More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3551 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_3551  thiol:disulfide interchange protein DsbE, putative  100 
 
 
173 aa  360  4e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.571735 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1818  redoxin domain-containing protein  52.73 
 
 
165 aa  181  4.0000000000000006e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.165387  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0547  peroxiredoxin-like protein  51.41 
 
 
168 aa  163  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1221  peroxiredoxin-like protein  51.06 
 
 
173 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1234  redoxin domain-containing protein  43.45 
 
 
167 aa  151  4e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0861  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.49 
 
 
189 aa  121  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.155376  hitchhiker  0.00638708 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0325  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.15 
 
 
189 aa  117  7e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0365546 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1566  hypothetical protein  35.15 
 
 
172 aa  115  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1223  hypothetical protein  34.55 
 
 
172 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0525  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  39.52 
 
 
178 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000136072  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1358  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  39.13 
 
 
179 aa  108  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000315647  hitchhiker  0.00000356135 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1843  thioredoxin-like  37.35 
 
 
164 aa  108  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3819  redoxin domain-containing protein  33.81 
 
 
155 aa  108  5e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0554152  hitchhiker  0.000365745 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2408  hypothetical protein  36.92 
 
 
160 aa  106  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.908805  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1223  Redoxin domain protein  33.13 
 
 
170 aa  107  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.337108  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2330  redoxin domain-containing protein  36.54 
 
 
182 aa  107  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0220843  normal  0.114358 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0577  redoxin  31.88 
 
 
172 aa  105  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.786564  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1857  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.77 
 
 
280 aa  105  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2219  redoxin domain-containing protein  32.1 
 
 
171 aa  105  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.231269  hitchhiker  0.0012501 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2523  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  41.6 
 
 
369 aa  105  4e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.434668  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1598  thiol-disulfide oxidoreductase  34.01 
 
 
173 aa  104  6e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.966744  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1356  thiol-disulfide oxidoreductase  34.01 
 
 
173 aa  104  6e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2908  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  39.13 
 
 
199 aa  104  7e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.629655  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1566  thiol-disulfide oxidoreductase  35.37 
 
 
173 aa  103  9e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.62392e-19 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3817  thiol-disulfide oxidoreductase  34.69 
 
 
173 aa  103  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000518727 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1383  thiol-disulfide oxidoreductase  34.69 
 
 
173 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4444  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.82 
 
 
196 aa  102  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.133035 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1528  thiol-disulfide oxidoreductase  34.69 
 
 
173 aa  103  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1494  thiol-disulfide oxidoreductase  34.69 
 
 
173 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1396  thiol-disulfide oxidoreductase  39.02 
 
 
173 aa  103  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2087  redoxin domain-containing protein  33.33 
 
 
155 aa  102  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0109878  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0760  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.62 
 
 
228 aa  102  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.173874 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1355  thiol-disulfide oxidoreductase  34.01 
 
 
173 aa  101  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2222  thiol-disulfide oxidoreductase  35.71 
 
 
174 aa  102  4e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000493791  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1634  thiol-disulfide oxidoreductase  33.33 
 
 
173 aa  102  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3412  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.64 
 
 
169 aa  101  6e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4448  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  41.27 
 
 
382 aa  100  8e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.510113  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3474  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  39.47 
 
 
169 aa  100  8e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.163841 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2011  redoxin domain-containing protein  35.04 
 
 
174 aa  100  9e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0343225 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3455  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.77 
 
 
168 aa  100  9e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.61185  normal  0.0436894 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1895  redoxin domain-containing protein  31.65 
 
 
189 aa  100  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.132277 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1197  thiol-disulfide oxidoreductase  33.58 
 
 
173 aa  99.4  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2100  thioredoxin family protein  29.58 
 
 
155 aa  99.4  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2939  redoxin domain-containing protein  32.96 
 
 
179 aa  99.8  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.670984  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1572  hypothetical protein  34.78 
 
 
194 aa  99  3e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0149339 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0240  Redoxin domain protein  37.29 
 
 
188 aa  98.6  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1124  redoxin domain-containing protein  30.38 
 
 
181 aa  99  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.65139  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1959  redoxin domain-containing protein  38.89 
 
 
189 aa  99  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0329542  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1860  cytochrome c biogenesis protein, thiol-disulfide interchange protein  40.68 
 
 
173 aa  98.6  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2283  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.9 
 
