More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1843 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1843  thioredoxin-like  100 
 
 
164 aa  338  1e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0181  alkyl hydroperoxide reductase  46.67 
 
 
183 aa  132  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0243778  normal  0.461108 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  40 
 
 
187 aa  118  3e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3927  thioredoxin-like  37.58 
 
 
174 aa  110  6e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298512  normal  0.186192 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0577  redoxin  36.13 
 
 
172 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.786564  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0506  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.13 
 
 
175 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0010915  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3551  thiol:disulfide interchange protein DsbE, putative  37.35 
 
 
173 aa  108  4.0000000000000004e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.571735 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0371  thioredoxin  42.98 
 
 
187 aa  102  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0364  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.38 
 
 
170 aa  102  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000189648  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1355  thiol-disulfide oxidoreductase  36.48 
 
 
173 aa  101  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1383  thiol-disulfide oxidoreductase  37.58 
 
 
173 aa  99.8  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1494  thiol-disulfide oxidoreductase  37.58 
 
 
173 aa  99.8  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1566  thiol-disulfide oxidoreductase  37.58 
 
 
173 aa  100  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.62392e-19 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0547  peroxiredoxin-like protein  36.11 
 
 
168 aa  99.8  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1234  redoxin domain-containing protein  33.82 
 
 
167 aa  98.2  4e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1818  redoxin domain-containing protein  35.71 
 
 
165 aa  97.4  7e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.165387  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1528  thiol-disulfide oxidoreductase  40.83 
 
 
173 aa  97.4  8e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3817  thiol-disulfide oxidoreductase  40.83 
 
 
173 aa  97.4  8e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000518727 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3280  thioredoxin-related protein  29.75 
 
 
171 aa  96.7  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1396  thiol-disulfide oxidoreductase  36.42 
 
 
173 aa  96.7  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0023  redoxin domain-containing protein  35.09 
 
 
167 aa  97.1  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.239793  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0325  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.07 
 
 
189 aa  95.9  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0365546 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1221  peroxiredoxin-like protein  38.14 
 
 
173 aa  95.1  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3474  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.36 
 
 
169 aa  94.4  6e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.163841 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0861  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.58 
 
 
189 aa  94  7e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.155376  hitchhiker  0.00638708 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1566  hypothetical protein  31.1 
 
 
172 aa  94.4  7e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1598  thiol-disulfide oxidoreductase  39.17 
 
 
173 aa  94  9e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.966744  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1356  thiol-disulfide oxidoreductase  39.17 
 
 
173 aa  93.6  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1857  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.75 
 
 
280 aa  93.6  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1441  Redoxin domain protein  35.29 
 
 
158 aa  93.6  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0403  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.77 
 
 
174 aa  93.2  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000117414  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1851  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  36.64 
 
 
409 aa  92.4  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3412  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.54 
 
 
169 aa  92  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3381  redoxin domain-containing protein  28.38 
 
 
171 aa  92  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232312  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1572  hypothetical protein  33.53 
 
 
194 aa  91.7  4e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0149339 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0403  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.13 
 
 
174 aa  91.7  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1248  redoxin  37.78 
 
 
192 aa  92  4e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.525672 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1445  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.72 
 
 
182 aa  91.7  5e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1197  thiol-disulfide oxidoreductase  32.53 
 
 
173 aa  91.3  5e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1634  thiol-disulfide oxidoreductase  38.33 
 
 
173 aa  90.9  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0051  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.56 
 
 
178 aa  90.5  9e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.523254  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0050  redoxin domain-containing protein  29.88 
 
 
180 aa  90.1  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.577845  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1916  redoxin domain-containing protein  31.13 
 
 
155 aa  89.4  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000172621  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4074  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.57 
 
 
355 aa  89.4  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0183  Redoxin domain protein  35.04 
 
 
154 aa  89.4  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0746  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.65 
 
 
200 aa  89.4  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.204935  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1890  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.44 
 
 
171 aa  89.4  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.326681  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2403  Redoxin domain protein  31.13 
 
 
155 aa  89.4  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000463478  hitchhiker  0.00393062 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1923  redoxin domain-containing protein  31.13 
 
 
155 aa  89.4  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00232148  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1661  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  39.29 
 
 
192 aa  89.7  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1890  redoxin domain-containing protein  31.13 
 
