More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_3880 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_3880  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  100 
 
 
194 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4005  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  94.33 
 
 
194 aa  387  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3367  redoxin domain-containing protein  79.9 
 
 
194 aa  330  1e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3545  redoxin domain-containing protein  78.87 
 
 
194 aa  324  6e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.65179  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0485  redoxin domain-containing protein  78.87 
 
 
194 aa  323  8.000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0486  redoxin domain-containing protein  78.87 
 
 
194 aa  323  1e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0476  thioredoxin, putative  82.18 
 
 
194 aa  310  5.999999999999999e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0479  thioredoxin, putative  56.15 
 
 
196 aa  240  1e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0476  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  58.05 
 
 
177 aa  229  2e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4480  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  57.47 
 
 
194 aa  229  2e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0345  redoxin domain-containing protein  51.2 
 
 
211 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4653  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  40.74 
 
 
191 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000929627  normal  0.021972 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0237  redoxin domain-containing protein  40 
 
 
193 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000458104  hitchhiker  0.00000000877704 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0232  redoxin domain-containing protein  40 
 
 
193 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000057561  normal  0.0469952 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0237  redoxin domain-containing protein  40 
 
 
193 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000132187  unclonable  0.000000000045327 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0269  thioredoxin, putative  40 
 
 
194 aa  131  7.999999999999999e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0251  thioredoxin, putative  41.96 
 
 
193 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000212412  normal  0.0823497 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3721  redoxin domain-containing protein  39.55 
 
 
195 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000547051  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0185  redoxin domain-containing protein  40.15 
 
 
179 aa  125  3e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000121029  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4281  redoxin domain-containing protein  38.52 
 
 
192 aa  125  5e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000444464  normal  0.0383421 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0196  redoxin domain-containing protein  37.68 
 
 
195 aa  125  5e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000417571  normal  0.0470366 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0234  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.04 
 
 
195 aa  121  5e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000676147  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0237  redoxin domain-containing protein  37.04 
 
 
195 aa  121  5e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000304189  normal  0.555945 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0234  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.04 
 
 
195 aa  121  5e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000290768  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4018  Redoxin domain protein  37.04 
 
 
195 aa  121  8e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000656655  hitchhiker  0.00619092 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0221  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.59 
 
 
198 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000103908  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0746  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.11 
 
 
200 aa  100  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.204935  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3412  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.66 
 
 
169 aa  96.3  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3474  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.97 
 
 
169 aa  95.1  6e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.163841 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2865  redoxin domain-containing protein  36.72 
 
 
170 aa  91.7  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.220691  normal  0.154484 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1401  redoxin domain-containing protein  27.51 
 
 
191 aa  90.5  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.774278  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1239  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  30.34 
 
 
422 aa  90.5  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.502856  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2023  redoxin domain-containing protein  35.71 
 
 
161 aa  90.1  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2370  redoxin domain-containing protein  27.98 
 
 
195 aa  89.7  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.36236 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1895  redoxin domain-containing protein  32 
 
 
189 aa  89.4  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.132277 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3560  redoxin domain-containing protein  33.88 
 
 
278 aa  88.6  6e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4876  thioredoxin-like  30.5 
 
 
224 aa  88.2  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.608782  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0398  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  35.2 
 
 
223 aa  87.8  8e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0641884  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2678  thioredoxin family protein  32.87 
 
 
183 aa  87.8  9e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1768  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.54 
 
 
446 aa  86.7  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.197214  normal  0.508736 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1603  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.22 
 
 
203 aa  86.7  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.673195  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0716  thioredoxin-like protein  30.39 
 
 
223 aa  85.9  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.620578 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2276  Redoxin domain protein  34.56 
 
 
171 aa  86.3  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3382  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.61 
 
 
202 aa  85.9  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.305938 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1234  redoxin domain-containing protein  27.86 
 
 
167 aa  85.1  5e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2006  redoxin domain-containing protein  33.57 
 
 
176 aa  85.5  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0112011  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1851  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.97 
 
 
409 aa  85.1  6e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3774  thiol-disulfide isomerase-like protein  31.15 
 
 
173 aa  84.7  7e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.166782  normal  0.0186728 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0547  peroxiredoxin-like protein  31.3 
 
 
168 aa  84  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4236  redoxin domain protein  33.06 
 
 
278 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3951  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  28.57 
 
