More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2788 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_2788  putative thiol:disulfide interchange protein  100 
 
 
195 aa  390  1e-108  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.982955 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2789  thiol:disulfide interchange protein  66.43 
 
 
269 aa  186  2e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2252  putative thiol:disulfide interchange protein  54.55 
 
 
271 aa  174  7e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3826  redoxin domain-containing protein  50 
 
 
279 aa  150  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3550  redoxin domain-containing protein  52.53 
 
 
278 aa  144  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.054429 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2761  thiol:disulfide interchange protein  50.66 
 
 
278 aa  136  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.376077  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3738  redoxin domain-containing protein  53.03 
 
 
268 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32600  thiol:disulfide interchange protein  50 
 
 
278 aa  135  5e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.251961  normal  0.0539892 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3937  thiol:disulfide interchange protein DsbE, putative  42.78 
 
 
290 aa  132  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.144233  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0511  redoxin domain-containing protein  44.44 
 
 
270 aa  131  6e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.662182 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2395  thioredoxin-like protein  46.63 
 
 
278 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000335524  hitchhiker  0.0000244413 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1703  redoxin domain-containing protein  45.65 
 
 
273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2593  putative thiol:disulfide interchange protein  50 
 
 
276 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.357458  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2397  Redoxin domain protein  51.8 
 
 
267 aa  128  4.0000000000000003e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.675955  normal  0.672629 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3802  redoxin domain-containing protein  43.43 
 
 
278 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1759  hypothetical protein  40.78 
 
 
279 aa  127  9.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.416831  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00100  putative thiol:disulfide interchange protein  42.14 
 
 
277 aa  125  3e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1628  redoxin domain-containing protein  42.86 
 
 
278 aa  124  7e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0881722  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3560  redoxin domain-containing protein  45.33 
 
 
278 aa  124  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4236  redoxin domain protein  42.29 
 
 
278 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1356  redoxin domain-containing protein  42.42 
 
 
278 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.052167  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2921  Thiol-disulfide isomerase/thioredoxin-like  46.26 
 
 
269 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.253355  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4210  redoxin domain-containing protein  45.16 
 
 
269 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4240  redoxin domain-containing protein  52 
 
 
332 aa  116  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0223129  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4186  redoxin domain-containing protein  43.87 
 
 
269 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.855693  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4837  redoxin  43.87 
 
 
269 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3329  redoxin domain-containing protein  43.87 
 
 
269 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.531271 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5120  redoxin domain-containing protein  45.58 
 
 
269 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.329832 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3262  redoxin domain-containing protein  45.83 
 
 
269 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0170639  normal  0.755125 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2109  redoxin  42.19 
 
 
271 aa  109  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1412  Redoxin domain protein  50.91 
 
 
263 aa  103  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2433  redoxin domain-containing protein  50.91 
 
 
277 aa  103  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.983249 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3733  redoxin domain-containing protein  41.67 
 
 
262 aa  102  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.919007  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3246  redoxin domain-containing protein  41.27 
 
 
266 aa  101  6e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.575298  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2015  Redoxin domain protein  40.98 
 
 
169 aa  98.6  5e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.878112  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1468  Redoxin domain-containing protein  36.54 
 
 
164 aa  95.9  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0261888  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1492  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.11 
 
 
193 aa  90.5  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2634  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  40.18 
 
 
272 aa  78.6  0.00000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.52704  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6120  redoxin domain-containing protein  30.2 
 
 
209 aa  77.8  0.00000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.16555  normal  0.593362 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0861  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.83 
 
 
189 aa  75.9  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.155376  hitchhiker  0.00638708 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2883  Redoxin domain-containing protein  34.48 
 
 
270 aa  74.7  0.0000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0272  thioredoxin family protein  38.05 
 
 
182 aa  73.9  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.900103 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2618  Redoxin domain protein  35.19 
 
 
174 aa  73.2  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.548372 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2203  redoxin domain-containing protein  41.5 
 
 
203 aa  73.2  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3028  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.57 
 
 
174 aa  72.8  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0344  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.43 
 
 
183 aa  72.8  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00014833  hitchhiker  0.000312976 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1248  redoxin  34.56 
 
 
192 aa  71.6  0.000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.525672 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2777  redoxin domain-containing protein  35.66 
 
 
182 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.769829  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3631  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.43 
 