 
199 aa  97.8  6e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000858823  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0830  redoxin domain-containing protein  35.83 
 
 
329 aa  97.8  6e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1823  redoxin domain-containing protein  30.5 
 
 
155 aa  97.8  6e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0149049  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.03 
 
 
166 aa  97.4  8e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000277693  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2154  redoxin domain-containing protein  30.5 
 
 
160 aa  97.4  8e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00992138  normal  0.309785 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2790  putative electron transfer protein  33.91 
 
 
184 aa  97.1  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1881  redoxin domain-containing protein  29.79 
 
 
160 aa  96.7  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.180208  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2403  Redoxin domain protein  30.22 
 
 
155 aa  96.3  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000463478  hitchhiker  0.00393062 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1916  redoxin domain-containing protein  30.22 
 
 
155 aa  96.3  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000172621  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1923  redoxin domain-containing protein  30.22 
 
 
155 aa  96.3  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00232148  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18200  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  38.02 
 
 
178 aa  96.7  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000397372  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3317  AhpC/TSA family protein  42.11 
 
 
191 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6264  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.69 
 
 
173 aa  95.9  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.92814  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1890  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.4 
 
 
171 aa  96.3  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.326681  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3720  ahpC/TSA family protein  40.35 
 
 
191 aa  96.3  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0399  thiol-disulfide oxidoreductase  32.67 
 
 
174 aa  96.3  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1890  redoxin domain-containing protein  30.22 
 
 
155 aa  96.3  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000501621  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2000  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  39.83 
 
 
173 aa  96.7  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.236605  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0591  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.59 
 
 
179 aa  95.9  2e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0918415  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1321  thioredoxin family protein  40.65 
 
 
168 aa  95.9  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3405  ahpC/TSA family protein  42.11 
 
 
191 aa  95.5  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3367  AhpC/TSA family protein  42.11 
 
 
191 aa  95.5  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0144546  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3674  ahpC/TSA family protein  42.11 
 
 
191 aa  95.5  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.309572  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3623  ahpC/TSA family protein  42.11 
 
 
191 aa  95.5  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000131744 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1248  redoxin  39.42 
 
 
192 aa  95.5  3e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.525672 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2085  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  38.26 
 
 
173 aa  95.5  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5620  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.43 
 
 
240 aa  94.4  7e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.239574 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2095  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.17 
 
 
288 aa  94.4  7e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.411423  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3537  Redoxin domain protein  33.79 
 
 
182 aa  94.4  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.694899  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3473  Redoxin domain protein  31.37 
 
 
178 aa  94.4  7e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.576052  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1435  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.1 
 
 
168 aa  94  8e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0354049 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0181  alkyl hydroperoxide reductase  35.95 
 
 
183 aa  94.4  8e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0243778  normal  0.461108 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0735  redoxin domain-containing protein  33.57 
 
 
211 aa  94  8e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3632  ahpC/TSA family protein  41.23 
 
 
191 aa  94  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0183092  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1834  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.8 
 
 
381 aa  94  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3298  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  41.23 
 
 
191 aa  94  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.61408  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1638  thioredoxin family protein  34.31 
 
 
328 aa  92.8  2e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1954  thioredoxin  31.43 
 
 
184 aa  93.2  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1661  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  38.84 
 
 
192 aa  92.8  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1829  peroxiredoxin-like  39.2 
 
 
167 aa  93.2  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000091081  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3390  hypothetical protein  32.17 
 
 
182 aa  92.8  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3739  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.29 
 
 
170 aa  93.2  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0260987  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0190  cytochrome c biogenesis protein, putative  37.5 
 
 
201 aa  91.7  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.648376  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3638  ahpC/TSA family protein  40.35 
 
 
191 aa  92  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00315479  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0274  cytochrome c biogenesis protein, putative  37.5 
 
 
194 aa  91.7  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6578  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.04 
 
 
185 aa  91.3  6e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.861573 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1947  redoxin  33.82 
 
 
198 aa  90.9  8e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.489864  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1533  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.61 
 
 
193 aa  90.9  8e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2261  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.72 
 
 
191 aa  90.5  9e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.124304  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1680  thioredoxin family protein  28.17 
 
 
173 aa  90.1  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0732573  normal  0.832163 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2293  thioredoxin family protein  33.33 
 
 
183 aa  90.1  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>