More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0087 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_0087  thiol-disulfide isomerase-like protein  100 
 
 
170 aa  347  3e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.653321  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3774  thiol-disulfide isomerase-like protein  47.37 
 
 
173 aa  166  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.166782  normal  0.0186728 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1383  thioredoxin family protein  31.76 
 
 
168 aa  97.1  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.12426  normal  0.0879111 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0398  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  43.75 
 
 
223 aa  92.8  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0641884  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1435  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.18 
 
 
168 aa  92.8  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0354049 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1468  Redoxin domain-containing protein  35.77 
 
 
164 aa  92  4e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0261888  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1401  redoxin domain-containing protein  31.95 
 
 
191 aa  92  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.774278  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0725  thioredoxin, thioldisulfide interchange protein  32.58 
 
 
183 aa  89.4  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.409063  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2724  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.53 
 
 
188 aa  89.7  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.32328  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2380  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.58 
 
 
183 aa  89.7  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.632646 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2444  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.33 
 
 
183 aa  89  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.312621  normal  0.571857 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3502  hypothetical protein  37.1 
 
 
223 aa  87  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.460677 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1321  thioredoxin family protein  30.43 
 
 
168 aa  85.9  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2006  redoxin domain-containing protein  30.6 
 
 
176 aa  85.5  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0112011  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2452  thioredoxin family protein  29.32 
 
 
170 aa  85.1  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000374764  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3739  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.74 
 
 
170 aa  84.7  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0260987  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2865  redoxin domain-containing protein  32.89 
 
 
170 aa  84.3  7e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.220691  normal  0.154484 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3560  redoxin domain-containing protein  38.02 
 
 
278 aa  84.3  7e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.5 
 
 
166 aa  84.3  7e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000277693  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0272  thioredoxin family protein  33.08 
 
 
182 aa  84.3  8e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.900103 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4236  redoxin domain protein  38.02 
 
 
278 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1628  redoxin domain-containing protein  38.02 
 
 
278 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0881722  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1561  thioredoxin  32.68 
 
 
164 aa  83.6  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00616006  normal  0.258468 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4016  thiol:disulfide interchange protein  35.43 
 
 
220 aa  84  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3474  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.1 
 
 
169 aa  83.6  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.163841 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2903  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.16 
 
 
184 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1221  peroxiredoxin-like protein  32.48 
 
 
173 aa  82.4  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3802  redoxin domain-containing protein  38.02 
 
 
278 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0345  redoxin domain-containing protein  33.83 
 
 
211 aa  82  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1905  putative thiol:disulfide interchange protein  34.85 
 
 
238 aa  81.6  0.000000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3367  redoxin domain-containing protein  29.46 
 
 
194 aa  82  0.000000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0399  thiol-disulfide oxidoreductase  30.82 
 
 
174 aa  81.3  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0511  redoxin domain-containing protein  35.59 
 
 
270 aa  81.6  0.000000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.662182 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3412  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.36 
 
 
169 aa  81.3  0.000000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1980  thiol:disulfide interchange protein, putative  34.06 
 
 
238 aa  80.9  0.000000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2276  Redoxin domain protein  28.05 
 
 
171 aa  80.9  0.000000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0525  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.62 
 
 
178 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000136072  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1000  redoxin domain-containing protein  33.82 
 
 
238 aa  80.1  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3880  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.41 
 
 
194 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4563  redoxin domain-containing protein  35.19 
 
 
237 aa  79.7  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3631  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.69 
 
 
187 aa  79.7  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.540722  normal  0.6253 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2203  redoxin domain-containing protein  38.68 
 
 
203 aa  79.3  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1890  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.14 
 
 
171 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.326681  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4005  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.33 
 
 
194 aa  78.6  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1954  thioredoxin  29.31 
 
 
184 aa  78.6  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0935  thioredoxin-like  35.34 
 
 
222 aa  78.6  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1144  Thiol disulfide interchange protein tlpA (cytochrome c biogenesis protein tlpA)  34.88 
 
 
229 aa  78.6  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.243856  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2370  redoxin domain-containing protein  33.07 
 
 
195 aa  78.6  0.00000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.36236 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11808  thioredoxin, putative  32 
 
 
211 aa  78.6  0.00000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1603  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.09 
 
