More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1124 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008345  Sfri_1124  redoxin domain-containing protein  100 
 
 
181 aa  374  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.65139  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1881  redoxin domain-containing protein  68.79 
 
 
160 aa  216  2e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.180208  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1823  redoxin domain-containing protein  67.13 
 
 
155 aa  211  3.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0149049  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2100  thioredoxin family protein  64.71 
 
 
155 aa  211  4.9999999999999996e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2154  redoxin domain-containing protein  67.13 
 
 
160 aa  210  7e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00992138  normal  0.309785 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2403  Redoxin domain protein  65.73 
 
 
155 aa  209  1e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000463478  hitchhiker  0.00393062 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1923  redoxin domain-containing protein  65.73 
 
 
155 aa  209  1e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00232148  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1890  redoxin domain-containing protein  65.73 
 
 
155 aa  209  2e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000501621  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1916  redoxin domain-containing protein  65.73 
 
 
155 aa  209  2e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000172621  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3819  redoxin domain-containing protein  69.06 
 
 
155 aa  207  6e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0554152  hitchhiker  0.000365745 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2087  redoxin domain-containing protein  61.44 
 
 
155 aa  204  6e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0109878  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1680  thioredoxin family protein  54.11 
 
 
173 aa  180  8.000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0732573  normal  0.832163 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2219  redoxin domain-containing protein  50 
 
 
171 aa  177  4.999999999999999e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.231269  hitchhiker  0.0012501 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1895  redoxin domain-containing protein  47.44 
 
 
189 aa  166  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.132277 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0577  redoxin  47.37 
 
 
172 aa  159  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.786564  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4599  thioredoxin family protein  54.17 
 
 
158 aa  152  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2790  putative electron transfer protein  48.67 
 
 
184 aa  149  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2293  thioredoxin family protein  47.2 
 
 
183 aa  140  8e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2330  redoxin domain-containing protein  42.29 
 
 
182 aa  139  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0220843  normal  0.114358 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1180  RecJ exonuclease  41.56 
 
 
160 aa  137  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0271144 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1572  hypothetical protein  41.72 
 
 
194 aa  134  7.000000000000001e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0149339 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1223  hypothetical protein  49.59 
 
 
172 aa  133  9.999999999999999e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2011  redoxin domain-containing protein  42.74 
 
 
174 aa  124  8.000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0343225 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2408  hypothetical protein  42.97 
 
 
160 aa  124  9e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.908805  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1566  hypothetical protein  37.18 
 
 
172 aa  121  5e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1818  redoxin domain-containing protein  32.87 
 
 
165 aa  114  6e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.165387  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0547  peroxiredoxin-like protein  34.92 
 
 
168 aa  110  9e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1221  peroxiredoxin-like protein  32.17 
 
 
173 aa  106  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3551  thiol:disulfide interchange protein DsbE, putative  30.38 
 
 
173 aa  99  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.571735 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1223  Redoxin domain protein  27.66 
 
 
170 aa  98.2  6e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.337108  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1234  redoxin domain-containing protein  31.95 
 
 
167 aa  98.2  6e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1598  thiol-disulfide oxidoreductase  29.61 
 
 
173 aa  95.9  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.966744  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1356  thiol-disulfide oxidoreductase  32.14 
 
 
173 aa  95.5  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3455  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.08 
 
 
168 aa  93.6  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.61185  normal  0.0436894 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1634  thiol-disulfide oxidoreductase  31.25 
 
 
173 aa  92.4  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1355  thiol-disulfide oxidoreductase  30.95 
 
 
173 aa  91.3  8e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3537  Redoxin domain protein  32.48 
 
 
182 aa  90.9  8e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.694899  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1566  thiol-disulfide oxidoreductase  28.92 
 
 
173 aa  89.7  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.62392e-19 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3473  Redoxin domain protein  32.48 
 
 
178 aa  90.1  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.576052  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1383  thiol-disulfide oxidoreductase  28.31 
 
 
173 aa  89  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1528  thiol-disulfide oxidoreductase  30.16 
 
 
173 aa  88.6  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1197  thiol-disulfide oxidoreductase  25.3 
 
 
173 aa  88.6  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1494  thiol-disulfide oxidoreductase  28.31 
 
 
173 aa  89  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2222  thiol-disulfide oxidoreductase  31.03 
 
 
174 aa  89  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000493791  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0399  thiol-disulfide oxidoreductase  29.6 
 
 
174 aa  88.6  5e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1612  redoxin domain-containing protein  33.54 
 
 
180 aa  88.6  5e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.422443 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3817  thiol-disulfide oxidoreductase  30.36 
 
