More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1098 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_1098  thioredoxin family protein, putative  100 
 
 
184 aa  371  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00211486  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3393  redoxin domain-containing protein  70.22 
 
 
172 aa  234  7e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.661206  normal  0.45952 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0856  redoxin domain-containing protein  52.47 
 
 
195 aa  180  8.000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0694544 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0948  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  51.38 
 
 
182 aa  174  6e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3354  putative thioredoxin-related transmembrane protein  53.55 
 
 
188 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.24257  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2950  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  51.59 
 
 
195 aa  171  5.999999999999999e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3640  redoxin domain-containing protein  51.59 
 
 
195 aa  171  5.999999999999999e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.851507  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1488  redoxin domain-containing protein  58.21 
 
 
189 aa  167  6e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3204  thioredoxin family protein, putative  55.07 
 
 
180 aa  162  3e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00906791 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3984  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  44.85 
 
 
195 aa  162  4.0000000000000004e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000964008 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1493  redoxin domain-containing protein  48.89 
 
 
190 aa  151  5e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0212  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  38.33 
 
 
175 aa  132  3.9999999999999996e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0233  Redoxin domain protein  37.64 
 
 
178 aa  129  3e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.972798  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3424  Redoxin domain protein  37.43 
 
 
183 aa  121  6e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0519333  normal  0.0539833 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2627  redoxin domain-containing protein  40.31 
 
 
182 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2784  putative thioredoxin-related transmembrane protein  35.59 
 
 
174 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.744775 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2618  Redoxin domain protein  35.16 
 
 
174 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.548372 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3062  thioredoxin-like protein  38.81 
 
 
180 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0534  putative thioredoxin  38.42 
 
 
180 aa  117  7e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.677226 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2863  putative thioredoxin-related transmembrane protein  35.07 
 
 
182 aa  117  7.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3028  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.07 
 
 
174 aa  117  7.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0420  putative thioredoxin family protein  38.17 
 
 
186 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2499  thioredoxin family protein, putative  38.17 
 
 
186 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.129809  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3285  putative thioredoxin family protein  38.17 
 
 
186 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1279  putative thioredoxin family protein  38.17 
 
 
186 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3498  thioredoxin  38.17 
 
 
202 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3690  Thiol-disulfide isomerase/thioredoxin-like  38.93 
 
 
183 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.405129 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3463  thioredoxin family protein  38.17 
 
 
186 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3501  thioredoxin family protein  38.17 
 
 
186 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.511578  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1165  thioredoxin family protein, putative  37.4 
 
 
202 aa  115  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0533  redoxin domain-containing protein  37.98 
 
 
183 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.917814  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0124  redoxin  35.9 
 
 
182 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.909527  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0607  redoxin domain-containing protein  35.9 
 
 
182 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0509  redoxin domain-containing protein  38.76 
 
 
184 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0576  redoxin domain-containing protein  35.26 
 
 
183 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000460325 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2777  redoxin domain-containing protein  38.17 
 
 
182 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.769829  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2682  thioredoxin  33.71 
 
 
183 aa  108  6e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0184  thioredoxin family protein, putative  35.82 
 
 
171 aa  100  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.148169 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3631  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  41.38 
 
 
187 aa  99  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.540722  normal  0.6253 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0676  Redoxin domain protein  38.79 
 
 
165 aa  93.6  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0023  redoxin domain-containing protein  38.61 
 
 
167 aa  90.1  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.239793  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0371  thioredoxin  30.87 
 
 
187 aa  89.4  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0284  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.83 
 
 
188 aa  87.8  7e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.503124  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2431  putative thioredoxin  37.5 
 
 
164 aa  85.9  3e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1042  thiol:disulfide interchange protein like protein  37.07 
 
 
135 aa  84.7  8e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1906  hypothetical protein  33.8 
 
 
153 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.203094 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3927  thioredoxin-like  31.25 
 
 
174 aa  80.9  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298512  normal  0.186192 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1054  thioredoxin  29.09 
 
 
173 aa  79.7  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000221964  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0027  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.5 
 
 
185 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0451  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  34.35 
 
 
180 aa  77.8  0.00000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1561  thioredoxin  34.26 
 
