More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1928 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_1928  thioredoxin family thiol:disulfide interchange protein  100 
 
 
183 aa  380  1e-105  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.652807  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0817  Redoxin domain protein  69.62 
 
 
182 aa  245  3e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0724066  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1313  Redoxin domain protein  56.67 
 
 
182 aa  215  2.9999999999999998e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000515497  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0469  redoxin domain-containing protein  52.3 
 
 
190 aa  197  7.999999999999999e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0030  Redoxin domain protein  51.66 
 
 
179 aa  167  8e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0049  Redoxin domain protein  46.47 
 
 
180 aa  160  7e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0051  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  45.88 
 
 
178 aa  159  2e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.523254  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0022  thiol:disulfide interchange protein, thioredoxin family protein  48.08 
 
 
175 aa  159  3e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.117242 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2013  thiol:disulfide interchange protein, thioredoxin family protein  45.32 
 
 
176 aa  147  9e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0050  redoxin domain-containing protein  43.98 
 
 
180 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.577845  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0032  Redoxin domain protein  43.8 
 
 
182 aa  140  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000358102  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3927  thioredoxin-like  29.94 
 
 
174 aa  101  8e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298512  normal  0.186192 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2682  thioredoxin  35.23 
 
 
183 aa  97.8  8e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1197  thiol-disulfide oxidoreductase  30.23 
 
 
173 aa  94.4  9e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2114  thioredoxin family protein  35.65 
 
 
159 aa  91.7  6e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.14615  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1396  thiol-disulfide oxidoreductase  29.94 
 
 
173 aa  91.3  6e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1355  thiol-disulfide oxidoreductase  30.51 
 
 
173 aa  90.9  9e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3280  thioredoxin-related protein  31.4 
 
 
171 aa  90.1  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3817  thiol-disulfide oxidoreductase  29.94 
 
 
173 aa  88.6  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000518727 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0243  redoxin domain-containing protein  30.48 
 
 
184 aa  89  4e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.487537  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1356  thiol-disulfide oxidoreductase  28.25 
 
 
173 aa  88.2  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1383  thiol-disulfide oxidoreductase  29.94 
 
 
173 aa  88.2  6e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1494  thiol-disulfide oxidoreductase  29.94 
 
 
173 aa  88.2  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0181  alkyl hydroperoxide reductase  29.44 
 
 
183 aa  88.2  6e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0243778  normal  0.461108 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1598  thiol-disulfide oxidoreductase  27.27 
 
 
173 aa  87.8  8e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.966744  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1566  thiol-disulfide oxidoreductase  29.94 
 
 
173 aa  87.8  8e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.62392e-19 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3229  thioredoxin-related protein  31.21 
 
 
170 aa  87  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000047722  normal  0.231945 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1528  thiol-disulfide oxidoreductase  29.94 
 
 
173 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0496  redoxin domain-containing protein  31.82 
 
 
166 aa  86.3  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.520975  normal  0.448467 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0506  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.56 
 
 
175 aa  85.9  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0010915  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1634  thiol-disulfide oxidoreductase  26.7 
 
 
173 aa  85.1  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1248  redoxin  37.59 
 
 
192 aa  82.8  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.525672 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1221  peroxiredoxin-like protein  29.66 
 
 
173 aa  82  0.000000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1054  thioredoxin  30.39 
 
 
173 aa  80.9  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000221964  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0371  thioredoxin  28.38 
 
 
187 aa  80.1  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0364  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.94 
 
 
170 aa  79  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000189648  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1843  thioredoxin-like  27.22 
 
 
164 aa  79  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0547  peroxiredoxin-like protein  29.29 
 
 
168 aa  79  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2095  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.06 
 
 
288 aa  78.6  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.411423  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.55 
 
 
166 aa  79  0.00000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000277693  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0676  Redoxin domain protein  33.57 
 
 
165 aa  77.8  0.00000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2118  thioredoxin  31.43 
 
 
164 aa  77.8  0.00000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3822  putative thioredoxin  28.12 
 
 
164 aa  77.8  0.00000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.644902  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1533  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.27 
 
 
193 aa  77.8  0.00000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0861  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.67 
 
 
189 aa  76.3  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.155376  hitchhiker  0.00638708 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1441  Redoxin domain protein  31.09 
 
