More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0725 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_0725  thioredoxin, thioldisulfide interchange protein  100 
 
 
183 aa  364  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.409063  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2380  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  99.45 
 
 
183 aa  359  1e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.632646 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2444  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  85.79 
 
 
183 aa  292  1e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.312621  normal  0.571857 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3733  redoxin  55.68 
 
 
187 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.78163 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0496  thiol:disulfide interchange protein, putative  52.84 
 
 
184 aa  192  3e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2023  redoxin domain-containing protein  57.66 
 
 
161 aa  173  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3063  Thiol:disulfide interchange protein TlpA  48.07 
 
 
191 aa  167  8e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1401  redoxin domain-containing protein  42.34 
 
 
191 aa  133  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.774278  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3502  hypothetical protein  41.1 
 
 
223 aa  122  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.460677 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1603  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  43.17 
 
 
203 aa  122  4e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.673195  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2276  Redoxin domain protein  38.73 
 
 
171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0398  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  48.76 
 
 
223 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0641884  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3616  redoxin domain-containing protein  38.61 
 
 
226 aa  115  3.9999999999999997e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0668445  normal  0.0142654 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3412  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.84 
 
 
169 aa  115  5e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3474  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.84 
 
 
169 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.163841 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2370  redoxin domain-containing protein  35.71 
 
 
195 aa  112  3e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.36236 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2006  redoxin domain-containing protein  40.85 
 
 
176 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0112011  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3478  thioredoxin-like protein  33.12 
 
 
223 aa  110  8.000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1000  redoxin domain-containing protein  40.97 
 
 
238 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1737  redoxin domain-containing protein  39.49 
 
 
210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.958182  normal  0.712311 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0716  thioredoxin-like protein  32.89 
 
 
223 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.620578 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1905  putative thiol:disulfide interchange protein  40.94 
 
 
238 aa  108  4.0000000000000004e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1980  thiol:disulfide interchange protein, putative  40.94 
 
 
238 aa  108  6e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2452  thioredoxin family protein  38.69 
 
 
170 aa  107  9.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000374764  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1187  Redoxin domain protein  36.18 
 
 
225 aa  107  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.151473 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5989  redoxin domain-containing protein  37.66 
 
 
217 aa  104  6e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.870389  normal  0.126817 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0272  thioredoxin family protein  37.65 
 
 
182 aa  103  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.900103 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4503  redoxin domain-containing protein  34.42 
 
 
213 aa  103  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1321  thioredoxin family protein  36.23 
 
 
168 aa  103  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3739  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  38.3 
 
 
170 aa  102  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0260987  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0053  anti-oxidant AhpCTSA family protein  39.37 
 
 
232 aa  102  3e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0746  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.53 
 
 
200 aa  101  6e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.204935  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3488  Redoxin domain protein  34.42 
 
 
216 aa  101  6e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.207064 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3564  Redoxin domain protein  35.67 
 
 
220 aa  100  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.365622 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5226  Redoxin domain protein  36.23 
 
 
228 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.387928  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4876  thioredoxin-like  30.57 
 
 
224 aa  99.8  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.608782  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3210  redoxin domain-containing protein  34.78 
 
 
209 aa  99.8  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.541056 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0935  thioredoxin-like  31.21 
 
 
222 aa  99.4  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2535  redoxin domain-containing protein  33.85 
 
 
224 aa  98.6  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.772759 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3857  Redoxin domain protein  35.71 
 
 
220 aa  98.2  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0709217 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1144  Thiol disulfide interchange protein tlpA (cytochrome c biogenesis protein tlpA)  33.33 
 
 
229 aa  97.4  9e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.243856  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3382  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  39.72 
 
 
202 aa  97.1  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.305938 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2865  redoxin domain-containing protein  36.36 
 
 
170 aa  96.3  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.220691  normal  0.154484 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4643  putative thiol--disulfide interchange redox-active center transmembrane protein  32.72 
 
 
193 aa  96.7  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4016  thiol:disulfide interchange protein  33.33 
 
 
220 aa  95.9  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0200  thioredoxin domain-containing protein  41.98 
 
 
189 aa  95.5  4e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0826  thioredoxin-like protein  31.25 
 
 
222 aa  95.1  6e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3611  Redoxin domain protein  34.59 
 
 
213 aa  94  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.338922  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3037  redoxin  31.82 
 
 
221 aa  93.6  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7297  Redoxin domain protein  38.52 
 
 
217 aa  92  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0540011  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3288  redoxin domain-containing protein  33.83 
 
 
213 aa  91.3  6e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0237  redoxin domain-containing protein  27.4 
 
