More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8082 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_8082  Redoxin domain protein  100 
 
 
180 aa  370  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5203  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  67.4 
 
 
201 aa  255  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0572  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  40.22 
 
 
189 aa  134  8e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220825  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2202  redoxin domain-containing protein  38.01 
 
 
194 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2704  hypothetical protein  37.75 
 
 
205 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.396222  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4563  redoxin domain-containing protein  41.94 
 
 
237 aa  117  7.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5008  Redoxin domain protein  31.58 
 
 
248 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.437471  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24260  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  36.2 
 
 
196 aa  112  4.0000000000000004e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0670449  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0251  redoxin domain-containing protein  38.24 
 
 
213 aa  111  4.0000000000000004e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0269  Redoxin domain-containing protein  37.75 
 
 
188 aa  111  6e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.352663  normal  0.890492 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4431  Redoxin domain protein  36.59 
 
 
193 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3091  Redoxin domain protein  33.94 
 
 
203 aa  109  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6120  redoxin domain-containing protein  40 
 
 
209 aa  107  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.16555  normal  0.593362 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3292  redoxin domain-containing protein  37.5 
 
 
200 aa  107  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24350  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  39.16 
 
 
203 aa  105  3e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2869  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  39.17 
 
 
200 aa  105  5e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3240  redoxin domain-containing protein  37.33 
 
 
198 aa  104  7e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0628  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.05 
 
 
206 aa  103  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.603467  hitchhiker  0.00557817 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5746  redoxin domain-containing protein  38.84 
 
 
188 aa  102  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.487229  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0926  Redoxin domain protein  37.8 
 
 
199 aa  101  6e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0510  putative secreted protein  39.29 
 
 
209 aa  99.4  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.113668  normal  0.171566 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2734  Redoxin domain protein  33.1 
 
 
204 aa  96.7  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0627049  normal  0.0544448 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4573  Redoxin domain protein  34.51 
 
 
191 aa  96.3  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6717  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  38.97 
 
 
195 aa  95.5  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10537  thioredoxin  36.03 
 
 
216 aa  94.4  7e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.154005  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0521  Redoxin domain protein  34.42 
 
 
206 aa  94.4  8e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000754545  hitchhiker  0.00309639 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4518  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.93 
 
 
191 aa  93.6  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000658769 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4473  redoxin domain-containing protein  32.34 
 
 
203 aa  93.6  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4304  redoxin domain-containing protein  32.34 
 
 
203 aa  93.6  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.213617  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4204  redoxin domain-containing protein  32.34 
 
 
203 aa  93.6  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4098  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.36 
 
 
191 aa  93.6  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.311906 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0689  Redoxin domain protein  35.66 
 
 
188 aa  93.2  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0960762  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17970  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  36.43 
 
 
203 aa  92.8  2e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0240  Redoxin domain protein  33.33 
 
 
188 aa  92.4  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1355  thiol-disulfide oxidoreductase  29.41 
 
 
173 aa  92  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0827  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.12 
 
 
179 aa  91.7  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4484  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.33 
 
 
195 aa  91.7  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.810998 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3254  Redoxin domain protein  32.03 
 
 
198 aa  90.9  8e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0648017  normal  0.303521 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0444  Redoxin domain protein  31.72 
 
 
176 aa  90.1  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.567513  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1598  thiol-disulfide oxidoreductase  33.05 
 
 
173 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.966744  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3943  Redoxin domain protein  36.44 
 
 
447 aa  89.7  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1356  thiol-disulfide oxidoreductase  33.05 
 
 
173 aa  89.4  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0501  redoxin domain-containing protein  36.89 
 
 
200 aa  89  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0685  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.46 
 
 
203 aa  89  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2682  thioredoxin  36.43 
 
 
183 aa  88.6  4e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0692  redoxin  35.46 
 
 
203 aa  89  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.988682  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1959  redoxin domain-containing protein  35.82 
 
 
189 aa  88.6  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0329542  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0705  redoxin domain-containing protein  35.46 
 
 
203 aa  89  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.106229 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2812  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.06 
 
