More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3062 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007973  Rmet_3062  thioredoxin-like protein  100 
 
 
180 aa  367  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2863  putative thioredoxin-related transmembrane protein  76.88 
 
 
182 aa  262  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2784  putative thioredoxin-related transmembrane protein  57.89 
 
 
174 aa  208  3e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.744775 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3028  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  56.73 
 
 
174 aa  204  4e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2618  Redoxin domain protein  55.56 
 
 
174 aa  201  5e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.548372 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0212  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  46.63 
 
 
175 aa  169  2e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2627  redoxin domain-containing protein  53.02 
 
 
182 aa  167  5e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1165  thioredoxin family protein, putative  54.48 
 
 
202 aa  164  4e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0233  Redoxin domain protein  42.35 
 
 
178 aa  163  1.0000000000000001e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.972798  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1279  putative thioredoxin family protein  55.22 
 
 
186 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0420  putative thioredoxin family protein  55.22 
 
 
186 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2499  thioredoxin family protein, putative  55.22 
 
 
186 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.129809  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3498  thioredoxin  55.22 
 
 
202 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3285  putative thioredoxin family protein  55.22 
 
 
186 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3463  thioredoxin family protein  55.22 
 
 
186 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3501  thioredoxin family protein  55.22 
 
 
186 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.511578  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3424  Redoxin domain protein  46.75 
 
 
183 aa  155  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0519333  normal  0.0539833 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0534  putative thioredoxin  46.75 
 
 
180 aa  154  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.677226 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3690  Thiol-disulfide isomerase/thioredoxin-like  47.59 
 
 
183 aa  153  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.405129 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0533  redoxin domain-containing protein  48.28 
 
 
183 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.917814  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0509  redoxin domain-containing protein  48.28 
 
 
184 aa  153  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0124  redoxin  46.9 
 
 
182 aa  151  5e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.909527  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0607  redoxin domain-containing protein  46.9 
 
 
182 aa  151  5e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0576  redoxin domain-containing protein  48.51 
 
 
183 aa  150  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000460325 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2777  redoxin domain-containing protein  50 
 
 
182 aa  149  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.769829  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0856  redoxin domain-containing protein  45.97 
 
 
195 aa  135  4e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0694544 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2950  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  39.58 
 
 
195 aa  134  6.0000000000000005e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3640  redoxin domain-containing protein  39.58 
 
 
195 aa  134  7.000000000000001e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.851507  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3984  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  45.74 
 
 
195 aa  134  7.000000000000001e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000964008 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0184  thioredoxin family protein, putative  42.6 
 
 
171 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.148169 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3393  redoxin domain-containing protein  42.75 
 
 
172 aa  127  8.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.661206  normal  0.45952 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0948  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  45.38 
 
 
182 aa  125  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3354  putative thioredoxin-related transmembrane protein  39.72 
 
 
188 aa  124  5e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.24257  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1493  redoxin domain-containing protein  38.03 
 
 
190 aa  123  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3204  thioredoxin family protein, putative  38.52 
 
 
180 aa  122  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00906791 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1488  redoxin domain-containing protein  39.58 
 
 
189 aa  119  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1098  thioredoxin family protein, putative  39.1 
 
 
184 aa  119  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00211486  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2682  thioredoxin  33.15 
 
 
183 aa  115  3e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0027  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  45.08 
 
 
185 aa  107  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1561  thioredoxin  42.75 
 
 
164 aa  102  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00616006  normal  0.258468 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0676  Redoxin domain protein  35.97 
 
 
165 aa  98.6  4e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3631  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.93 
 
 
187 aa  97.4  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.540722  normal  0.6253 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1042  thiol:disulfide interchange protein like protein  38.4 
 
 
135 aa  97.4  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0023  redoxin domain-containing protein  34.13 
 
 
167 aa  96.7  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.239793  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1054  thioredoxin  28.74 
 
 
173 aa  94.7  6e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000221964  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0371  thioredoxin  30.58 
 
 
187 aa  94.4  8e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04554  thioredoxin  39.13 
 
 
200 aa  90.5  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0284  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.75 
 
 
188 aa  87.8  8e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.503124  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0717  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.8 
 
 
191 aa  86.3  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.17044  normal  0.602428 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0866  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  38.21 
 
