More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1703 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_1703  redoxin domain-containing protein  100 
 
 
273 aa  543  1e-154  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3826  redoxin domain-containing protein  45.32 
 
 
279 aa  240  2e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2593  putative thiol:disulfide interchange protein  44.85 
 
 
276 aa  221  7e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.357458  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2789  thiol:disulfide interchange protein  45.32 
 
 
269 aa  212  4.9999999999999996e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2252  putative thiol:disulfide interchange protein  41.32 
 
 
271 aa  189  5e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3560  redoxin domain-containing protein  39.1 
 
 
278 aa  185  6e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4236  redoxin domain protein  39.33 
 
 
278 aa  185  7e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1628  redoxin domain-containing protein  39.33 
 
 
278 aa  184  9e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0881722  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2109  redoxin  35.34 
 
 
271 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3937  thiol:disulfide interchange protein DsbE, putative  40.38 
 
 
290 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.144233  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3802  redoxin domain-containing protein  38.95 
 
 
278 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2395  thioredoxin-like protein  35.69 
 
 
278 aa  169  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000335524  hitchhiker  0.0000244413 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3738  redoxin domain-containing protein  42.15 
 
 
268 aa  169  4e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1759  hypothetical protein  42.04 
 
 
279 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.416831  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00100  putative thiol:disulfide interchange protein  30.77 
 
 
277 aa  162  4.0000000000000004e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3550  redoxin domain-containing protein  40.24 
 
 
278 aa  160  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.054429 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1356  redoxin domain-containing protein  38.22 
 
 
278 aa  156  3e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.052167  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0511  redoxin domain-containing protein  34.7 
 
 
270 aa  152  4e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.662182 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2921  Thiol-disulfide isomerase/thioredoxin-like  35.96 
 
 
269 aa  150  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.253355  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3329  redoxin domain-containing protein  38.53 
 
 
269 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.531271 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4186  redoxin domain-containing protein  38.53 
 
 
269 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.855693  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4837  redoxin  38.53 
 
 
269 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4210  redoxin domain-containing protein  39.44 
 
 
269 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5120  redoxin domain-containing protein  39.81 
 
 
269 aa  145  9e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.329832 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3262  redoxin domain-containing protein  39.09 
 
 
269 aa  144  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0170639  normal  0.755125 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4240  redoxin domain-containing protein  37.32 
 
 
332 aa  140  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0223129  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2397  Redoxin domain protein  32.59 
 
 
267 aa  137  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.675955  normal  0.672629 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2761  thiol:disulfide interchange protein  37.56 
 
 
278 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.376077  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2433  redoxin domain-containing protein  33.82 
 
 
277 aa  132  5e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.983249 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32600  thiol:disulfide interchange protein  37.07 
 
 
278 aa  132  6e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.251961  normal  0.0539892 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3733  redoxin domain-containing protein  34.44 
 
 
262 aa  129  6e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.919007  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1412  Redoxin domain protein  36.07 
 
 
263 aa  126  3e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2788  putative thiol:disulfide interchange protein  45.65 
 
 
195 aa  122  6e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.982955 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3246  redoxin domain-containing protein  32.62 
 
 
266 aa  105  9e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.575298  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1468  Redoxin domain-containing protein  33.58 
 
 
164 aa  98.6  9e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0261888  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2015  Redoxin domain protein  35.82 
 
 
169 aa  98.2  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.878112  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2883  Redoxin domain-containing protein  28.21 
 
 
270 aa  85.9  6e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1730  Redoxin domain-containing protein  29.76 
 
 
200 aa  84  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.686612  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0325  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.55 
 
 
189 aa  82.8  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0365546 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6120  redoxin domain-containing protein  36.69 
 
 
209 aa  82  0.000000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.16555  normal  0.593362 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2634  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.26 
 
 
272 aa  80.1  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.52704  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1492  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.93 
 
 
193 aa  77.8  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1872  heat shock protein DnaJ-like  34.38 
 
 
180 aa  77  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.506662  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0861  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.09 
 
 
189 aa  76.6  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.155376  hitchhiker  0.00638708 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0272  thioredoxin family protein  35.16 
 
 
182 aa  74.7  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.900103 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8082  Redoxin domain protein  29.58 
 
 
180 aa  73.2  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04554  thioredoxin  30.15 
 
