More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0030 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_0030  Redoxin domain protein  100 
 
 
179 aa  362  1e-99  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2013  thiol:disulfide interchange protein, thioredoxin family protein  64.78 
 
 
176 aa  216  1e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0049  Redoxin domain protein  63.12 
 
 
180 aa  216  1e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0050  redoxin domain-containing protein  53.57 
 
 
180 aa  195  3e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.577845  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0022  thiol:disulfide interchange protein, thioredoxin family protein  60.84 
 
 
175 aa  191  6e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.117242 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0051  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  56.25 
 
 
178 aa  189  2e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.523254  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1313  Redoxin domain protein  51.88 
 
 
182 aa  183  1.0000000000000001e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000515497  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0032  Redoxin domain protein  48.32 
 
 
182 aa  167  6e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000358102  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0469  redoxin domain-containing protein  51.68 
 
 
190 aa  167  7e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1928  thioredoxin family thiol:disulfide interchange protein  51.66 
 
 
183 aa  167  8e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.652807  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0817  Redoxin domain protein  53.62 
 
 
182 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0724066  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0496  redoxin domain-containing protein  41.41 
 
 
166 aa  111  5e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.520975  normal  0.448467 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0181  alkyl hydroperoxide reductase  34.53 
 
 
183 aa  105  5e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0243778  normal  0.461108 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  39.52 
 
 
187 aa  103  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3280  thioredoxin-related protein  33.85 
 
 
171 aa  102  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1054  thioredoxin  36.03 
 
 
173 aa  101  6e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000221964  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1197  thiol-disulfide oxidoreductase  32.84 
 
 
173 aa  100  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.36 
 
 
166 aa  100  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000277693  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1445  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.29 
 
 
182 aa  100  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1561  thioredoxin  35.22 
 
 
164 aa  99  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00616006  normal  0.258468 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0364  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.77 
 
 
170 aa  99.4  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000189648  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3927  thioredoxin-like  30.2 
 
 
174 aa  99  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298512  normal  0.186192 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2682  thioredoxin  37.76 
 
 
183 aa  98.6  4e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0403  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.12 
 
 
174 aa  97.4  9e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0403  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.56 
 
 
174 aa  97.1  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000117414  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0506  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.06 
 
 
175 aa  97.1  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0010915  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3817  thiol-disulfide oxidoreductase  31.34 
 
 
173 aa  95.1  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000518727 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2452  thioredoxin family protein  36.43 
 
 
170 aa  95.1  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000374764  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1396  thiol-disulfide oxidoreductase  31.34 
 
 
173 aa  95.1  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1383  thiol-disulfide oxidoreductase  32.06 
 
 
173 aa  94.7  6e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1494  thiol-disulfide oxidoreductase  32.06 
 
 
173 aa  94.7  6e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1528  thiol-disulfide oxidoreductase  32.06 
 
 
173 aa  94.4  8e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3229  thioredoxin-related protein  30.56 
 
 
170 aa  94.4  8e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000047722  normal  0.231945 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1598  thiol-disulfide oxidoreductase  31.34 
 
 
173 aa  93.2  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.966744  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1356  thiol-disulfide oxidoreductase  31.34 
 
 
173 aa  93.2  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1566  thiol-disulfide oxidoreductase  31.3 
 
 
173 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.62392e-19 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0399  thiol-disulfide oxidoreductase  31.43 
 
 
174 aa  92.4  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0243  redoxin domain-containing protein  35.56 
 
 
184 aa  92.4  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.487537  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0861  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.33 
 
 
189 aa  91.7  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.155376  hitchhiker  0.00638708 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3474  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.33 
 
 
169 aa  91.3  6e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.163841 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1321  thioredoxin family protein  34.07 
 
 
168 aa  90.9  9e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1634  thiol-disulfide oxidoreductase  30.6 
 
 
173 aa  90.1  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0509  redoxin domain-containing protein  35.29 
 
 
184 aa  90.9  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0533  redoxin domain-containing protein  35.29 
 
 
183 aa  90.5  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.917814  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1547  redoxin domain-containing protein  42.71 
 
 
155 aa  89.4  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0375508  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1890  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.68 
 
 
171 aa  89.7  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.326681  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6861  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.08 
 
