More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1916 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_1916  redoxin domain-containing protein  100 
 
 
155 aa  321  3e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000172621  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1890  redoxin domain-containing protein  100 
 
 
155 aa  321  3e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000501621  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1923  redoxin domain-containing protein  99.35 
 
 
155 aa  320  6e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00232148  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2403  Redoxin domain protein  99.35 
 
 
155 aa  320  6e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000463478  hitchhiker  0.00393062 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2087  redoxin domain-containing protein  80 
 
 
155 aa  264  2.9999999999999995e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0109878  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1823  redoxin domain-containing protein  84.52 
 
 
155 aa  264  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0149049  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2154  redoxin domain-containing protein  84.52 
 
 
160 aa  264  4e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00992138  normal  0.309785 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1881  redoxin domain-containing protein  81.94 
 
 
160 aa  260  6e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.180208  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2100  thioredoxin family protein  77.42 
 
 
155 aa  258  2e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3819  redoxin domain-containing protein  67.1 
 
 
155 aa  212  1.9999999999999998e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0554152  hitchhiker  0.000365745 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1124  redoxin domain-containing protein  65.73 
 
 
181 aa  209  1e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.65139  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1680  thioredoxin family protein  61.15 
 
 
173 aa  197  3e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0732573  normal  0.832163 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2219  redoxin domain-containing protein  57.45 
 
 
171 aa  187  2.9999999999999997e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.231269  hitchhiker  0.0012501 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0577  redoxin  50.33 
 
 
172 aa  169  9e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.786564  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1895  redoxin domain-containing protein  50.33 
 
 
189 aa  163  9e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.132277 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4599  thioredoxin family protein  52.46 
 
 
158 aa  157  5e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2790  putative electron transfer protein  45.1 
 
 
184 aa  152  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2330  redoxin domain-containing protein  50.79 
 
 
182 aa  145  3e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0220843  normal  0.114358 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2293  thioredoxin family protein  47.15 
 
 
183 aa  145  3e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1180  RecJ exonuclease  50.83 
 
 
160 aa  142  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0271144 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2011  redoxin domain-containing protein  44.72 
 
 
174 aa  134  4e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0343225 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1223  hypothetical protein  45.27 
 
 
172 aa  134  6.0000000000000005e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1572  hypothetical protein  47.54 
 
 
194 aa  130  6.999999999999999e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0149339 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2408  hypothetical protein  43.9 
 
 
160 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.908805  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1566  hypothetical protein  40.8 
 
 
172 aa  124  4.0000000000000003e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1818  redoxin domain-containing protein  34.25 
 
 
165 aa  120  9e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.165387  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0547  peroxiredoxin-like protein  30.2 
 
 
168 aa  107  5e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1223  Redoxin domain protein  32.86 
 
 
170 aa  107  7.000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.337108  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1221  peroxiredoxin-like protein  31.47 
 
 
173 aa  102  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1598  thiol-disulfide oxidoreductase  31.25 
 
 
173 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.966744  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1356  thiol-disulfide oxidoreductase  31.25 
 
 
173 aa  99.8  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1634  thiol-disulfide oxidoreductase  31.25 
 
 
173 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1234  redoxin domain-containing protein  31.37 
 
 
167 aa  99  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3551  thiol:disulfide interchange protein DsbE, putative  30.22 
 
 
173 aa  96.3  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.571735 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0181  alkyl hydroperoxide reductase  32.89 
 
 
183 aa  94  7e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0243778  normal  0.461108 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1355  thiol-disulfide oxidoreductase  29.46 
 
 
173 aa  90.5  8e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1566  thiol-disulfide oxidoreductase  29.46 
 
 
173 aa  89  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.62392e-19 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1843  thioredoxin-like  31.13 
 
 
164 aa  89.4  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3455  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.23 
 
 
168 aa  89  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.61185  normal  0.0436894 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0496  redoxin domain-containing protein  32.12 
 
 
166 aa  88.6  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.520975  normal  0.448467 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2046  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  36.63 
 
 
437 aa  88.6  3e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0189188  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1396  thiol-disulfide oxidoreductase  27.68 
 
 
173 aa  88.6  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1383  thiol-disulfide oxidoreductase  28.57 
 
 
173 aa  88.2  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1528  thiol-disulfide oxidoreductase  28.57 
 
 
173 aa  88.2  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3817  thiol-disulfide oxidoreductase  28.57 
 