 
187 aa  70.1  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.540722  normal  0.6253 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0325  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.63 
 
 
189 aa  70.1  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0365546 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1730  Redoxin domain-containing protein  32.06 
 
 
200 aa  70.1  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.686612  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0717  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.59 
 
 
191 aa  69.7  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.17044  normal  0.602428 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0124  redoxin  34.88 
 
 
182 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.909527  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0607  redoxin domain-containing protein  34.88 
 
 
182 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2283  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.3 
 
 
199 aa  69.3  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000858823  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0576  redoxin domain-containing protein  34.88 
 
 
183 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000460325 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1408  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  33.77 
 
 
185 aa  68.9  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0533  redoxin domain-containing protein  34.88 
 
 
183 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.917814  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3690  Thiol-disulfide isomerase/thioredoxin-like  34.38 
 
 
183 aa  67.8  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.405129 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2784  putative thioredoxin-related transmembrane protein  33.9 
 
 
174 aa  67.8  0.00000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.744775 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1872  heat shock protein DnaJ-like  29.63 
 
 
180 aa  67.8  0.00000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.506662  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0470  putative thiol:disulfide interchange protein  35.77 
 
 
266 aa  67.8  0.00000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.776778  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0509  redoxin domain-containing protein  34.11 
 
 
184 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2013  thiol:disulfide interchange protein, thioredoxin family protein  29.41 
 
 
176 aa  66.2  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0087  thiol-disulfide isomerase-like protein  38.61 
 
 
170 aa  65.9  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.653321  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0534  putative thioredoxin  35.38 
 
 
180 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.677226 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4129  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  36.97 
 
 
200 aa  65.5  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.213063  normal  0.330883 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3498  thioredoxin  34.11 
 
 
202 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3424  Redoxin domain protein  33.81 
 
 
183 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0519333  normal  0.0539833 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1279  putative thioredoxin family protein  34.11 
 
 
186 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3285  putative thioredoxin family protein  34.11 
 
 
186 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0420  putative thioredoxin family protein  34.11 
 
 
186 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2499  thioredoxin family protein, putative  34.11 
 
 
186 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.129809  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3501  thioredoxin family protein  34.11 
 
 
186 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.511578  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3463  thioredoxin family protein  34.11 
 
 
186 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0841  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.33 
 
 
174 aa  64.7  0.0000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2452  thioredoxin family protein  33.04 
 
 
170 aa  63.9  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000374764  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1165  thioredoxin family protein, putative  34.11 
 
 
202 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2678  thioredoxin family protein  30.32 
 
 
183 aa  64.3  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.45 
 
 
166 aa  63.9  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000277693  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0243  redoxin domain-containing protein  33.07 
 
 
184 aa  64.3  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.487537  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2010  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.67 
 
 
399 aa  63.2  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6861  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.44 
 
 
191 aa  63.5  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1954  thioredoxin  32.09 
 
 
184 aa  63.5  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2202  redoxin domain-containing protein  36.04 
 
 
194 aa  63.2  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0050  redoxin domain-containing protein  29.79 
 
 
180 aa  63.2  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.577845  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0830  redoxin domain-containing protein  28.7 
 
 
329 aa  62.8  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0200  thioredoxin domain-containing protein  39.42 
 
 
189 aa  63.2  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0485  redoxin domain-containing protein  34.48 
 
 
194 aa  62.8  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36790  thioredoxin  37.29 
 
 
156 aa  62.4  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2276  Redoxin domain protein  33.06 
 
 
171 aa  62.4  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0212  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.8 
 
 
175 aa  62  0.000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2114  thioredoxin family protein  33.93 
 
 
159 aa  62  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.14615  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2023  redoxin domain-containing protein  33.03 
 
 
161 aa  62  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3474  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.95 
 
 
169 aa  61.6  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.163841 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0237  redoxin domain-containing protein  29.57 
 
 
193 aa  61.6  0.000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000458104  hitchhiker  0.00000000877704 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0232  redoxin domain-containing protein  29.57 
 
 
193 aa  61.6  0.000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000057561  normal  0.0469952 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3412  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.95 
 
 
169 aa  61.2  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0022  thiol:disulfide interchange protein, thioredoxin family protein  25.69 
 
 
175 aa  61.2  0.000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.117242 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3545  redoxin domain-containing protein  33.62 
 
 
194 aa  61.2  0.000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.65179  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>