 
191 aa  89.7  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0371  thioredoxin  33.85 
 
 
187 aa  89.4  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1492  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.58 
 
 
193 aa  89  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3381  redoxin domain-containing protein  31.94 
 
 
171 aa  89  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232312  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1843  thioredoxin-like  30.43 
 
 
164 aa  88.6  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3412  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.58 
 
 
169 aa  88.6  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1223  Redoxin domain protein  28.26 
 
 
170 aa  88.6  5e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.337108  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0272  thioredoxin family protein  32.56 
 
 
182 aa  87.8  7e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.900103 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1355  thiol-disulfide oxidoreductase  29.77 
 
 
173 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3690  Thiol-disulfide isomerase/thioredoxin-like  32.68 
 
 
183 aa  87.4  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.405129 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0576  redoxin domain-containing protein  34.78 
 
 
183 aa  87.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000460325 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0124  redoxin  34.06 
 
 
182 aa  87  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.909527  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0023  redoxin domain-containing protein  31.16 
 
 
167 aa  87  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.239793  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0607  redoxin domain-containing protein  34.06 
 
 
182 aa  87  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2114  thioredoxin family protein  32.14 
 
 
159 aa  86.3  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.14615  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2276  Redoxin domain protein  32.85 
 
 
171 aa  86.7  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1221  peroxiredoxin-like protein  29.14 
 
 
173 aa  86.3  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0547  peroxiredoxin-like protein  30.22 
 
 
168 aa  86.3  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1818  redoxin domain-containing protein  31.2 
 
 
165 aa  86.7  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.165387  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0676  Redoxin domain protein  33.8 
 
 
165 aa  85.5  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2095  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.17 
 
 
288 aa  85.5  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.411423  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0325  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.16 
 
 
189 aa  85.1  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0365546 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2283  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.22 
 
 
199 aa  85.1  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000858823  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0240  Redoxin domain protein  34.17 
 
 
188 aa  85.1  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3951  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  28.48 
 
 
188 aa  85.1  5e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.337329 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0451  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  34.69 
 
 
180 aa  85.1  5e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1661  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.94 
 
 
192 aa  85.1  5e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4040  electron transport protein SCO1/SenC like  32.21 
 
 
201 aa  84.7  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.419524  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18200  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.87 
 
 
178 aa  84  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000397372  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4183  Redoxin domain protein  32.21 
 
 
201 aa  84  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438979  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1344  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.6 
 
 
181 aa  84  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2006  redoxin domain-containing protein  33.08 
 
 
176 aa  83.6  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0112011  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1239  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  29.32 
 
 
422 aa  82.8  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.502856  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0739  putative cytochrome C-type biogenesis protein  29.73 
 
 
403 aa  82.8  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0112308  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0721  cytochrome C biogenesis protein  29.73 
 
 
403 aa  83.2  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0212  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.47 
 
 
175 aa  82.4  0.000000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0420  putative thioredoxin family protein  33.33 
 
 
186 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1279  putative thioredoxin family protein  33.33 
 
 
186 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2499  thioredoxin family protein, putative  33.33 
 
 
186 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.129809  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4573  Redoxin domain protein  30.82 
 
 
191 aa  82.4  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3498  thioredoxin  33.33 
 
 
202 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3463  thioredoxin family protein  33.33 
 
 
186 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3501  thioredoxin family protein  33.33 
 
 
186 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.511578  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4473  redoxin domain-containing protein  29.93 
 
 
203 aa  82.4  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4304  redoxin domain-containing protein  29.93 
 
 
203 aa  82.4  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.213617  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4204  redoxin domain-containing protein  29.93 
 
 
203 aa  82.4  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3285  putative thioredoxin family protein  33.33 
 
 
186 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2777  redoxin domain-containing protein  32.84 
 
 
182 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.769829  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2118  thioredoxin  27.66 
 
 
164 aa  81.6  0.000000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0399  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.29 
 
 
171 aa  81.6  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.689513  normal  0.928423 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2011  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.2 
 
 
378 aa  81.3  0.000000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2000  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.19 
 
 
173 aa  81.6  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.236605  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5008  Redoxin domain protein  32.82 
 
 
248 aa  81.3  0.000000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.437471  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3739  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.71 
 
 
170 aa  81.3  0.000000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0260987  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>