 
155 aa  89.4  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000501621  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0030  Redoxin domain protein  30.43 
 
 
179 aa  88.6  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0032  Redoxin domain protein  34.33 
 
 
182 aa  89  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000358102  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1054  thioredoxin  36.29 
 
 
173 aa  88.6  4e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000221964  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3229  thioredoxin-related protein  28.93 
 
 
170 aa  88.2  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000047722  normal  0.231945 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1223  Redoxin domain protein  34.29 
 
 
170 aa  87.8  6e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.337108  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1124  redoxin domain-containing protein  29.01 
 
 
181 aa  87.8  6e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.65139  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0399  thiol-disulfide oxidoreductase  34.87 
 
 
174 aa  87.4  8e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0228  redoxin domain-containing protein  32.93 
 
 
174 aa  87  9e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.454071  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1321  thioredoxin family protein  35.48 
 
 
168 aa  87  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0184  thioredoxin family protein, putative  31.1 
 
 
171 aa  86.7  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.148169 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1533  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.04 
 
 
193 aa  86.3  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5421  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.87 
 
 
194 aa  85.9  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.305949 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0760  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.68 
 
 
228 aa  86.3  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.173874 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2013  thiol:disulfide interchange protein, thioredoxin family protein  30.92 
 
 
176 aa  85.9  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0534  putative thioredoxin  33.33 
 
 
180 aa  85.5  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.677226 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3501  thioredoxin family protein  37.61 
 
 
186 aa  85.1  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.511578  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3463  thioredoxin family protein  37.61 
 
 
186 aa  85.1  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2499  thioredoxin family protein, putative  37.61 
 
 
186 aa  85.1  4e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.129809  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3498  thioredoxin  37.61 
 
 
202 aa  85.1  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3285  putative thioredoxin family protein  37.61 
 
 
186 aa  85.1  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1279  putative thioredoxin family protein  37.61 
 
 
186 aa  85.1  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0420  putative thioredoxin family protein  37.61 
 
 
186 aa  85.1  4e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4444  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.87 
 
 
196 aa  84.7  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.133035 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0022  thiol:disulfide interchange protein, thioredoxin family protein  32.47 
 
 
175 aa  84.7  5e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.117242 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3739  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.07 
 
 
170 aa  84.3  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0260987  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2790  putative electron transfer protein  26.88 
 
 
184 aa  84  7e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2100  thioredoxin family protein  29.3 
 
 
155 aa  84  8e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4194  putative thiol-disulfide isomerase and thioredoxins  33.83 
 
 
176 aa  84  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.462178 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2095  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.11 
 
 
288 aa  84  9e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.411423  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2011  redoxin domain-containing protein  35 
 
 
174 aa  83.6  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0343225 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1895  redoxin domain-containing protein  28.24 
 
 
189 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.132277 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0272  thioredoxin family protein  35.03 
 
 
182 aa  83.2  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.900103 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0496  redoxin domain-containing protein  32.59 
 
 
166 aa  83.6  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.520975  normal  0.448467 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2087  redoxin domain-containing protein  29.66 
 
 
155 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0109878  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1042  thiol:disulfide interchange protein like protein  36.52 
 
 
135 aa  82.8  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0190  cytochrome c biogenesis protein, putative  30.82 
 
 
201 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.648376  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2431  putative thioredoxin  38.24 
 
 
164 aa  82.4  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0274  cytochrome c biogenesis protein, putative  32.09 
 
 
194 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2452  thioredoxin family protein  32 
 
 
170 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000374764  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0521  Redoxin domain protein  33.83 
 
 
176 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.037804  normal  0.85402 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2682  thioredoxin  33.85 
 
 
183 aa  83.2  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0240  Redoxin domain protein  30.22 
 
 
188 aa  82.8  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3455  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.01 
 
 
168 aa  82.8  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.61185  normal  0.0436894 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3231  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.38 
 
 
160 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0496837 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0475  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.57 
 
 
173 aa  82.4  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1187  Redoxin domain protein  35.07 
 
 
225 aa  82.4  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.151473 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3819  redoxin domain-containing protein  31.88 
 
 
155 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0554152  hitchhiker  0.000365745 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1165  thioredoxin family protein, putative  35.04 
 
 
202 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0860  Redoxin domain protein  30.82 
 
 
162 aa  81.6  0.000000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00216693  normal  0.0861373 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>