More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3262 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3262  redoxin domain-containing protein  100 
 
 
269 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0170639  normal  0.755125 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5120  redoxin domain-containing protein  98.51 
 
 
269 aa  528  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.329832 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2921  Thiol-disulfide isomerase/thioredoxin-like  87.12 
 
 
269 aa  426  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.253355  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4210  redoxin domain-containing protein  82.95 
 
 
269 aa  371  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4186  redoxin domain-containing protein  80.68 
 
 
269 aa  364  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.855693  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4837  redoxin  80.68 
 
 
269 aa  364  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3329  redoxin domain-containing protein  80.68 
 
 
269 aa  364  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.531271 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2395  thioredoxin-like protein  55.68 
 
 
278 aa  308  9e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000335524  hitchhiker  0.0000244413 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1356  redoxin domain-containing protein  55.68 
 
 
278 aa  274  1.0000000000000001e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.052167  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3826  redoxin domain-containing protein  39.39 
 
 
279 aa  195  8.000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4236  redoxin domain protein  38.66 
 
 
278 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1628  redoxin domain-containing protein  38.66 
 
 
278 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0881722  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2397  Redoxin domain protein  42.59 
 
 
267 aa  182  5.0000000000000004e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.675955  normal  0.672629 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3802  redoxin domain-containing protein  37.92 
 
 
278 aa  181  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2789  thiol:disulfide interchange protein  45.13 
 
 
269 aa  176  3e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2252  putative thiol:disulfide interchange protein  41.92 
 
 
271 aa  176  3e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3560  redoxin domain-containing protein  36.98 
 
 
278 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0511  redoxin domain-containing protein  42.42 
 
 
270 aa  176  4e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.662182 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3937  thiol:disulfide interchange protein DsbE, putative  43.58 
 
 
290 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.144233  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1759  hypothetical protein  39.92 
 
 
279 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.416831  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1703  redoxin domain-containing protein  38.46 
 
 
273 aa  167  2e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2593  putative thiol:disulfide interchange protein  42.11 
 
 
276 aa  159  4e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.357458  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3738  redoxin domain-containing protein  44.08 
 
 
268 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00100  putative thiol:disulfide interchange protein  34.09 
 
 
277 aa  154  2e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2761  thiol:disulfide interchange protein  42.36 
 
 
278 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.376077  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3550  redoxin domain-containing protein  41.56 
 
 
278 aa  150  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.054429 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32600  thiol:disulfide interchange protein  40.59 
 
 
278 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.251961  normal  0.0539892 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4240  redoxin domain-containing protein  38.55 
 
 
332 aa  145  6e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0223129  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3733  redoxin domain-containing protein  39.93 
 
 
262 aa  143  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.919007  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2109  redoxin  30 
 
 
271 aa  135  5e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1412  Redoxin domain protein  41.15 
 
 
263 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2433  redoxin domain-containing protein  40.54 
 
 
277 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.983249 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3246  redoxin domain-containing protein  34.63 
 
 
266 aa  118  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.575298  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2015  Redoxin domain protein  42.52 
 
 
169 aa  108  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.878112  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1468  Redoxin domain-containing protein  37.5 
 
 
164 aa  105  8e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0261888  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2788  putative thiol:disulfide interchange protein  46.83 
 
 
195 aa  104  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.982955 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2883  Redoxin domain-containing protein  34.26 
 
 
270 aa  101  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0344  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  40 
 
 
183 aa  94  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00014833  hitchhiker  0.000312976 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.86 
 
 
166 aa  93.2  5e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000277693  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2634  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.92 
 
 
272 aa  92.4  7e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.52704  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0272  thioredoxin family protein  39.51 
 
 
182 aa  89  8e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.900103 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18200  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.12 
 
 
178 aa  89  8e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000397372  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2283  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.83 
 
 
199 aa  87  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000858823  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3298  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.25 
 
 
191 aa  86.7  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.61408  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0841  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.99 
 
 
174 aa  86.3  5e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3720  ahpC/TSA family protein  32.37 
 
 
191 aa  85.9  6e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1596  ahpC/TSA family protein  31.25 
 
 
191 aa  85.5  7e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.613915  hitchhiker  0.000293615 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2724  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.55 
 
 
188 aa  85.5  8e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.32328  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0325  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.64 
 
