More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0233 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010531  Pnec_0233  Redoxin domain protein  100 
 
 
178 aa  363  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.972798  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0212  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  81.98 
 
 
175 aa  301  3.0000000000000004e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2863  putative thioredoxin-related transmembrane protein  44.9 
 
 
182 aa  155  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3062  thioredoxin-like protein  48.55 
 
 
180 aa  153  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2784  putative thioredoxin-related transmembrane protein  41.62 
 
 
174 aa  150  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.744775 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1279  putative thioredoxin family protein  50.36 
 
 
186 aa  149  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2499  thioredoxin family protein, putative  50.36 
 
 
186 aa  149  3e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.129809  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3285  putative thioredoxin family protein  50.36 
 
 
186 aa  149  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0420  putative thioredoxin family protein  50.36 
 
 
186 aa  149  3e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3501  thioredoxin family protein  50.36 
 
 
186 aa  148  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.511578  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3498  thioredoxin  50.36 
 
 
202 aa  148  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3463  thioredoxin family protein  50.36 
 
 
186 aa  148  4e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1165  thioredoxin family protein, putative  49.64 
 
 
202 aa  147  6e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3028  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  41.04 
 
 
174 aa  144  8.000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2618  Redoxin domain protein  39.88 
 
 
174 aa  142  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.548372 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3424  Redoxin domain protein  38.8 
 
 
183 aa  141  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0519333  normal  0.0539833 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2627  redoxin domain-containing protein  46.38 
 
 
182 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0534  putative thioredoxin  39.11 
 
 
180 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.677226 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0533  redoxin domain-containing protein  46.72 
 
 
183 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.917814  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3690  Thiol-disulfide isomerase/thioredoxin-like  45.99 
 
 
183 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.405129 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0509  redoxin domain-containing protein  46.72 
 
 
184 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0607  redoxin domain-containing protein  46.72 
 
 
182 aa  137  7e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0124  redoxin  46.72 
 
 
182 aa  137  7e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.909527  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0576  redoxin domain-containing protein  45.26 
 
 
183 aa  136  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000460325 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2777  redoxin domain-containing protein  46.62 
 
 
182 aa  135  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.769829  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3204  thioredoxin family protein, putative  41.48 
 
 
180 aa  135  4e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00906791 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0184  thioredoxin family protein, putative  39.49 
 
 
171 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.148169 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0948  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  44.53 
 
 
182 aa  132  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3393  redoxin domain-containing protein  41.78 
 
 
172 aa  129  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.661206  normal  0.45952 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2682  thioredoxin  35.39 
 
 
183 aa  129  3e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3984  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  43.9 
 
 
195 aa  125  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000964008 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2950  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.81 
 
 
195 aa  125  3e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3640  redoxin domain-containing protein  36.81 
 
 
195 aa  125  3e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.851507  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0856  redoxin domain-containing protein  40.83 
 
 
195 aa  122  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0694544 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1098  thioredoxin family protein, putative  42.64 
 
 
184 aa  120  9e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00211486  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1488  redoxin domain-containing protein  34.03 
 
 
189 aa  120  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1493  redoxin domain-containing protein  32.64 
 
 
190 aa  116  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1054  thioredoxin  32.34 
 
 
173 aa  115  3e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000221964  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0371  thioredoxin  31.87 
 
 
187 aa  114  8.999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3354  putative thioredoxin-related transmembrane protein  39.83 
 
 
188 aa  112  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.24257  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0023  redoxin domain-containing protein  35.96 
 
 
167 aa  107  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.239793  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3631  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  39.82 
 
 
187 aa  106  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.540722  normal  0.6253 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0676  Redoxin domain protein  35.17 
 
 
165 aa  105  4e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0027  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.5 
 
 
185 aa  101  5e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0284  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.65 
 
 
188 aa  99.4  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.503124  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1042  thiol:disulfide interchange protein like protein  37.82 
 
 
135 aa  99.4  3e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1561  thioredoxin  33.55 
 
 
164 aa  91.7  6e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00616006  normal  0.258468 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2724  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.22 
 
 
188 aa  87  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.32328  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1628  redoxin domain-containing protein  36.72 
 
 
278 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0881722  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4236  redoxin domain protein  37.7 
 
 
278 aa  85.1  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3802  redoxin domain-containing protein  36.72 
 