 
183 aa  85.9  3e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1547  redoxin domain-containing protein  42.2 
 
 
155 aa  84  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0375508  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0984  thioredoxin  36.59 
 
 
147 aa  82  0.000000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0496  redoxin domain-containing protein  32.31 
 
 
166 aa  81.3  0.000000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.520975  normal  0.448467 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2095  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.11 
 
 
288 aa  80.9  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.411423  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_004310  BR1980  thiol:disulfide interchange protein, putative  37.5 
 
 
238 aa  80.1  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2118  thioredoxin  32.82 
 
 
164 aa  79.7  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5203  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.68 
 
 
201 aa  80.1  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1905  putative thiol:disulfide interchange protein  37.5 
 
 
238 aa  80.1  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8082  Redoxin domain protein  34.15 
 
 
180 aa  79.3  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.25 
 
 
166 aa  78.6  0.00000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000277693  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3474  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.5 
 
 
169 aa  77.4  0.00000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.163841 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1000  redoxin domain-containing protein  36.67 
 
 
238 aa  77.8  0.00000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3551  thiol:disulfide interchange protein DsbE, putative  35.29 
 
 
173 aa  77.4  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.571735 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1234  redoxin domain-containing protein  32.14 
 
 
167 aa  77  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2013  thiol:disulfide interchange protein, thioredoxin family protein  33.33 
 
 
176 aa  76.3  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4448  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.77 
 
 
382 aa  76.3  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.510113  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1405  putative thioredoxin related protein  34.97 
 
 
168 aa  76.6  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0925231  normal  0.436959 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1598  thiol-disulfide oxidoreductase  27.27 
 
 
173 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.966744  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3412  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.67 
 
 
169 aa  75.9  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1356  thiol-disulfide oxidoreductase  29.6 
 
 
173 aa  75.5  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3536  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.91 
 
 
186 aa  75.5  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1981  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.82 
 
 
171 aa  75.5  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0214492  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0274  cytochrome c biogenesis protein, putative  36.84 
 
 
194 aa  75.1  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0525  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  23.73 
 
 
178 aa  74.7  0.0000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000136072  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0190  cytochrome c biogenesis protein, putative  36.84 
 
 
201 aa  74.7  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.648376  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1355  thiol-disulfide oxidoreductase  26.99 
 
 
173 aa  74.7  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0547  peroxiredoxin-like protein  33.04 
 
 
168 aa  74.7  0.0000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0340  hypothetical protein  36.44 
 
 
192 aa  74.7  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1221  peroxiredoxin-like protein  33.33 
 
 
173 aa  74.7  0.0000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1049  thioredoxin  35 
 
 
167 aa  74.3  0.0000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0628  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.25 
 
 
206 aa  73.6  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.603467  hitchhiker  0.00557817 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0181  alkyl hydroperoxide reductase  32.54 
 
 
183 aa  73.6  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0243778  normal  0.461108 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0403  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.63 
 
 
174 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6120  redoxin domain-containing protein  38.52 
 
 
209 aa  73.6  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.16555  normal  0.593362 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3942  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.07 
 
 
455 aa  72.8  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1818  redoxin domain-containing protein  32.14 
 
 
165 aa  73.2  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.165387  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0451  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  32.54 
 
 
180 aa  73.2  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0228  redoxin domain-containing protein  29.67 
 
 
174 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.454071  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1223  Redoxin domain protein  38.67 
 
 
170 aa  72.8  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.337108  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0061  Redoxin domain protein  34.13 
 
 
197 aa  72.4  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0760  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.25 
 
 
228 aa  72.4  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.173874 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3455  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.82 
 
 
168 aa  72.4  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.61185  normal  0.0436894 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1603  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.8 
 
 
203 aa  72.4  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.673195  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1634  thiol-disulfide oxidoreductase  28.8 
 
 
173 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1383  thiol-disulfide oxidoreductase  26.38 
 
 
173 aa  72  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0738  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.33 
 
 
170 aa  72  0.000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.296036  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1223  hypothetical protein  31.19 
 
 
172 aa  72.4  0.000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1494  thiol-disulfide oxidoreductase  26.38 
 
 
173 aa  72  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1566  thiol-disulfide oxidoreductase  26.38 
 
 
173 aa  72  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.62392e-19 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.96 
 
 
187 aa  72  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>