxin domain-containing protein  39.78 
 
 
279 aa  181  2e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3560  redoxin domain-containing protein  40.56 
 
 
278 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4236  redoxin domain protein  40.14 
 
 
278 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3802  redoxin domain-containing protein  40.43 
 
 
278 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3937  thiol:disulfide interchange protein DsbE, putative  39.29 
 
 
290 aa  176  4e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.144233  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1628  redoxin domain-containing protein  39.78 
 
 
278 aa  176  6e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0881722  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2252  putative thiol:disulfide interchange protein  42.64 
 
 
271 aa  176  6e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2433  redoxin domain-containing protein  45.3 
 
 
277 aa  175  9e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.983249 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1412  Redoxin domain protein  44.2 
 
 
263 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1703  redoxin domain-containing protein  37.68 
 
 
273 aa  161  1e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32600  thiol:disulfide interchange protein  47.98 
 
 
278 aa  160  4e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.251961  normal  0.0539892 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2761  thiol:disulfide interchange protein  47.47 
 
 
278 aa  159  6e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.376077  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00100  putative thiol:disulfide interchange protein  31.91 
 
 
277 aa  155  1e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1356  redoxin domain-containing protein  38.19 
 
 
278 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.052167  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3550  redoxin domain-containing protein  40.75 
 
 
278 aa  150  3e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.054429 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2593  putative thiol:disulfide interchange protein  44.33 
 
 
276 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.357458  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3738  redoxin domain-containing protein  42.91 
 
 
268 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2921  Thiol-disulfide isomerase/thioredoxin-like  37.4 
 
 
269 aa  145  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.253355  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5120  redoxin domain-containing protein  40.69 
 
 
269 aa  139  6e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.329832 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0511  redoxin domain-containing protein  36.71 
 
 
270 aa  139  7.999999999999999e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.662182 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2109  redoxin  31.83 
 
 
271 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3262  redoxin domain-containing protein  41.15 
 
 
269 aa  136  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0170639  normal  0.755125 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3329  redoxin domain-containing protein  40.09 
 
 
269 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.531271 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4837  redoxin  40.09 
 
 
269 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4186  redoxin domain-containing protein  40.09 
 
 
269 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.855693  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4210  redoxin domain-containing protein  40.09 
 
 
269 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2397  Redoxin domain protein  35.79 
 
 
267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.675955  normal  0.672629 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3733  redoxin domain-containing protein  37.1 
 
 
262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.919007  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3246  redoxin domain-containing protein  34.65 
 
 
266 aa  121  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.575298  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1468  Redoxin domain-containing protein  40.82 
 
 
164 aa  105  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0261888  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2788  putative thiol:disulfide interchange protein  52 
 
 
195 aa  105  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.982955 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2883  Redoxin domain-containing protein  33.33 
 
 
270 aa  105  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2634  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.52 
 
 
272 aa  102  6e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.52704  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2015  Redoxin domain protein  38.06 
 
 
169 aa  96.7  5e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.878112  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0344  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.1 
 
 
183 aa  89.4  7e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00014833  hitchhiker  0.000312976 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2203  redoxin domain-containing protein  37.72 
 
 
203 aa  88.2  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0861  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.46 
 
 
189 aa  82  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.155376  hitchhiker  0.00638708 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1730  Redoxin domain-containing protein  38.05 
 
 
200 aa  80.5  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.686612  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0325  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.58 
 
 
189 aa  79.7  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0365546 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0272  thioredoxin family protein  30.94 
 
 
182 aa  79.7  0.00000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.900103 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1180  RecJ exonuclease  31.43 
 
 
160 aa  77  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0271144 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.71 
 
 
166 aa  73.6  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000277693  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2283  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30 
 
 
199 aa  73.2  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000858823  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18200  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.15 
 
 
178 aa  72.4  0.000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000397372  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3603  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.67 
 
 
183 aa  72.4  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0735  redoxin domain-containing protein  28.78 
 