 
200 aa  73.2  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.64 
 
 
166 aa  72.8  0.000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000277693  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1396  thiol-disulfide oxidoreductase  24.26 
 
 
173 aa  72  0.000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00935  Thiol-disulfide isomerase/thioredoxin-like protein  33.33 
 
 
189 aa  70.9  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.263507  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3720  ahpC/TSA family protein  27.46 
 
 
191 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3405  ahpC/TSA family protein  28.17 
 
 
191 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3367  AhpC/TSA family protein  28.17 
 
 
191 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0144546  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3317  AhpC/TSA family protein  28.17 
 
 
191 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3674  ahpC/TSA family protein  28.17 
 
 
191 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.309572  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3623  ahpC/TSA family protein  28.17 
 
 
191 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000131744 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4480  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.29 
 
 
194 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18200  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.53 
 
 
178 aa  69.7  0.00000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000397372  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3632  ahpC/TSA family protein  28.17 
 
 
191 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0183092  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1566  thiol-disulfide oxidoreductase  23.67 
 
 
173 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.62392e-19 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4515  Redoxin domain protein  31.47 
 
 
182 aa  69.3  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.706217  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3298  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.46 
 
 
191 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.61408  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1383  thiol-disulfide oxidoreductase  23.67 
 
 
173 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1494  thiol-disulfide oxidoreductase  23.67 
 
 
173 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2330  redoxin domain-containing protein  28.57 
 
 
182 aa  69.3  0.00000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0220843  normal  0.114358 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3817  thiol-disulfide oxidoreductase  26.43 
 
 
173 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000518727 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0476  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.23 
 
 
177 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1528  thiol-disulfide oxidoreductase  26.43 
 
 
173 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0717  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.47 
 
 
191 aa  67.4  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.17044  normal  0.602428 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3638  ahpC/TSA family protein  27.46 
 
 
191 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00315479  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2724  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.81 
 
 
188 aa  67.4  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.32328  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0398  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  33.6 
 
 
223 aa  68.2  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0641884  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2283  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.45 
 
 
199 aa  67.8  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000858823  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1829  peroxiredoxin-like  33.58 
 
 
167 aa  67.4  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000091081  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0470  putative thiol:disulfide interchange protein  27.23 
 
 
266 aa  67  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.776778  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0237  redoxin domain-containing protein  31.5 
 
 
193 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000132187  unclonable  0.000000000045327 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3880  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.06 
 
 
194 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1248  redoxin  27.66 
 
 
192 aa  66.6  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.525672 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1408  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  30.53 
 
 
185 aa  66.2  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1895  redoxin domain-containing protein  30.41 
 
 
189 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.132277 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0344  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.82 
 
 
183 aa  65.9  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00014833  hitchhiker  0.000312976 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0399  thiol-disulfide oxidoreductase  28.99 
 
 
174 aa  65.9  0.0000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0269  thioredoxin, putative  31.5 
 
 
194 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1197  thiol-disulfide oxidoreductase  24.29 
 
 
173 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4005  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.06 
 
 
194 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3412  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.59 
 
 
169 aa  65.9  0.0000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0479  thioredoxin, putative  31.4 
 
 
196 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0237  redoxin domain-containing protein  31.5 
 
 
193 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000458104  hitchhiker  0.00000000877704 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0232  redoxin domain-containing protein  31.5 
 
 
193 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000057561  normal  0.0469952 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0841  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.73 
 
 
174 aa  65.5  0.0000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0185  redoxin domain-containing protein  36.21 
 
 
179 aa  65.9  0.0000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000121029  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1954  thioredoxin  32.5 
 
 
184 aa  65.5  0.0000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1596  ahpC/TSA family protein  26.76 
 
 
191 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.613915  hitchhiker  0.000293615 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0510  putative secreted protein  30.66 
 
 
209 aa  64.7  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.113668  normal  0.171566 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1180  RecJ exonuclease  24.78 
 
 
160 aa  65.1  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0271144 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0181  alkyl hydroperoxide reductase  26.23 
 
 
183 aa  64.7  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0243778  normal  0.461108 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0240  Redoxin domain protein  27.34 
 
 
188 aa  65.1  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3658  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  29.69 
 
 
196 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289419  hitchhiker  0.00526428 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1355  thiol-disulfide oxidoreductase  22.49 
 
 
173 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1049  thioredoxin  31.39 
 
 
167 aa  64.7  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>