More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2109 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_2109  redoxin  100 
 
 
271 aa  551  1e-156  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2789  thiol:disulfide interchange protein  39.18 
 
 
269 aa  199  5e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3826  redoxin domain-containing protein  35.34 
 
 
279 aa  189  4e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2252  putative thiol:disulfide interchange protein  37.59 
 
 
271 aa  175  7e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1703  redoxin domain-containing protein  36.4 
 
 
273 aa  172  7.999999999999999e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3560  redoxin domain-containing protein  36.36 
 
 
278 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4236  redoxin domain protein  35.58 
 
 
278 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3802  redoxin domain-containing protein  35.58 
 
 
278 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1628  redoxin domain-containing protein  35.82 
 
 
278 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0881722  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2593  putative thiol:disulfide interchange protein  36.63 
 
 
276 aa  156  3e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.357458  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00100  putative thiol:disulfide interchange protein  34.07 
 
 
277 aa  155  6e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3550  redoxin domain-containing protein  35.83 
 
 
278 aa  154  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.054429 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3738  redoxin domain-containing protein  37.18 
 
 
268 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3937  thiol:disulfide interchange protein DsbE, putative  32.47 
 
 
290 aa  151  8.999999999999999e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.144233  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1759  hypothetical protein  38.05 
 
 
279 aa  149  4e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.416831  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2433  redoxin domain-containing protein  35.4 
 
 
277 aa  149  7e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.983249 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1412  Redoxin domain protein  36.61 
 
 
263 aa  145  7.0000000000000006e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2397  Redoxin domain protein  34.69 
 
 
267 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.675955  normal  0.672629 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0511  redoxin domain-containing protein  34.7 
 
 
270 aa  139  4.999999999999999e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.662182 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2761  thiol:disulfide interchange protein  37.93 
 
 
278 aa  136  4e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.376077  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32600  thiol:disulfide interchange protein  37.75 
 
 
278 aa  136  4e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.251961  normal  0.0539892 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2395  thioredoxin-like protein  31.42 
 
 
278 aa  132  5e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000335524  hitchhiker  0.0000244413 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4210  redoxin domain-containing protein  33.19 
 
 
269 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2921  Thiol-disulfide isomerase/thioredoxin-like  31.82 
 
 
269 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.253355  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3262  redoxin domain-containing protein  33.65 
 
 
269 aa  116  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0170639  normal  0.755125 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4186  redoxin domain-containing protein  33.19 
 
 
269 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.855693  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4837  redoxin  33.19 
 
 
269 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3329  redoxin domain-containing protein  33.19 
 
 
269 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.531271 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5120  redoxin domain-containing protein  33.65 
 
 
269 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.329832 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1356  redoxin domain-containing protein  31.06 
 
 
278 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.052167  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1468  Redoxin domain-containing protein  39.85 
 
 
164 aa  109  4.0000000000000004e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0261888  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4240  redoxin domain-containing protein  30.45 
 
 
332 aa  109  6e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0223129  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2015  Redoxin domain protein  39.39 
 
 
169 aa  104  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.878112  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2788  putative thiol:disulfide interchange protein  42.19 
 
 
195 aa  102  9e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.982955 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3733  redoxin domain-containing protein  29.59 
 
 
262 aa  94  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.919007  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2203  redoxin domain-containing protein  39.09 
 
 
203 aa  92  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3246  redoxin domain-containing protein  33.33 
 
 
266 aa  90.1  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.575298  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2634  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.56 
 
 
272 aa  80.1  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.52704  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1895  redoxin domain-containing protein  28.99 
 
 
189 aa  79.3  0.00000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.132277 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1492  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.89 
 
 
193 aa  79  0.00000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2883  Redoxin domain-containing protein  24.22 
 
 
270 aa  75.1  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0325  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.88 
 
 
189 aa  73.9  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0365546 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0398  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  33.33 
 
 
223 aa  73.9  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0641884  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1234  redoxin domain-containing protein  31.86 
 
 
167 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0861  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.15 
 
 
189 aa  73.9  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.155376  hitchhiker  0.00638708 
 
 
-
 
NC_002936  DET0618  thiol-disulfide oxidoreductase, putative  33.09 
 
 
178 aa  73.9  0.000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1124  redoxin domain-containing protein  28.68 
 
 
181 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.65139  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4485  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.31 
 
 
200 aa  72.8  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000697653 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3362  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  30.43 
 