 
211 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1597  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.06 
 
 
650 aa  71.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.596223 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4480  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.11 
 
 
194 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0398  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  33.81 
 
 
223 aa  71.2  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0641884  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1895  redoxin domain-containing protein  28.57 
 
 
189 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.132277 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1890  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.74 
 
 
171 aa  70.9  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.326681  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1857  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.21 
 
 
280 aa  70.1  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1872  heat shock protein DnaJ-like  32.33 
 
 
180 aa  70.5  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.506662  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0830  redoxin domain-containing protein  27.54 
 
 
329 aa  70.1  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6120  redoxin domain-containing protein  31.29 
 
 
209 aa  68.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.16555  normal  0.593362 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3474  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.32 
 
 
169 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.163841 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2509  putative thiol:disulfide interchange protein  30.84 
 
 
165 aa  68.2  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.343954  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1768  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.1 
 
 
446 aa  67.8  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.197214  normal  0.508736 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1839  cytochrome C biogenesis protein  28.95 
 
 
162 aa  68.2  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0573703  normal  0.0160187 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0547  peroxiredoxin-like protein  28.68 
 
 
168 aa  68.2  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4129  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  33.12 
 
 
200 aa  68.2  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.213063  normal  0.330883 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1248  redoxin  34.16 
 
 
192 aa  68.6  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.525672 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3412  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.43 
 
 
169 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0476  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.11 
 
 
177 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1851  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.09 
 
 
409 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3880  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.82 
 
 
194 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0180  periplasmic protein thiol/disulphide oxidoreductase DsbE  31.18 
 
 
195 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2678  thioredoxin family protein  32.48 
 
 
183 aa  67.4  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0209  periplasmic protein thiol  30.36 
 
 
197 aa  66.6  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0534506 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1647  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.2 
 
 
184 aa  67  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.227241  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4485  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.17 
 
 
200 aa  66.6  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000697653 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3551  thioredoxin family protein  31.2 
 
 
184 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1793  thioredoxin family protein  31.2 
 
 
184 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0051  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.93 
 
 
178 aa  66.6  0.0000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.523254  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0181  alkyl hydroperoxide reductase  26.28 
 
 
183 aa  66.6  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0243778  normal  0.461108 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03730  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  29.79 
 
 
212 aa  66.2  0.0000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0104824  normal  0.12424 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1396  thiol-disulfide oxidoreductase  22.35 
 
 
173 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4005  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.93 
 
 
194 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3733  redoxin  31.29 
 
 
187 aa  66.2  0.0000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.78163 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3817  thiol-disulfide oxidoreductase  25.18 
 
 
173 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000518727 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1223  Redoxin domain protein  24.86 
 
 
170 aa  65.9  0.0000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.337108  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1598  thiol-disulfide oxidoreductase  21.43 
 
 
173 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.966744  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1852  thioredoxin family protein  30.4 
 
 
184 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.056942  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3088  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  27.81 
 
 
199 aa  65.9  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1356  thiol-disulfide oxidoreductase  21.43 
 
 
173 aa  65.5  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1627  thioredoxin family protein  30.4 
 
 
184 aa  65.1  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000123929  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1597  thioredoxin family protein  30.4 
 
 
184 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0109831  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2013  thiol:disulfide interchange protein, thioredoxin family protein  27.27 
 
 
176 aa  65.9  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4550  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.89 
 
 
487 aa  65.5  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00323854  normal  0.0631256 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0841  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.45 
 
 
174 aa  65.5  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1829  thioredoxin family protein  30.4 
 
 
184 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0520  periplasmic protein thiol  32.74 
 
 
199 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.797158  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0479  thioredoxin, putative  26.49 
 
 
196 aa  65.1  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1566  thiol-disulfide oxidoreductase  25.9 
 
 
173 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.62392e-19 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3720  ahpC/TSA family protein  25.18 
 
 
191 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2644  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  32.9 
 
 
206 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>