More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4480 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_4480  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  100 
 
 
194 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0476  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  85.88 
 
 
177 aa  325  3e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0479  thioredoxin, putative  78.35 
 
 
196 aa  323  7e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0345  redoxin domain-containing protein  59.54 
 
 
211 aa  235  3e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3880  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  57.47 
 
 
194 aa  229  2e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0476  thioredoxin, putative  58.38 
 
 
194 aa  228  5e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4005  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  52.33 
 
 
194 aa  226  1e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0485  redoxin domain-containing protein  54.74 
 
 
194 aa  224  4e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0486  redoxin domain-containing protein  56.65 
 
 
194 aa  224  7e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3545  redoxin domain-containing protein  54.21 
 
 
194 aa  223  1e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.65179  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3367  redoxin domain-containing protein  52.91 
 
 
194 aa  212  1.9999999999999998e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0185  redoxin domain-containing protein  39.39 
 
 
179 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000121029  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0237  redoxin domain-containing protein  36.69 
 
 
193 aa  123  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000132187  unclonable  0.000000000045327 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0269  thioredoxin, putative  36.69 
 
 
194 aa  122  4e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4281  redoxin domain-containing protein  37.04 
 
 
192 aa  121  5e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000444464  normal  0.0383421 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0237  redoxin domain-containing protein  35.97 
 
 
193 aa  121  5e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000458104  hitchhiker  0.00000000877704 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0232  redoxin domain-containing protein  35.97 
 
 
193 aa  121  5e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000057561  normal  0.0469952 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0234  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.81 
 
 
195 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000676147  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0237  redoxin domain-containing protein  35.81 
 
 
195 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000304189  normal  0.555945 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0196  redoxin domain-containing protein  34.46 
 
 
195 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000417571  normal  0.0470366 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0234  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.41 
 
 
195 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000290768  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3721  redoxin domain-containing protein  31.98 
 
 
195 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000547051  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4018  Redoxin domain protein  37.41 
 
 
195 aa  119  3e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000656655  hitchhiker  0.00619092 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0251  thioredoxin, putative  32.14 
 
 
193 aa  115  3e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000212412  normal  0.0823497 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4653  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.56 
 
 
191 aa  115  5e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000929627  normal  0.021972 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0221  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.07 
 
 
198 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000103908  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4643  putative thiol--disulfide interchange redox-active center transmembrane protein  26.84 
 
 
193 aa  101  7e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0398  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  33.1 
 
 
223 aa  98.6  5e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0641884  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3474  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.78 
 
 
169 aa  98.2  7e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.163841 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3412  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.78 
 
 
169 aa  95.9  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2678  thioredoxin family protein  33.57 
 
 
183 aa  94.7  8e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4016  thiol:disulfide interchange protein  32.48 
 
 
220 aa  92.4  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0716  thioredoxin-like protein  32.14 
 
 
223 aa  90.9  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.620578 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1401  redoxin domain-containing protein  29.8 
 
 
191 aa  90.9  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.774278  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3478  thioredoxin-like protein  31.55 
 
 
223 aa  89.7  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3382  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.89 
 
 
202 aa  89  4e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.305938 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2865  redoxin domain-containing protein  34.13 
 
 
170 aa  89  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.220691  normal  0.154484 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0746  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.68 
 
 
200 aa  88.2  7e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.204935  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0547  peroxiredoxin-like protein  29.58 
 
 
168 aa  87  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2046  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  31.34 
 
 
437 aa  86.3  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0189188  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1603  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.5 
 
 
203 aa  87  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.673195  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2370  redoxin domain-containing protein  25.32 
 
 
195 aa  86.7  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.36236 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1895  redoxin domain-containing protein  32.47 
 
 
189 aa  85.9  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.132277 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2023  redoxin domain-containing protein  31.39 
 
 
161 aa  85.9  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2006  redoxin domain-containing protein  32.86 
 
 
176 aa  86.3  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0112011  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4876  thioredoxin-like  33.59 
 
 
224 aa  86.3  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.608782  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3488  Redoxin domain protein  28.97 
 
 
216 aa  85.1  6e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.207064 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1737  redoxin domain-containing protein  28.66 
 
 
210 aa  85.1  6e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.958182  normal  0.712311 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1144  Thiol disulfide interchange protein tlpA (cytochrome c biogenesis protein tlpA)  28.41 
 