 
173 aa  88.2  6e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000518727 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1396  thiol-disulfide oxidoreductase  27.63 
 
 
173 aa  88.2  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1843  thioredoxin-like  29.01 
 
 
164 aa  87.8  8e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2704  hypothetical protein  33.6 
 
 
205 aa  86.7  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.396222  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3390  hypothetical protein  31.06 
 
 
182 aa  86.7  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3229  thioredoxin-related protein  29.05 
 
 
170 aa  86.7  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000047722  normal  0.231945 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1954  thioredoxin  29.06 
 
 
184 aa  85.5  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3280  thioredoxin-related protein  30.07 
 
 
171 aa  84.7  6e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0403  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.92 
 
 
174 aa  84.7  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000117414  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.22 
 
 
166 aa  84.7  7e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000277693  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3822  putative thioredoxin  34.29 
 
 
164 aa  84.7  7e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.644902  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0403  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.92 
 
 
174 aa  84.3  8e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2509  putative thiol:disulfide interchange protein  33.33 
 
 
165 aa  84  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.343954  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0184  thioredoxin family protein, putative  34.9 
 
 
171 aa  84  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.148169 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2046  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  33.33 
 
 
437 aa  82.8  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0189188  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0496  redoxin domain-containing protein  31.06 
 
 
166 aa  83.2  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.520975  normal  0.448467 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4653  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.64 
 
 
191 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000929627  normal  0.021972 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1857  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.51 
 
 
280 aa  83.2  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0364  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.07 
 
 
170 aa  82.8  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000189648  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0572  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  33.11 
 
 
189 aa  82  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220825  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0746  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.09 
 
 
200 aa  81.6  0.000000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.204935  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2982  hypothetical protein  28.19 
 
 
174 aa  81.6  0.000000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.138377  normal  0.0639379 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0221  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.58 
 
 
198 aa  80.9  0.000000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000103908  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0185  redoxin domain-containing protein  33.33 
 
 
179 aa  80.9  0.000000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000121029  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4444  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.82 
 
 
196 aa  80.5  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.133035 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3721  redoxin domain-containing protein  33.64 
 
 
195 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000547051  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2903  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.82 
 
 
184 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1376  Redoxin domain protein  29.57 
 
 
155 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0681198  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0318  hypothetical protein  34.96 
 
 
166 aa  80.1  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0164115  normal  0.0202423 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4480  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.31 
 
 
194 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0181  alkyl hydroperoxide reductase  31.11 
 
 
183 aa  79.7  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0243778  normal  0.461108 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0479  thioredoxin, putative  30.77 
 
 
196 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2006  redoxin domain-containing protein  34.56 
 
 
176 aa  79.7  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0112011  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4448  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.51 
 
 
382 aa  80.1  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.510113  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4005  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.58 
 
 
194 aa  79  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0196  redoxin domain-containing protein  30.89 
 
 
195 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000417571  normal  0.0470366 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18200  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.47 
 
 
178 aa  79.3  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000397372  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0506  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.11 
 
 
175 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0010915  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0861  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.27 
 
 
189 aa  79  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.155376  hitchhiker  0.00638708 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1959  redoxin domain-containing protein  31.75 
 
 
189 aa  79  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0329542  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0269  thioredoxin, putative  30.89 
 
 
194 aa  79  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6578  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.46 
 
 
185 aa  78.6  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.861573 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0860  Redoxin domain protein  31.13 
 
 
162 aa  79  0.00000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00216693  normal  0.0861373 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4281  redoxin domain-containing protein  29.01 
 
 
192 aa  79  0.00000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000444464  normal  0.0383421 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1597  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.15 
 
 
650 aa  78.6  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.596223 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2095  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.14 
 
 
288 aa  78.6  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.411423  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3927  thioredoxin-like  29.77 
 
 
174 aa  78.2  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298512  normal  0.186192 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4837  redoxin  36.89 
 
 
269 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3603  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.66 
 
 
183 aa  78.6  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3329  redoxin domain-containing protein  36.89 
 
 
269 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.531271 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4186  redoxin domain-containing protein  36.89 
 
 
269 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.855693  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0237  redoxin domain-containing protein  31.78 
 
 
193 aa  78.2  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000458104  hitchhiker  0.00000000877704 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0232  redoxin domain-containing protein  31.78 
 
 
193 aa  78.2  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000057561  normal  0.0469952 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0237  redoxin domain-containing protein  31.78 
 
 
193 aa  78.2  0.00000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000132187  unclonable  0.000000000045327 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>