 
192 aa  72.4  0.000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.34018  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1598  thiol-disulfide oxidoreductase  26.8 
 
 
173 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.966744  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1412  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  31.07 
 
 
174 aa  72.4  0.000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.49361  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0096  thioredoxin family thiol:disulfide interchange protein  27.56 
 
 
203 aa  72  0.000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0098  thioredoxin family thiol:disulfide interchange protein  27.56 
 
 
203 aa  71.6  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1356  thiol-disulfide oxidoreductase  26.8 
 
 
173 aa  72  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0830  redoxin domain-containing protein  34.23 
 
 
329 aa  71.6  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1872  heat shock protein DnaJ-like  27.67 
 
 
180 aa  71.6  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.506662  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2100  thioredoxin family protein  26.62 
 
 
155 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3551  thiol:disulfide interchange protein DsbE, putative  31.03 
 
 
173 aa  70.9  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.571735 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3857  Redoxin domain protein  31.21 
 
 
220 aa  70.1  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0709217 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1396  thiol-disulfide oxidoreductase  27.07 
 
 
173 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1288  thiol:disulfide interchange protein CycY  29.17 
 
 
208 aa  69.7  0.00000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4480  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.7 
 
 
194 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0344  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.92 
 
 
183 aa  69.3  0.00000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00014833  hitchhiker  0.000312976 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1634  thiol-disulfide oxidoreductase  26.14 
 
 
173 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4129  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  25.14 
 
 
200 aa  68.9  0.00000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.213063  normal  0.330883 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1355  thiol-disulfide oxidoreductase  26.32 
 
 
173 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2023  redoxin domain-containing protein  28.77 
 
 
161 aa  68.2  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0479  thioredoxin, putative  31.93 
 
 
196 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1408  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  29.46 
 
 
185 aa  68.6  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1730  Redoxin domain-containing protein  28.26 
 
 
200 aa  68.6  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.686612  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2784  putative thioredoxin-related transmembrane protein  33.87 
 
 
174 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.744775 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1959  redoxin domain-containing protein  31.91 
 
 
189 aa  67.4  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0329542  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3603  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.08 
 
 
183 aa  67.8  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0836  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.46 
 
 
202 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.991618  unclonable  0.000000000312074 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0760  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.95 
 
 
228 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.173874 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6120  redoxin domain-containing protein  30.53 
 
 
209 aa  67.4  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.16555  normal  0.593362 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1823  redoxin domain-containing protein  27.91 
 
 
155 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0149049  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2154  redoxin domain-containing protein  27.91 
 
 
160 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00992138  normal  0.309785 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0233  Redoxin domain protein  31.78 
 
 
178 aa  68.2  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.972798  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0318  periplasmic protein thiol-disulfide oxidoreductase DsbE  27.35 
 
 
197 aa  67.4  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2682  thioredoxin  33.6 
 
 
183 aa  67  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3984  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.03 
 
 
195 aa  67.4  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000964008 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.32 
 
 
166 aa  67  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000277693  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3564  Redoxin domain protein  31.21 
 
 
220 aa  67.4  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.365622 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0110  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  28.32 
 
 
193 aa  67  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.346566  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1818  redoxin domain-containing protein  27.12 
 
 
165 aa  67  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.165387  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3204  thioredoxin family protein, putative  29.93 
 
 
180 aa  66.6  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00906791 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3088  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  29.2 
 
 
199 aa  66.6  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3819  redoxin domain-containing protein  24.82 
 
 
155 aa  67  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0554152  hitchhiker  0.000365745 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5883  Redoxin domain protein  36.7 
 
 
192 aa  66.2  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2283  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.39 
 
 
199 aa  66.2  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000858823  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0510  putative secreted protein  31.88 
 
 
209 aa  66.2  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.113668  normal  0.171566 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1885  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.54 
 
 
447 aa  66.2  0.0000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.404766  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1003  periplasmic protein thiol  25.17 
 
 
178 aa  66.6  0.0000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0767014  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2903  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.15 
 
 
184 aa  66.2  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0377  periplasmic thioredoxin (cytochrome c biogenesis)  26.95 
 
 
198 aa  66.2  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1603  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.4 
 
 
203 aa  65.9  0.0000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.673195  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0240  Redoxin domain protein  30.22 
 
 
188 aa  65.9  0.0000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0841  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.78 
 
 
174 aa  65.9  0.0000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3037  redoxin  30.52 
 
 
221 aa  65.9  0.0000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>