 
229 aa  84  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.243856  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3502  hypothetical protein  31.91 
 
 
223 aa  84.3  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.460677 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2535  redoxin domain-containing protein  30.86 
 
 
224 aa  83.2  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.772759 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2276  Redoxin domain protein  33.57 
 
 
171 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3210  redoxin domain-containing protein  33.33 
 
 
209 aa  82.8  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.541056 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0053  anti-oxidant AhpCTSA family protein  28.49 
 
 
232 aa  82.4  0.000000000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3738  redoxin domain-containing protein  29.17 
 
 
268 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1239  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  28.37 
 
 
422 aa  82.4  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.502856  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1818  redoxin domain-containing protein  26.49 
 
 
165 aa  82  0.000000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.165387  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1234  redoxin domain-containing protein  25.32 
 
 
167 aa  82  0.000000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0935  thioredoxin-like  29.19 
 
 
222 aa  81.6  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3774  thiol-disulfide isomerase-like protein  25.78 
 
 
173 aa  81.3  0.000000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.166782  normal  0.0186728 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1768  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.55 
 
 
446 aa  81.3  0.000000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.197214  normal  0.508736 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2397  Redoxin domain protein  33.04 
 
 
267 aa  80.9  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.675955  normal  0.672629 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1890  redoxin domain-containing protein  31.78 
 
 
155 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000501621  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2100  thioredoxin family protein  33.63 
 
 
155 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1923  redoxin domain-containing protein  31.78 
 
 
155 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00232148  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1049  thioredoxin  30.86 
 
 
167 aa  79.7  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4503  redoxin domain-containing protein  29.32 
 
 
213 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1221  peroxiredoxin-like protein  26.57 
 
 
173 aa  80.1  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3611  Redoxin domain protein  29.2 
 
 
213 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.338922  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1916  redoxin domain-containing protein  31.78 
 
 
155 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000172621  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11808  thioredoxin, putative  30.6 
 
 
211 aa  80.1  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2403  Redoxin domain protein  31.78 
 
 
155 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000463478  hitchhiker  0.00393062 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5226  Redoxin domain protein  28.57 
 
 
228 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.387928  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0272  thioredoxin family protein  28.35 
 
 
182 aa  79.3  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.900103 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0826  thioredoxin-like protein  32.19 
 
 
222 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6578  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.59 
 
 
185 aa  79.7  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.861573 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1124  redoxin domain-containing protein  32.31 
 
 
181 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.65139  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0325  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.94 
 
 
189 aa  79  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0365546 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3739  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.85 
 
 
170 aa  79  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0260987  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5968  Redoxin domain protein  28.03 
 
 
197 aa  79  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.566817  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1947  redoxin  28.69 
 
 
198 aa  78.6  0.00000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.489864  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1759  hypothetical protein  29.82 
 
 
279 aa  78.2  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.416831  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1598  thiol-disulfide oxidoreductase  26.71 
 
 
173 aa  77.8  0.00000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.966744  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1356  thiol-disulfide oxidoreductase  26.95 
 
 
173 aa  77.8  0.00000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1321  thioredoxin family protein  30.66 
 
 
168 aa  77  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4444  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.77 
 
 
196 aa  77  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.133035 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1954  thioredoxin  27.66 
 
 
184 aa  76.6  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2452  thioredoxin family protein  29.93 
 
 
170 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000374764  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3288  redoxin domain-containing protein  28.47 
 
 
213 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3043  thioredoxin family protein  29.25 
 
 
433 aa  76.6  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3623  ahpC/TSA family protein  31.06 
 
 
191 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000131744 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3405  ahpC/TSA family protein  31.06 
 
 
191 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3367  AhpC/TSA family protein  31.06 
 
 
191 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0144546  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3937  thiol:disulfide interchange protein DsbE, putative  28.7 
 
 
290 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.144233  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3674  ahpC/TSA family protein  31.06 
 
 
191 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.309572  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2903  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.46 
 
 
184 aa  75.9  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3317  AhpC/TSA family protein  31.06 
 
 
191 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1396  thiol-disulfide oxidoreductase  27.66 
 
 
173 aa  75.5  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2283  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.45 
 
 
199 aa  75.5  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000858823  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3951  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  27.08 
 
 
188 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.337329 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>