 
173 aa  88.2  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000518727 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1494  thiol-disulfide oxidoreductase  28.57 
 
 
173 aa  88.2  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2276  Redoxin domain protein  32.03 
 
 
171 aa  87.8  5e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0506  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.49 
 
 
175 aa  87.4  6e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0010915  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0364  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.21 
 
 
170 aa  87.4  7e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000189648  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0994  hypothetical protein  33.33 
 
 
311 aa  86.3  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0860  Redoxin domain protein  31.06 
 
 
162 aa  86.7  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00216693  normal  0.0861373 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3474  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.14 
 
 
169 aa  85.9  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.163841 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0525  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.34 
 
 
178 aa  85.9  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000136072  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2137  thiol-disulfide oxidoreductase  32.86 
 
 
156 aa  85.1  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.213967 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2704  hypothetical protein  29.58 
 
 
205 aa  85.1  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.396222  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1857  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28 
 
 
280 aa  85.5  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1358  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.61 
 
 
179 aa  85.1  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000315647  hitchhiker  0.00000356135 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1954  thioredoxin  28.87 
 
 
184 aa  85.1  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1197  thiol-disulfide oxidoreductase  26.79 
 
 
173 aa  85.1  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2135  thiol-disulfide oxidoreductase  32.86 
 
 
165 aa  85.1  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2245  redoxin domain-containing protein  32.86 
 
 
165 aa  85.1  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1239  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  29.46 
 
 
422 aa  84.3  5e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.502856  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2903  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.55 
 
 
184 aa  84  6e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1612  redoxin domain-containing protein  31.15 
 
 
180 aa  84  7e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.422443 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3280  thioredoxin-related protein  29.79 
 
 
171 aa  83.6  8e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0403  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.94 
 
 
174 aa  83.6  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000117414  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2095  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30 
 
 
288 aa  82.8  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.411423  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2509  putative thiol:disulfide interchange protein  27.08 
 
 
165 aa  82.4  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.343954  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3537  Redoxin domain protein  31.93 
 
 
182 aa  82.8  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.694899  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3229  thioredoxin-related protein  31.21 
 
 
170 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000047722  normal  0.231945 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3473  Redoxin domain protein  31.93 
 
 
178 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.576052  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0721  cytochrome C biogenesis protein  28.8 
 
 
403 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3412  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.15 
 
 
169 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0403  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.3 
 
 
174 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3043  thioredoxin family protein  33.05 
 
 
433 aa  82  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0739  putative cytochrome C-type biogenesis protein  28.8 
 
 
403 aa  81.6  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0112308  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3390  hypothetical protein  29.66 
 
 
182 aa  81.3  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18200  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.62 
 
 
178 aa  81.3  0.000000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000397372  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.93 
 
 
166 aa  80.9  0.000000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000277693  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1344  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.01 
 
 
181 aa  80.9  0.000000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6578  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.06 
 
 
185 aa  80.5  0.000000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.861573 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1959  redoxin domain-containing protein  31.15 
 
 
189 aa  80.5  0.000000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0329542  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2855  Redoxin domain-containing protein  29.37 
 
 
160 aa  80.5  0.000000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1376  Redoxin domain protein  28.18 
 
 
155 aa  80.5  0.000000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0681198  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1661  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.08 
 
 
192 aa  80.5  0.000000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1947  redoxin  29.75 
 
 
198 aa  80.1  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.489864  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4480  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.78 
 
 
194 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1533  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.74 
 
 
193 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2982  hypothetical protein  28.47 
 
 
174 aa  79.7  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.138377  normal  0.0639379 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0030  Redoxin domain protein  31.01 
 
 
179 aa  79.7  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0760  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.62 
 
 
228 aa  79  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.173874 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0240  Redoxin domain protein  27.78 
 
 
188 aa  79  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1288  thiol:disulfide interchange protein CycY  34.43 
 
 
208 aa  78.6  0.00000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2627  redoxin domain-containing protein  33.33 
 
 
182 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0237  redoxin domain-containing protein  31.78 
 
 
193 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000132187  unclonable  0.000000000045327 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4444  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.08 
 
 
196 aa  77.8  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.133035 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0399  thiol-disulfide oxidoreductase  25 
 
 
174 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2452  thioredoxin family protein  27.64 
 
 
170 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000374764  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3927  thioredoxin-like  29.46 
 
 
174 aa  77.8  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298512  normal  0.186192 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1445  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.71 
 
 
182 aa  77.8  0.00000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>