 
240 aa  88.6  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1197  thiol-disulfide oxidoreductase  29.2 
 
 
173 aa  87.4  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1634  thiol-disulfide oxidoreductase  30.41 
 
 
173 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0052  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.03 
 
 
200 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.148538 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1566  thiol-disulfide oxidoreductase  31.09 
 
 
173 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.62392e-19 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5347  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.23 
 
 
223 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3817  thiol-disulfide oxidoreductase  26.79 
 
 
173 aa  86.3  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000518727 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5664  redoxin domain-containing protein  32.23 
 
 
223 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3710  redoxin domain-containing protein  32.23 
 
 
218 aa  86.3  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1383  thiol-disulfide oxidoreductase  29.27 
 
 
173 aa  85.9  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1396  thiol-disulfide oxidoreductase  29.27 
 
 
173 aa  85.9  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1494  thiol-disulfide oxidoreductase  29.27 
 
 
173 aa  85.9  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0212  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.15 
 
 
175 aa  85.9  3e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1528  thiol-disulfide oxidoreductase  28.1 
 
 
173 aa  85.9  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0243  redoxin domain-containing protein  35.56 
 
 
184 aa  85.9  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.487537  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0866  redoxin domain-containing protein  32.79 
 
 
200 aa  85.5  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.141982  normal  0.0297264 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2724  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.24 
 
 
188 aa  84.7  6e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.32328  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5382  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.4 
 
 
240 aa  84  9e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0022  thiol:disulfide interchange protein, thioredoxin family protein  32.48 
 
 
175 aa  84.3  9e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.117242 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2095  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.61 
 
 
288 aa  83.6  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.411423  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2789  thiol:disulfide interchange protein  34.93 
 
 
269 aa  83.2  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0861  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.66 
 
 
189 aa  83.2  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.155376  hitchhiker  0.00638708 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1221  peroxiredoxin-like protein  30.83 
 
 
173 aa  82.8  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07200  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  31.17 
 
 
181 aa  82.8  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.246784 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1561  thioredoxin  32.56 
 
 
164 aa  81.6  0.000000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00616006  normal  0.258468 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4444  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.17 
 
 
196 aa  81.6  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.133035 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4433  redoxin domain-containing protein  31.62 
 
 
208 aa  81.3  0.000000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.390962  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2397  Redoxin domain protein  32.06 
 
 
267 aa  81.3  0.000000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.675955  normal  0.672629 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1890  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.03 
 
 
171 aa  81.3  0.000000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.326681  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3285  putative thioredoxin family protein  34.38 
 
 
186 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2499  thioredoxin family protein, putative  34.38 
 
 
186 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.129809  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3498  thioredoxin  34.38 
 
 
202 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0420  putative thioredoxin family protein  34.38 
 
 
186 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0533  redoxin domain-containing protein  32.31 
 
 
183 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.917814  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3942  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  41.03 
 
 
455 aa  80.1  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1279  putative thioredoxin family protein  34.38 
 
 
186 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0509  redoxin domain-containing protein  33.08 
 
 
184 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1036  Redoxin domain protein  32.89 
 
 
196 aa  80.9  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3424  Redoxin domain protein  33.85 
 
 
183 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0519333  normal  0.0539833 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3501  thioredoxin family protein  34.38 
 
 
186 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.511578  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1857  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.28 
 
 
280 aa  80.1  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1445  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.43 
 
 
182 aa  79.3  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1165  thioredoxin family protein, putative  32.81 
 
 
202 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3463  thioredoxin family protein  34.38 
 
 
186 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3062  thioredoxin-like protein  34.15 
 
 
180 aa  79.7  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1818  redoxin domain-containing protein  26.45 
 
 
165 aa  79.3  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.165387  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.22 
 
 
187 aa  79.3  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2276  Redoxin domain protein  32.62 
 
 
171 aa  79  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0760  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.08 
 
 
228 aa  79  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.173874 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2203  redoxin domain-containing protein  35.48 
 
 
203 aa  79.3  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0576  redoxin domain-containing protein  31.82 
 
 
183 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000460325 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0124  redoxin  31.82 
 
 
182 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.909527  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>