 
189 aa  85.5  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0365546 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3632  ahpC/TSA family protein  30.3 
 
 
191 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0183092  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3405  ahpC/TSA family protein  30.63 
 
 
191 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3367  AhpC/TSA family protein  30.63 
 
 
191 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0144546  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3317  AhpC/TSA family protein  30.63 
 
 
191 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1561  thioredoxin  37.3 
 
 
164 aa  84  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00616006  normal  0.258468 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3674  ahpC/TSA family protein  30.63 
 
 
191 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.309572  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3623  ahpC/TSA family protein  30.63 
 
 
191 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000131744 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2261  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.35 
 
 
191 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.124304  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1180  RecJ exonuclease  28.15 
 
 
160 aa  83.2  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0271144 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0398  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  45.79 
 
 
223 aa  82.4  0.000000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0641884  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1435  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  42.31 
 
 
206 aa  82.4  0.000000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.739092  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3638  ahpC/TSA family protein  30 
 
 
191 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00315479  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0181  alkyl hydroperoxide reductase  31.29 
 
 
183 aa  82  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0243778  normal  0.461108 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00935  Thiol-disulfide isomerase/thioredoxin-like protein  39.58 
 
 
189 aa  81.6  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.263507  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1408  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  32.39 
 
 
185 aa  80.9  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3817  thiol-disulfide oxidoreductase  25.86 
 
 
173 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000518727 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0861  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.69 
 
 
189 aa  80.9  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.155376  hitchhiker  0.00638708 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2203  redoxin domain-containing protein  39.6 
 
 
203 aa  80.9  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0240  Redoxin domain protein  31.89 
 
 
188 aa  80.9  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1598  thiol-disulfide oxidoreductase  24.71 
 
 
173 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.966744  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1383  thiol-disulfide oxidoreductase  26.63 
 
 
173 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1494  thiol-disulfide oxidoreductase  26.63 
 
 
173 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1634  thiol-disulfide oxidoreductase  24.71 
 
 
173 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1528  thiol-disulfide oxidoreductase  26.63 
 
 
173 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0534  putative thioredoxin  34.38 
 
 
180 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.677226 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1890  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.7 
 
 
171 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.326681  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1356  thiol-disulfide oxidoreductase  24.71 
 
 
173 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1730  Redoxin domain-containing protein  33.33 
 
 
200 aa  79.3  0.00000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.686612  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1566  thiol-disulfide oxidoreductase  26.04 
 
 
173 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.62392e-19 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0679  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.59 
 
 
167 aa  79  0.00000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1396  thiol-disulfide oxidoreductase  25.29 
 
 
173 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3424  Redoxin domain protein  33.07 
 
 
183 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0519333  normal  0.0539833 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0735  redoxin domain-containing protein  29.93 
 
 
211 aa  77.4  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0525  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.81 
 
 
178 aa  77  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000136072  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0830  redoxin domain-containing protein  34.45 
 
 
329 aa  77  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0212  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.54 
 
 
175 aa  77  0.0000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2535  redoxin domain-containing protein  36 
 
 
224 aa  77  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.772759 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0377  periplasmic thioredoxin (cytochrome c biogenesis)  32.65 
 
 
198 aa  76.6  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2222  thiol-disulfide oxidoreductase  34.51 
 
 
174 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000493791  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1355  thiol-disulfide oxidoreductase  25.44 
 
 
173 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0318  periplasmic protein thiol-disulfide oxidoreductase DsbE  28.15 
 
 
197 aa  76.3  0.0000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0510  putative secreted protein  33.08 
 
 
209 aa  76.3  0.0000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.113668  normal  0.171566 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3603  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.21 
 
 
183 aa  76.3  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0399  thiol-disulfide oxidoreductase  35.19 
 
 
174 aa  75.5  0.0000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1492  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.15 
 
 
193 aa  75.5  0.0000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2627  redoxin domain-containing protein  31.65 
 
 
182 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4016  thiol:disulfide interchange protein  35.46 
 
 
220 aa  74.7  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0110  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  29.01 
 
 
193 aa  74.7  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.346566  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0676  Redoxin domain protein  36.59 
 
 
165 aa  75.5  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0243  redoxin domain-containing protein  29.83 
 
 
184 aa  75.1  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.487537  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0625  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.8 
 
 
445 aa  74.3  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.254144  normal  0.888006 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>