 
278 aa  84.3  8e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1223  hypothetical protein  35.45 
 
 
172 aa  83.2  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0451  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  34.68 
 
 
180 aa  83.6  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1851  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.78 
 
 
409 aa  83.2  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.57 
 
 
166 aa  82.8  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000277693  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0240  Redoxin domain protein  35.29 
 
 
188 aa  83.2  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1445  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.82 
 
 
182 aa  82  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3560  redoxin domain-containing protein  35.94 
 
 
278 aa  82  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1547  redoxin domain-containing protein  36.44 
 
 
155 aa  81.6  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0375508  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0022  thiol:disulfide interchange protein, thioredoxin family protein  32.33 
 
 
175 aa  81.3  0.000000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.117242 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1376  Redoxin domain protein  35.59 
 
 
155 aa  81.3  0.000000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0681198  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2023  redoxin domain-containing protein  36.28 
 
 
161 aa  81.3  0.000000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0511  redoxin domain-containing protein  33.74 
 
 
270 aa  81.3  0.000000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.662182 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2013  thiol:disulfide interchange protein, thioredoxin family protein  33.1 
 
 
176 aa  80.5  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0496  redoxin domain-containing protein  30.66 
 
 
166 aa  80.5  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.520975  normal  0.448467 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1223  Redoxin domain protein  29.71 
 
 
170 aa  78.2  0.00000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.337108  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2118  thioredoxin  33.06 
 
 
164 aa  78.2  0.00000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00100  putative thiol:disulfide interchange protein  39.13 
 
 
277 aa  78.2  0.00000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0049  Redoxin domain protein  30.5 
 
 
180 aa  77.4  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5203  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.09 
 
 
201 aa  77  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0475  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.48 
 
 
157 aa  77  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0330837 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8082  Redoxin domain protein  32.61 
 
 
180 aa  76.3  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6264  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.79 
 
 
173 aa  76.6  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.92814  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0030  Redoxin domain protein  29.25 
 
 
179 aa  76.3  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3455  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.38 
 
 
168 aa  76.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.61185  normal  0.0436894 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2114  thioredoxin family protein  35.4 
 
 
159 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.14615  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0860  Redoxin domain protein  31.01 
 
 
162 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00216693  normal  0.0861373 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2790  putative electron transfer protein  33.33 
 
 
184 aa  75.5  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2444  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.88 
 
 
183 aa  75.9  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.312621  normal  0.571857 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0717  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.43 
 
 
191 aa  75.9  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.17044  normal  0.602428 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1890  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.8 
 
 
171 aa  75.5  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.326681  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2046  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  35.92 
 
 
437 aa  75.5  0.0000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0189188  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1221  peroxiredoxin-like protein  30.25 
 
 
173 aa  75.5  0.0000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1818  redoxin domain-containing protein  30.72 
 
 
165 aa  75.1  0.0000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.165387  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2921  Thiol-disulfide isomerase/thioredoxin-like  35.25 
 
 
269 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.253355  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0721  cytochrome C biogenesis protein  30.23 
 
 
403 aa  74.3  0.0000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0051  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.09 
 
 
178 aa  74.3  0.0000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.523254  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0050  redoxin domain-containing protein  29.49 
 
 
180 aa  74.3  0.0000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.577845  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04554  thioredoxin  31.34 
 
 
200 aa  74.3  0.0000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1239  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  32.76 
 
 
422 aa  73.9  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.502856  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3738  redoxin domain-containing protein  35.16 
 
 
268 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.22 
 
 
187 aa  73.9  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4563  redoxin domain-containing protein  28.8 
 
 
237 aa  73.6  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0243  redoxin domain-containing protein  29.08 
 
 
184 aa  73.9  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.487537  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0866  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.01 
 
 
183 aa  73.9  0.000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0725  thioredoxin, thioldisulfide interchange protein  35.4 
 
 
183 aa  72.8  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.409063  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1906  hypothetical protein  32.71 
 
 
153 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.203094 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1843  thioredoxin-like  34.82 
 
 
164 aa  73.2  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0739  putative cytochrome C-type biogenesis protein  30.23 
 
 
403 aa  73.6  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0112308  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5120  redoxin domain-containing protein  33.33 
 
 
269 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.329832 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>