 
158 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.21 
 
 
187 aa  75.9  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1547  redoxin domain-containing protein  35.04 
 
 
155 aa  75.9  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0375508  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0403  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.78 
 
 
174 aa  75.9  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000117414  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0402  hypothetical protein  32.14 
 
 
178 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2724  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.59 
 
 
188 aa  75.1  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.32328  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2011  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.34 
 
 
378 aa  75.1  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0325  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.87 
 
 
189 aa  75.1  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0365546 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1890  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.67 
 
 
171 aa  74.7  0.0000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.326681  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1321  thioredoxin family protein  30.95 
 
 
168 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1959  redoxin domain-containing protein  31.13 
 
 
189 aa  73.6  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0329542  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3225  hypothetical protein  30.71 
 
 
178 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0643  resA domain-containing protein  30.71 
 
 
178 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.826532  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2819  hypothetical protein  30.71 
 
 
178 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0200  hypothetical protein  30.71 
 
 
178 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0479  putative thiol-disulfide oxidoreductase  30.71 
 
 
178 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0459  putative thiol-disulfide oxidoreductase  30.71 
 
 
178 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1393  hypothetical protein  30.71 
 
 
178 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1445  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.06 
 
 
182 aa  72.8  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0403  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.54 
 
 
174 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0521  Redoxin domain protein  32.14 
 
 
176 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.037804  normal  0.85402 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1648  thioredoxin family protein  30.28 
 
 
184 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000012411  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0399  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.65 
 
 
171 aa  72.8  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.689513  normal  0.928423 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1647  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.99 
 
 
184 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.227241  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1954  thioredoxin  28.33 
 
 
184 aa  72.4  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0228  redoxin domain-containing protein  32.35 
 
 
174 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.454071  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1779  thioredoxin family protein  30.28 
 
 
184 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.710861  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4484  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.44 
 
 
195 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.810998 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1818  redoxin domain-containing protein  26.83 
 
 
165 aa  72  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.165387  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1627  thioredoxin family protein  30.28 
 
 
184 aa  72  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000123929  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1597  thioredoxin family protein  30.28 
 
 
184 aa  72  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0109831  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5746  redoxin domain-containing protein  28.48 
 
 
188 aa  72  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.487229  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1829  thioredoxin family protein  30.28 
 
 
184 aa  72  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3381  redoxin domain-containing protein  29.41 
 
 
171 aa  72.4  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232312  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3043  thioredoxin family protein  27.95 
 
 
433 aa  72.4  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0023  redoxin domain-containing protein  29.41 
 
 
167 aa  72  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.239793  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1852  thioredoxin family protein  30.28 
 
 
184 aa  72  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.056942  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3240  redoxin domain-containing protein  27.81 
 
 
198 aa  71.6  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1904  thioredoxin family protein  30.28 
 
 
184 aa  71.6  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000368388  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2412  Redoxin domain protein  30.73 
 
 
167 aa  71.6  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0190  cytochrome c biogenesis protein, putative  35.79 
 
 
201 aa  71.6  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.648376  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0274  cytochrome c biogenesis protein, putative  35.79 
 
 
194 aa  71.6  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4194  putative thiol-disulfide isomerase and thioredoxins  30.66 
 
 
176 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.462178 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0184  thioredoxin family protein, putative  26.86 
 
 
171 aa  71.2  0.000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.148169 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0760  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.71 
 
 
228 aa  71.2  0.000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.173874 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0433  redoxin domain-containing protein  30.88 
 
 
179 aa  70.9  0.000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3231  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.17 
 
 
160 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0496837 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0475  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.33 
 
 
157 aa  70.9  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0330837 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0830  redoxin domain-containing protein  30.07 
 
 
329 aa  70.5  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1793  thioredoxin family protein  29.58 
 
 
184 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3551  thioredoxin family protein  29.37 
 
 
184 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3846  cytochrome c biogenesis protein CcmG  31.06 
 
 
180 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.971219  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5749  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.41 
 
 
380 aa  69.7  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.566272  normal  0.459715 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0399  thiol-disulfide oxidoreductase  24.29 
 
 
174 aa  70.1  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2869  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.27 
 
 
200 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>