 
203 aa  78.2  0.00000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.673195  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5883  Redoxin domain protein  32.14 
 
 
192 aa  77.4  0.00000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3418  thioredoxin-like protein  34.31 
 
 
166 aa  77.4  0.00000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.308929  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2627  redoxin domain-containing protein  31.71 
 
 
182 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1356  thiol-disulfide oxidoreductase  27.33 
 
 
173 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3721  redoxin domain-containing protein  31.06 
 
 
195 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000547051  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1165  thioredoxin family protein, putative  34.75 
 
 
202 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0344  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.33 
 
 
183 aa  76.6  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00014833  hitchhiker  0.000312976 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3250  hypothetical protein  31.1 
 
 
165 aa  76.6  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.131239  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0716  thioredoxin-like protein  32.56 
 
 
223 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.620578 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2222  thiol-disulfide oxidoreductase  30.77 
 
 
174 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000493791  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3951  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  28 
 
 
188 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.337329 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1197  thiol-disulfide oxidoreductase  29.73 
 
 
173 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0572  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  33.61 
 
 
189 aa  75.9  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220825  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0053  anti-oxidant AhpCTSA family protein  31.62 
 
 
232 aa  76.6  0.0000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2212  thioredoxin-like  26.92 
 
 
133 aa  76.3  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.249121  normal  0.498719 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3424  Redoxin domain protein  33.11 
 
 
183 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0519333  normal  0.0539833 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1396  thiol-disulfide oxidoreductase  26.97 
 
 
173 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4210  redoxin domain-containing protein  36 
 
 
269 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2283  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.17 
 
 
199 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000858823  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2023  redoxin domain-containing protein  30.08 
 
 
161 aa  76.6  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1598  thiol-disulfide oxidoreductase  27.78 
 
 
173 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.966744  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1279  putative thioredoxin family protein  31.71 
 
 
186 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2015  Redoxin domain protein  35.71 
 
 
169 aa  75.5  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.878112  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0420  putative thioredoxin family protein  31.71 
 
 
186 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2499  thioredoxin family protein, putative  31.71 
 
 
186 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.129809  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3463  thioredoxin family protein  31.71 
 
 
186 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3501  thioredoxin family protein  31.71 
 
 
186 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.511578  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0826  thioredoxin-like protein  34.59 
 
 
222 aa  75.9  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1180  RecJ exonuclease  32.23 
 
 
160 aa  75.9  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0271144 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0479  thioredoxin, putative  24.32 
 
 
196 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1239  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  29.56 
 
 
422 aa  75.5  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.502856  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3037  redoxin  36.09 
 
 
221 aa  75.9  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0237  redoxin domain-containing protein  31.45 
 
 
193 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000132187  unclonable  0.000000000045327 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3285  putative thioredoxin family protein  31.71 
 
 
186 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0510  putative secreted protein  36.94 
 
 
209 aa  75.1  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.113668  normal  0.171566 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3551  thiol:disulfide interchange protein DsbE, putative  32.74 
 
 
173 aa  75.1  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.571735 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4643  putative thiol--disulfide interchange redox-active center transmembrane protein  31.13 
 
 
193 aa  75.5  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1818  redoxin domain-containing protein  28.7 
 
 
165 aa  75.5  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.165387  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1187  Redoxin domain protein  31.65 
 
 
225 aa  75.1  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.151473 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0234  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.65 
 
 
195 aa  75.1  0.0000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000290768  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8082  Redoxin domain protein  33.33 
 
 
180 aa  74.7  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5421  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.98 
 
 
194 aa  75.1  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.305949 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3498  thioredoxin  32.2 
 
 
202 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0234  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.65 
 
 
195 aa  74.7  0.0000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000676147  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1248  redoxin  31.88 
 
 
192 aa  74.7  0.0000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.525672 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0237  redoxin domain-containing protein  30.65 
 
 
195 aa  74.7  0.0000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000304189  normal  0.555945 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6120  redoxin domain-containing protein  33.33 
 
 
209 aa  75.1  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.16555  normal  0.593362 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1355  thiol-disulfide oxidoreductase  26.98 
 
 
173 aa  74.7  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0547  peroxiredoxin-like protein  31.3 
 
 
168 aa  74.3  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3478  thioredoxin-like protein  32.33 
 
 
223 aa  74.7  0.0000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>