 
193 aa  90.9  9e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000132187  unclonable  0.000000000045327 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3774  thiol-disulfide isomerase-like protein  31.65 
 
 
173 aa  90.5  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.166782  normal  0.0186728 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3951  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  34.23 
 
 
188 aa  89.7  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.337329 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1468  Redoxin domain-containing protein  40.3 
 
 
164 aa  89.4  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0261888  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0087  thiol-disulfide isomerase-like protein  32.58 
 
 
170 aa  89.4  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.653321  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0237  redoxin domain-containing protein  26.71 
 
 
193 aa  88.6  4e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000458104  hitchhiker  0.00000000877704 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0232  redoxin domain-containing protein  26.71 
 
 
193 aa  88.6  4e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000057561  normal  0.0469952 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2724  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.33 
 
 
188 aa  87  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.32328  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0269  thioredoxin, putative  26.52 
 
 
194 aa  86.7  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3721  redoxin domain-containing protein  26.71 
 
 
195 aa  86.3  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000547051  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0185  redoxin domain-containing protein  27.45 
 
 
179 aa  86.3  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000121029  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1239  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  33.8 
 
 
422 aa  85.9  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.502856  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2212  thioredoxin-like  35.82 
 
 
133 aa  85.5  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.249121  normal  0.498719 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1248  redoxin  41.32 
 
 
192 aa  84.7  7e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.525672 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.53 
 
 
166 aa  84.3  8e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000277693  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2015  Redoxin domain protein  38.71 
 
 
169 aa  84.3  9e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.878112  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0511  redoxin domain-containing protein  37.8 
 
 
270 aa  84.3  9e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.662182 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0234  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.34 
 
 
195 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000290768  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2678  thioredoxin family protein  33.33 
 
 
183 aa  82.8  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5008  Redoxin domain protein  34.97 
 
 
248 aa  82.4  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.437471  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0221  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.71 
 
 
198 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000103908  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5957  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.3 
 
 
378 aa  82.4  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.131947  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4444  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  38.26 
 
 
196 aa  82  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.133035 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2939  redoxin domain-containing protein  34.53 
 
 
179 aa  81.6  0.000000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.670984  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0234  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.09 
 
 
195 aa  81.6  0.000000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000676147  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0237  redoxin domain-containing protein  24.09 
 
 
195 aa  81.6  0.000000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000304189  normal  0.555945 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4018  Redoxin domain protein  25.34 
 
 
195 aa  81.6  0.000000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000656655  hitchhiker  0.00619092 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0181  alkyl hydroperoxide reductase  32.39 
 
 
183 aa  81.3  0.000000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0243778  normal  0.461108 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2395  thioredoxin-like protein  38.84 
 
 
278 aa  81.3  0.000000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000335524  hitchhiker  0.0000244413 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2908  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  38.02 
 
 
199 aa  80.1  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.629655  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0240  Redoxin domain protein  34.15 
 
 
188 aa  79.7  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1947  redoxin  33.61 
 
 
198 aa  79.7  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.489864  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1954  thioredoxin  33.58 
 
 
184 aa  80.1  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0251  thioredoxin, putative  30.4 
 
 
193 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000212412  normal  0.0823497 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0023  redoxin domain-containing protein  38.64 
 
 
167 aa  79.7  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.239793  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1249  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.33 
 
 
331 aa  79.7  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.768567  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1661  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.82 
 
 
192 aa  79  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4281  redoxin domain-containing protein  25.17 
 
 
192 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000444464  normal  0.0383421 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1221  peroxiredoxin-like protein  37.72 
 
 
173 aa  79.3  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1818  redoxin domain-containing protein  35.71 
 
 
165 aa  79.3  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.165387  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4515  Redoxin domain protein  41.35 
 
 
182 aa  79.3  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.706217  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1223  Redoxin domain protein  30.43 
 
 
170 aa  79.3  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.337108  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2261  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.8 
 
 
191 aa  79  0.00000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.124304  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0735  redoxin domain-containing protein  30.83 
 
 
211 aa  78.6  0.00000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1851  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.2 
 
 
409 aa  78.6  0.00000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1768  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.66 
 
 
446 aa  78.6  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.197214  normal  0.508736 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0196  redoxin domain-containing protein  25 
 
 
195 aa  77.8  0.00000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000417571  normal  0.0470366 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1448  thioredoxin family protein  34.65 
 
 
390 aa  77.8  0.00000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00492149  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0717  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.97 
 
 
191 aa  77.8  0.00000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.17044  normal  0.602428 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>