 
188 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.337329 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0272  thioredoxin family protein  29.93 
 
 
182 aa  83.6  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.900103 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5226  Redoxin domain protein  30.3 
 
 
228 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.387928  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3478  thioredoxin-like protein  31.11 
 
 
223 aa  83.2  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1628  redoxin domain-containing protein  33.06 
 
 
278 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0881722  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3488  Redoxin domain protein  35.88 
 
 
216 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.207064 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4503  redoxin domain-containing protein  32.12 
 
 
213 aa  82.4  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4643  putative thiol--disulfide interchange redox-active center transmembrane protein  27.98 
 
 
193 aa  82.8  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3802  redoxin domain-containing protein  33.06 
 
 
278 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1737  redoxin domain-containing protein  29.17 
 
 
210 aa  82  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.958182  normal  0.712311 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1441  Redoxin domain protein  35.45 
 
 
158 aa  82  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0053  anti-oxidant AhpCTSA family protein  32.61 
 
 
232 aa  81.6  0.000000000000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5421  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.58 
 
 
194 aa  81.6  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.305949 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3733  redoxin  29.14 
 
 
187 aa  81.3  0.000000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.78163 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4016  thiol:disulfide interchange protein  33.33 
 
 
220 aa  81.3  0.000000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0496  thiol:disulfide interchange protein, putative  28.67 
 
 
184 aa  81.3  0.000000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3611  Redoxin domain protein  35.54 
 
 
213 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.338922  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1954  thioredoxin  29.1 
 
 
184 aa  80.9  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11808  thioredoxin, putative  30.6 
 
 
211 aa  80.9  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3738  redoxin domain-containing protein  33.06 
 
 
268 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3210  redoxin domain-containing protein  31.72 
 
 
209 aa  80.5  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.541056 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3739  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.37 
 
 
170 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0260987  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3288  redoxin domain-containing protein  35.54 
 
 
213 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0935  thioredoxin-like  27.46 
 
 
222 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3292  Redoxin domain protein  36.19 
 
 
453 aa  79.7  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000783621  hitchhiker  0.000211392 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1321  thioredoxin family protein  33.58 
 
 
168 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6578  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.34 
 
 
185 aa  79.3  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.861573 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0087  thiol-disulfide isomerase-like protein  27.41 
 
 
170 aa  79.3  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.653321  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2535  redoxin domain-containing protein  34.56 
 
 
224 aa  79.3  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.772759 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3857  Redoxin domain protein  33.33 
 
 
220 aa  79  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0709217 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0826  thioredoxin-like protein  28.87 
 
 
222 aa  79  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1680  thioredoxin family protein  28.95 
 
 
173 aa  78.6  0.00000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0732573  normal  0.832163 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3826  redoxin domain-containing protein  32.81 
 
 
279 aa  79  0.00000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2046  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  30.77 
 
 
437 aa  78.6  0.00000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0189188  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1144  Thiol disulfide interchange protein tlpA (cytochrome c biogenesis protein tlpA)  27.46 
 
 
229 aa  78.2  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.243856  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5746  redoxin domain-containing protein  33.33 
 
 
188 aa  77.8  0.00000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.487229  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2118  thioredoxin  41.12 
 
 
164 aa  78.2  0.00000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1435  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.63 
 
 
168 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0354049 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1124  redoxin domain-containing protein  30.7 
 
 
181 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.65139  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4210  redoxin domain-containing protein  40.86 
 
 
269 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2452  thioredoxin family protein  30.66 
 
 
170 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000374764  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5989  redoxin domain-containing protein  30.08 
 
 
217 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.870389  normal  0.126817 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2212  thioredoxin-like  32.03 
 
 
133 aa  77  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.249121  normal  0.498719 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2015  Redoxin domain protein  31.85 
 
 
169 aa  77  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.878112  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1818  redoxin domain-containing protein  28 
 
 
165 aa  76.6  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.165387  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3937  thiol:disulfide interchange protein DsbE, putative  32.23 
 
 
290 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.144233  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1980  thiol:disulfide interchange protein, putative  31.58 
 
 
238 aa  75.5  0.0000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3564  Redoxin domain protein  32.65 
 
 
220 aa  75.5  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.365622 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1383  thioredoxin family protein  27.17 
 
 
168 aa  75.9  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.12426  normal  0.0879111 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2444  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.7 
 
 
183 aa  75.5  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.312621  normal  0.571857 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>