 
164 aa  77  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00616006  normal  0.258468 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1396  thiol-disulfide oxidoreductase  30.08 
 
 
173 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1598  thiol-disulfide oxidoreductase  30.08 
 
 
173 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.966744  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1356  thiol-disulfide oxidoreductase  30.08 
 
 
173 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0243  redoxin domain-containing protein  29.73 
 
 
184 aa  75.9  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.487537  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1223  Redoxin domain protein  33.81 
 
 
170 aa  75.5  0.0000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.337108  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1533  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.53 
 
 
193 aa  75.5  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1634  thiol-disulfide oxidoreductase  29.75 
 
 
173 aa  74.7  0.0000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32600  thiol:disulfide interchange protein  34.62 
 
 
278 aa  74.7  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.251961  normal  0.0539892 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2412  Redoxin domain protein  28.16 
 
 
167 aa  74.3  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1355  thiol-disulfide oxidoreductase  30.65 
 
 
173 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.07 
 
 
166 aa  73.6  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000277693  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2761  thiol:disulfide interchange protein  33.85 
 
 
278 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.376077  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3551  thiol:disulfide interchange protein DsbE, putative  32.03 
 
 
173 aa  73.2  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.571735 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3250  hypothetical protein  29.86 
 
 
165 aa  72.4  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.131239  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4046  redoxin domain-containing protein  31.11 
 
 
166 aa  72.4  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000205313 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3817  thiol-disulfide oxidoreductase  29.27 
 
 
173 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000518727 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1818  redoxin domain-containing protein  31.62 
 
 
165 aa  72.8  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.165387  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1890  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.31 
 
 
171 aa  72  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.326681  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5203  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.68 
 
 
201 aa  72.4  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0525  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.47 
 
 
178 aa  72  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000136072  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1445  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.21 
 
 
182 aa  71.6  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0475  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.71 
 
 
173 aa  72  0.000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0228  redoxin domain-containing protein  33.86 
 
 
174 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.454071  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3942  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.46 
 
 
455 aa  71.6  0.000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2903  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.93 
 
 
184 aa  70.9  0.000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1197  thiol-disulfide oxidoreductase  27.78 
 
 
173 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1383  thiol-disulfide oxidoreductase  29.27 
 
 
173 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0061  Redoxin domain protein  29.45 
 
 
197 aa  70.9  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1494  thiol-disulfide oxidoreductase  29.27 
 
 
173 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1566  thiol-disulfide oxidoreductase  29.27 
 
 
173 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.62392e-19 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1528  thiol-disulfide oxidoreductase  29.27 
 
 
173 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6120  redoxin domain-containing protein  32.82 
 
 
209 aa  70.5  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.16555  normal  0.593362 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2023  redoxin domain-containing protein  33.61 
 
 
161 aa  70.1  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0345  redoxin domain-containing protein  40 
 
 
211 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0233  thioredoxin-like protein  34.45 
 
 
179 aa  70.1  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4444  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.93 
 
 
196 aa  69.3  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.133035 
 
 
-
 
NC_004310  BR1980  thiol:disulfide interchange protein, putative  31.3 
 
 
238 aa  69.3  0.00000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18200  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.78 
 
 
178 aa  69.7  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000397372  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1905  putative thiol:disulfide interchange protein  31.3 
 
 
238 aa  69.3  0.00000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4194  putative thiol-disulfide isomerase and thioredoxins  33.07 
 
 
176 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.462178 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1405  putative thioredoxin related protein  41.03 
 
 
168 aa  69.3  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0925231  normal  0.436959 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3412  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.3 
 
 
169 aa  68.6  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0240  Redoxin domain protein  30.89 
 
 
188 aa  68.9  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3474  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.3 
 
 
169 aa  68.6  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.163841 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2921  Thiol-disulfide isomerase/thioredoxin-like  35.43 
 
 
269 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.253355  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3560  redoxin domain-containing protein  32.77 
 
 
278 aa  68.2  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1000  redoxin domain-containing protein  31.3 
 
 
238 aa  68.2  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0264  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.17 
 
 
375 aa  68.2  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2114  thioredoxin family protein  35.45 
 
 
159 aa  68.2  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.14615  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>